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Genômica Prof. Msc. Andriu Catena - Biomédico Genômica Como entender o DNA? Como montar o quebra-cabeça genético? Genômica Subdivisão da genética de mapeamento, sequenciamento e análise do funcionamento de genomas inteiros (Thomas Roderick, 1986). Subdivisões 1) Estrutural 2) Funcional Visa a caracterização física do genoma. Caracterização do Transcriptoma (transcritos produzido). Caracterização do Proteoma (proteínas codificadas). OMICS OMICS OMICS O genoma é único O transcriptoma modifica-se espaço-temporalmente Quais genes estão ativos num determinado instante e condição? Como isso influencia a adaptação da célula ao meio? Proteoma Genômica Níveis crescentes de resolução Genômica Avalia a expressão gênica em organismos, tecidos ou células em diferentes situações fisiológicas ou patológica Analisa o nível de expressão de milhares de genes simultaneamente Necessita confirmação posterior (ex: qPCR). Análise da expressão gênica através de MicroArranjos de DNA Projeto Genoma Humano Projeto Genoma Humano Esforço internacional para o mapeamento do genoma humano: Identificação de todos os nucleotídeos. Projeto Genoma Humano 1990: Início do PGH; 5000 cientistas; 250 laboratórios; US$ 3 bilhões a US$ 53 bilhões; 1999: anunciado o 1º “rascunho”; 14 de abril de 2003: conclusão; 99,99% sequenciado; Sequenciamento 13 Sequenciamento – SNG (nova geração) 14 Projeto Genoma Humano Diagnóstico e Prevenção Projeto Genoma Humano Projeto Genoma Humano Biomarcadores Projeto Genoma Humano Doenças associadas Fibrose cística - CFTR Doenças associadas Fibrose cística Doenças associadas Fibrose cística Doenças associadas Deficiência de LCAT partículas constituídas por um núcleo lipídico hidrofóbico rodeado por lipídios anfipáticos ligados de forma não covalente a proteínas específicas denominadas apolipoproteínas As lipoproteínas plasmáticas são classificadas de acordo com a sua densidade, tamanho, composição, estrutura e função, sendo as principais: lipoproteína de muito baixa densidade (VLDL), lipoproteína de baixa densidade (LDL) e lipoproteína de alta densidade (HDL) (VON ZYCHLINSKI; KLEFFMANN, 2015). Essas moléculas desempenham um papel fundamental na regulação da síntese, absorção e efluxo do colesterol, lipídio indispensável para funcionamento e organização da membrana plasmática (WÜSTNER; SOLANKO, 2015) O papel do perfil lipídico como fator de risco às DCV tem sido muito estudado, com um consenso geral de que níveis elevados de HDL proporcionam um efeito cardioprotetor, ao passo que nível elevado LDL é aterogênico (HASHEMI NAZARI et al., 2015; MCQUEEN et al., 2008) 22 Doenças associadas Deficiência de LCAT A lecitina-colesterol aciltransferase (LCAT) desempenha papel crucial na maturação de HDL através da esterificação do colesterol, regulando o transporte reverso do colesterol (TRC) (DERGUNOV, 2012). No entanto, a expressão dessa enzima pode ser alterada devido a eventos que promovam a atividade inflamatória (FEISTER et al., 2002), como obesidade. Assim, a LCAT pode indicar, em conjunto com diversificadas proteínas intrínsecas ao funcionamento do TRC, o grau de agravamento das DCV (ROHATGI et al., 2014). 23 Doenças associadas Deficiência de LCAT xantoma 24 Doenças associadas Mutações intronicas são capazes de causar doenças? 25