Buscar

Estudo dirigido - Metabolismo

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Você viu 3, do total de 13 páginas

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Você viu 6, do total de 13 páginas

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Você viu 9, do total de 13 páginas

Faça como milhares de estudantes: teste grátis o Passei Direto

Esse e outros conteúdos desbloqueados

16 milhões de materiais de várias disciplinas

Impressão de materiais

Agora você pode testar o

Passei Direto grátis

Prévia do material em texto

INTRODUÇÃO AO METABOLISMO 
 
1.Descreva as diferenças entre organismos autotróficos e heterotróficos. 
 
2. Explique como o carbono contido no CO2 atmosférico pode fazer parte das 
moléculas de nosso organismo. 
 
3. Qual a função metabólica das coenzimas reduzidas (NADH e FADH2)? 
 
GLICÓLISE 
 
4. Qual a relação existente entre metabolismo anaeróbio e a produção de 
cerveja e fadiga e dor muscular? 
 
5. Descreva os três possíveis destinos do piruvato proveniente da glicólise. 
 
6. Qual a importância da regeneração do NAD+ para os microorganismos 
anaeróbios ? Qual a conexão bioquímica entre cárie dentária e metabolismo 
anaeróbio. Pg. 458 Campbell. 
 
7. Considerando o número de moléculas de ATP consumidas e formadas, 
estabelecer o saldo final de ATP na degradação de uma molécula de glicose 
pela via glicolítica. Quais as enzimas envolvidas no consumo e produção de 
ATP ? 
 
8. Explique a diferença entre o grupo A e B em relação a produção de lactato. 
 
A letra "A" representa o limiar aeróbio de uma pessoa que não treina, e a 
letra "B" o limiar de uma pessoa que treina, note que a carga máxima que 
uma pessoa que treina pode usar é bem maior do que aquela permitida para a 
pessoa que não treina. 
 
9. Quais as vitaminas e minerais necessários para a conversão de Glicose 
Lactato? 
 
10. É bem conhecido entre caçadores que carnes de animais que correram 
muito antes de morrer têm sabor ácido. Sugira a razão para essa observação. 
 
CICLO DE KREBS 
 
11. Quantos ATPs, NADH e FADH2 são formados com a oxidação de: 
a) glicose 
b) piruvato 
c) Acetil-CoA 
Na Glicólise e Ciclo de Krebs? 
 
12. Quais as etapas do ciclo do ácido cítrico que regulam o fluxo do ciclo? 
 
13. Quais as vantagens do metabolismo baseado no O2? 
 
14. O veneno 1080, usado por criadores de ovelhas é o composto fluoracetato 
de sódio. Os fazendeiros, visando proteger as suas ovelhas do ataque de 
coiotes, colocam o veneno além das cercas da fazenda, afetando os coiotes 
que morrem ao ingeri-lo. Qual é o mecanismo do envenenamento pelo dez 
oitenta? 
 
15. Quantas voltas no ciclo de Krebs são necessárias para transformar os 6 
carbonos da glicose em CO2? 
 
 
CADEIA DE TRANSPORTE DE ELÉTRONS E FOSFORILAÇÃO OXIDATIVA 
 
14. Indicar a localização celular da cadeia de transporte de elétrons. 
 
15. Citar 3 inibidores da cadeia de transporte de elétrons e quais as suas 
conseqüências 
 
16. Indicar o número de ATP sintetizados para cada NADH e FADH2 oxidados. 
 
17. Qual o destino final do par de elétrons transportados pela CTE? 
 
18. Como o Fluxo de H+ do espaço intermembrana para a matriz da 
mitocôndria, pode produzir ATP? 
 
METABOLISMO DOS LIPÍDEOS 
19. Qual a função do HDL? E do LDL? 
 
20. Quantos ATPs são produzidos com a oxidação completa até CO2 e H2O de 
um ácido graxo saturado contendo 12 carbonos? Justifique fazendo os 
cálculos. 
 
21 Qual a função da l-carnitina no transporte de lipídeos. 
22. Como são transportados os ácidos graxos livres no sangue? 
 
23. Qual a conseqüência metabólica para uma pessoa com deficiência dos 
receptores de LDL? 
 
Descreva a síntese e a degradação do glicogênio. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Exercícios de Metabolismo 
 
pH e Sistemas Tampão 
 
1. Definir ácido e base segundo Bronsted 
2. Caracterizar um sistema tampão e indicar os fatores que determinam sua 
eficiência 
3. Definir pka 
4. Dar exemplos de tampões biológicos 
Aminoácidos e Proteínas 
1. Escrever a fórmula de um aminoácido. Dar exemplos de: 
a. aminoácido com um grupo amino e dois grupos carboxílicos 
b. aminoácido com um grupo carboxílico e dois grupos aminos. 
2. Definir ponto isoelétrico (pI) de um aminoácido. 
3. Analisando o radical R, classificar os aminoácidos em polares e apolares. 
Entre os polares, citar aqueles que, em pH 7, apresentam radical com carga 
negativa (aminoácidos ácidos), carga positiva (aminoácidos básicos) e carga 
nula (polares sem carga). 
4. Esquematizar a ligação peptídica. 
5. Definir proteínas globulares e fibrosas. Citar exemplos. 
6. Definir estrutura primária. 
7. Descrever as estruturas regulares - alfa-hélice e conformação beta - que 
compõem a estrutura secundária das proteínas globulares. 
8. Definir estrutura terciária de proteínas globulares. Esquematizar os tipos de 
ligações que a mantêm, indicando os aminoácidos que participam dessas 
ligações. 
9. Definir estrutura quaternária de proteínas globulares. Citar exemplos de 
proteínas com estrutura quaternária. 
10. Verificar a posição dos radicais polares e apolares de uma proteína em 
solução aquosa. 
Enzimas 
 
1. Definir enzima, substrato e sítio ativo. 
2. Definir inibidor competitivo e não-competitivo. 
3. Caracterizar enzima alostérica. Definir centro alostérico e efetuador 
alostérico (positivo e negativo). 
4. Definir regulação enzimática por modificação covalente. 
5. Definir cofator. Dar exemplos de cofatores inorgânicos (ativadores metálicos) 
e orgânicos (coenzimas). 
6. Representar o grupo ativo de NAD+ e do FAD nas formas reduzida e 
oxidada. 
7. Definir vitaminas, relacionando sua função com atividade enzimática. 
Estrutura de carboidratos e lipídios 
 
1. Definir carboidrato, açúcar, monossacarídio e oligossacarídio e dar 
exemplos. 
2. Definir polissacarídio. Citar exemplos de polissacarídios estruturais e de 
reserva. 
3. Descrever a estrutura do glicogênio e indicar a porção da molécula que sofre 
alongamento ou encurtamento. 
4. Caracterizar estruturalmente os ácidos graxos mais comuns na natureza. 
5. Definir triacilglicerol. Descrever as vantagens para os seres vivos do 
armazenamento de trialcilgliceróis. 
6. Correlacionar a consistência das gorduras animais e óleos vegetais com a 
estrutura dos ácidos graxos componentes destas substâncias. 
7. Definir glicerofosfolipídio e esfingolipídio. 
8. Citar as funções do colesterol. 
9. Indicar a porção hidrofílica e a porção hidrofóbica dos diferentes tipos de 
lipídios anfipáticos. Mostrar em que fração celular são comumente encontrados 
os lipídios anfipáticos. 
10. Caracterizar as classes principais de lipoproteínas plasmáticas, indicando a 
sua função. 
Glicólise, formação de acetil-CoA e Ciclo de Krebs 
Responda utilizando apenas o mapa da glicólise. 
1. Quais os passos irreversíveis que aparecem no mapa? 
2. Quantas moléculas de piruvato se formam a partir de uma molécula de 
glicose? 
3. Que hexose dá origem a trioses? 
4. Indicar as reações de óxido-redução que aparecem no mapa. 
5. Identificar no mapa as reações catalisadas pelas seguintes enzimas: 
a) quinase b) mutase c) isomerase d) aldolase e) desidrogenase 
6. Considerando o número de moléculas de ATP consumidas e formadas, 
estabelecer o saldo final de ATP (balanço energético) na oxidação de uma 
molécula de glicose pela via glicolítica. 
7. Esquematizar as reações de fermentação alcoólica que possibilitam a 
obtenção de NAD+ na forma oxidada. Citar exemplos de tecidos ou organismos 
onde ocorrem fermentação lática e alcoólica. Em que condições o músculo 
oxida glicose a lactato? 
8. Escrever a reação de formação de acetil-CoA a partir de piruvato e indicar: 
a) as 5 coenzimas necessárias 
b) as vitaminas envolvidas 
9. Na oxidação de uma molécula de acetil-CoA no ciclo de Krebs, indicar a 
enzima que catalisa a reação onde há produção ou consumo de: 
a) CO2 - b) GTP - c) NADH - d) FADH2 - e) H2O 
Conversão de sacarídeos, Via das pentoses e Degradação de glicogênio 
 
1. Considerando o número de moléculas de ATP consumidas e formadas, 
estabelecer o saldo final de ATP (balanço energético) na oxidação de uma 
molécula de lactose pela via glicolítica. 
2. Esquematizar as duas reações de oxidação da via das pentoses, citando as 
enzimas e as coenzimas envolvidas nestas reações.3. Definir transaldolase e transcetolase, mostrando a coenzima envolvida. Citar 
exemplos de reações catalisadas por cada tipo de enzima. 
4. Citar a localização celular da via das pentoses. 
5. Mostrar a importância biológica da via das pentoses e citar compostos que 
apresentam ribose na sua molécula. 
6. Citar tecidos em que ocorre a via das pentoses. 
7. Desenhar as estruturas químicas de NADH e NADPH. 
8. Discutir os diferentes papeis de NADH e NADPH. 
9. Sugerir a razão pela qual a via das pentoses é muito mais ativa nos 
adipócitos (onde há alta síntese de ácidos graxos) do que no tecido muscular. 
10. Definir polissacarídio. Citar exemplos de polissacarídios estruturais e de 
reserva. 
11. Descrever a estrutura do glicogênio. 
12. Esquematizar as reações de degradação do glicogênio a glicose 1-fosfato. 
Cadeia de Transporte de Elétrons e Fosforilação oxidativa 
 
1. Citar os compostos que fazem parte da cadeia de transporte de elétrons. 
2. Esquematizar a seqüência dos compostos da cadeia de transporte de 
elétrons, indicando os transportadores de elétrons e os transportadores de 
prótons e elétrons. 
3. Citar a localização celular da cadeia de transporte de elétrons. 
4. Citar 3 inibidores da cadeia de transporte de elétrons, indicando os 
transportadores sobre os quais atuam. 
5. Definir fosforilação oxidativa. O que está sendo fosforilado? O que está 
sendo oxidado? 
6. Descrever a hipótese do acoplamento quimiosmótico para a fosforilação 
oxidativa. 
7. Indicar o número de ATP sintetizados para cada NADH e FADH2 oxidados. 
8. Citar exemplos de processos biológicos que utilizam ATP. 
9. Descrever a estrutura da ATP sintase (ou F1F0-ATPase). Descrever a 
função de cada uma das partes. Onde ela está localizada na mitocôndria? 
10. Definir desacoplador e citar um exemplo. 
11. Definir inibidor de fosforilação oxidativa e citar um exemplo. 
12. A membrana interna da mitocôndria é impermeável a ATP e NADH. 
Explicar: 
a. como o NADH produzido na via glicolítica pode ser oxidado na cadeia 
respiratória (lançadeiras do malato e de glicerol fosfato). 
b. como o ATP produzido na mitocôndria pode ser utilizado no citoplasma. 
Biossíntese de carboidratos 
 
1. Esquematizar as reações de síntese de glicogênio a partir de glicose. 
2. Citar a função do glicogênio hepático e do glicogênio muscular. 
3. Definir gliconeogênese e citar exemplos de compostos gliconeogênicos. 
Citar o tecido responsável pela gliconeogênese. 
4. Comparar as três reações irreversíveis da glicólise com as reações de 
gliconeogênese que as substituem, quanto a reagentes, produtos, enzimas e 
coenzimas. 
5. Indicar a localização celular das enzimas da via glicolítica e da 
gliconeogênese. 
6. Indicar o balanço energético da gliconeogênese se o composto inicial for: 
a. piruvato 
b. lactato 
c. galactose 
d. frutose 
Regulação do metabolismo de carboidratos 
 
1. Mostrar a relação entre AMP cíclico e a síntese de glicogênio. 
2. Citar os hormônios que estimulam a degradação do glicogênio no fígado e 
no músculo e mostrar seu modo de ação. 
3. Esquematizar as reações catalisadas por adenilato ciclase e fosfodiesterase. 
4. Mostrar a relação do AMP cíclico com a degradação do glicogênio a glicose 
1-fosfato. 
5. Esquematizar as reações de conversão de glicose 1-fosfato a glicose. Citar o 
tecido onde essas reações ocorrem. 
6. Descrever o efeito do glucagon sobre a atividade da fosfofrutoquinase 2 e 
mostrar a conseqüência deste efeito sobre a atividade da via glicolítica. 
7. Fazer um resumo dos efeitos do glucagon, adrenalina e insulina no 
metabolismo de carboidratos no fígado, musculo e adiposo. 
8. Descrever as alterações do metabolismo de carboidratos provocadas por 
jejum prolongado e por diabetes. 
Metabolismo de ácidos graxos 
 
1. Como os ácidos graxos são transportados no organismo? Como e aonde se 
dá a ativação do ácido graxo? 
2. O que é beta-oxidação? 
3. Considerando 1 volta da beta oxidação, qual o produto formado? 
4. Compare em rendimento energético, a degradação total de1 mol de um 
ácido graxo com 18 carbonos e 3 moles de glicose. 
5. Localize a degradação de um ácido graxo dentro da célula. 
6. O que são corpos cetônicos? Forneça local de produção, de utilização e 
como são utilizados. Em que condições são formados ? 
7. Como a degradação do ácido graxo é regulada? 
8. Compare a •-oxidação, com a biossíntese do acído decanóico (C10) quanto 
aos seguintes aspectos. Responda na forma de tabela. 
a. Composto de partida 
b. Localização intracelular das enzimas que catalizam as reações de ambos os 
processos. 
c. Coenzimas de óxido-redução utilizadas. 
d. Carregador de grupo acila 
e. Forma em que as unidades de carbonos são removidas ou adicionadas. 
f. Saldo de ATP (considere a oxidação até CO2 e H2O) 
g. Valor alto da relação ATP/ADP como determinante da ocorrência de uma ou 
outra. 
h. dem valor baixo da relação ATP/ADP. 
Metabolismo de aminoácidos 
 
1. Como se forma a ureia? De onde vêm os nitrogênios? Qual o órgão 
envolvido na síntese da uréia? 
2. Qual a fonte de carbono da uréia? Como se forma? 
3. Forneça a reação de transaminação. Qual a vitamina envolvida? Quais os 
aminoácidos que não sofrem transaminação? 
4. O que são aminoácidos cetogênicos e glicogênicos? Cite 3 exemplos de 
cada. 
De maneira geral, qual o destino dos carbonos e do nitrogênio dos 
aminoácidos? 
Alanina está sendo sintetizada a partir de seus precursores metabólicos.Com 
os compostos abaixo faça uma tabela com duas colunas.A primeira coluna,com 
os compostos que são precursores e a segunda, com os compostos que não 
são precursores da alanina: 
- fosfoenol piruvato - glicogênio 
- acetil CoA - carbamoil fosfato 
- glicose - gliceraldeído-3-fosfato 
- malato - malonil CoA 
- Ácido palmítico - acetoacetato 
 
Integração de metabolismo 
 
1. Como se dá a regulação do metabolismo de glicogênio por adrenalina? 
Forneça as principais etapas. Explique. Compare o produto final no fígado e no 
músculo. 
2. Qual o papel do citrato na regulação do metabolismo de carboidratos e 
lipídios? Justifique. 
3. Considere o metabolismo básico estudado. O que acontece com o 
metabolismo de lipídios, carboidratos e proteínas após um jejum prolongado? 
Justifique fornecendo as enzimas e os controles adequados sobre as vias. 
4. Considere o metabolismo básico estudado. O que acontece com o 
metabolismo de lipídios, carboidratos e proteínas após uma refeição rica em 
proteínas? Justifique fornecendo as enzimas e os controles adequados sobre 
as vias. 
5. Abaixo é feita uma série de afirmações referentes a um indivíduo em jejum 
há dois dias. Considere que o glicogênio hepático está esgotado.Todas as 
afirmações se referem ao hepatócito.Quando não, no texto é chamada atenção 
para isto.Preencha a tabela apresentada em seguida as dez primeiras 
afirmações, agrupando na coluna da esquerda as letras das afirmações que se 
aplicam e na coluna da direita as letras das afirmações que não se aplicam a 
situação fisiológica do jejum. 
a. A produção de uréia é baixa 
b. Verifica-se baixa produção de NADPH, ou mesmo não se verifica. 
c. A glicogênio sintetase está na sua forma defosforilada, isto é ativa. 
d. Glicose-6-fosfatase encontra-se em atividade, isto é produzindo glicose livre. 
e. Acetil Côa proveniente da intensa beta-oxidação dos ácidos graxos está 
sendo utilizada na síntese de corpos cetônicos. 
f. No citossol não se encontra malonil Coa. 
g. Verifica-se níveis altos de insulina plasmática. 
h. Verifica-se metabolização de glicose-6-fosfato pela glicólise. 
i. Está ocorrendo intensa beta-oxidação de ácidos graxos de tal forma que não 
há oxalacetato suficiente para colocar não ciclo de Krebs o produto desta beta-
oxidação. 
j. A glicose-6-fosfato no citossol é utilizada na síntese de glicogênio. 
Exercícios de Biologia Molecular 
 
Estrutura e Função dosÁcidos Nucleicos 
 
1. Quais as diferenças de composição e estrutura entre RNA e DNA. Como se 
distingue entre a uracila e a timina, e entre a ribose e a desoxirribose. 
2. Escreva a estrutura da 5' - desoxiadenosina trifosfato (dATP). Especifique o 
tipo de ligação entre: (a) a base nitrogenada e o açúcar; (b) o açúcar e o 
fosfato; (c) os fosfatos ±,  e Ž . 
3. Escreva a sequência de bases da fita complementar do DNA dupla fita que 
apresenta uma fita com a sequência: 
(5') ATGCCGTATGCATTGCATTC (3') 
Exprima, em porcentagem, a composição de bases do DNA de fita dupla. 
4. Como são chamadas as ligações covalentes que unem dois nucleotídeos 
consecutivos nas moléculas de ácidos nucleicos? Esquematize estas ligações. 
5. RNA é facilmente hidrolizado por álcali, enquanto DNA não é. Por que? 
6. Explique por que os ácidos nucleicos são desnaturados quando submetidos 
a alta temperatura ou pHs extremos? Como estas moléculas podem ser 
renaturadas? 
7. Defina Temperatura de fusão (Tm) e efeito hipercrômico. 
8. O valor de Tm para o DNA pode ser calculado usando-se a fórmula : 
Tm = 69,3 + 0,41(%GC), onde GC é a porcentagem de Guanina + Citosina 
a. DNA de E. coli contém 50% GC. Calcular o Tm para o DNA desta bactéria. 
b. As curvas de fusão da maioria dos DNAs que ocorrem naturalmente revelam 
que o Tm é normalmente maior do que 65oC. Por que isto é importante para a 
maioria dos organismos? 
c. Como varia o Tm com a força iônica da solução? 
d. O que acontece com Tm quando se adiciona etanol à solução de DNA? 
9. Quais as principais características da dupla-hélice de DNA de acordo com o 
modelo proposto por Watson e Crick? 
10. Descreva os principais experimentos que indicaram que o DNA é o material 
genético. 
11. O que são topoisomerases? 
12. O núcleo de uma célula humana tem 6ºm de diâmetro e a extensão total do 
DNA dos seus 46 cromossomos soma 1,8m. Como é resolvida a discrepância 
entre estas duas grandezas? 
13. Esquematize a estrutura do nucleossomo. Qual a característica bioquímica 
principal das histonas e qual o seu papel na organização da cromatina? 
Código Genético e estrutura gênica 
 
1. Baseando-se na lista de códons e amino ácidos abaixo, quais das seguintes 
afirmações são corretas? 
AGU = serina AGC = serina 
AAU = asparagina AAC = asparagina 
AUG = metionina AUA = isoleucina 
a. o código genético é degenerado 
b. a alteração de um único nucleotídeo no DNA que dirige a síntese destes 
códons poderia levar à substituição de uma serina por uma asparagina no 
polipeptídeo. 
c. a alteração de um único nucleotídeo no DNA que dirige a síntese destes 
códons necessariamente levaria à substituição de um aminoácido no 
polipeptídeo codificado. 
d. um tRNA com o anticódon ACU se ligaria a um ribossomo na presença de 
um destes códons. 
2. Uma globina de 146 aminoácidos sofreu uma mutação no códon 
correspondente ao sexto aminoácido da cadeia. A análise do DNA indicou uma 
mudança de (5')TTC(3') para (5')TAC(3') na fita molde. Pergunta-se : 
a. A mutação provocou a troca de um aminoácido por outro? Em caso 
afirmativo, qual é este aminoácido? 
b. Quais as implicações para a estrutura da proteína? 
c. Qual seria o resultado se a mesma troca ocorresse na base do lado (5') do 
DNA? 
3. Uma fita de um fragmento de DNA isolado de E. coli tem a seguinte 
sequência 
5'...AGGTTACCTAGTTGC...3' 
Suponha que um mRNA seja transcrito a partir deste DNA usando a fita 
complementar como molde. Qual será a seqüência deste mRNA? O que você 
pode dizer sobre a capacidade de formação de um híbrido RNA-DNA? 
4. Qual é a sequência do polipeptídeo que seria codificado pelo mRNA 
sintetizado na 
questão 3. Assuma que o quadro de leitura começa com o primeiro 
nucleotídeo. 
5. Desenhe a estrutura de um gene de procarioto com seus principais 
elementos. 
6. Desenhe a estrutura de um gene de eucarioto com os seus principais 
elementos. 
7. Defina RNA poli-cistrônico e mono-cistrônico. 
Replicação/ Mutação e Reparo de DNA 
 
1. Combine as propriedades ou funções na coluna à direita com a DNA 
polimerase na coluna da esquerda: 
(a) DNA polimerase I (1) envolvida na replicação 
(b) DNA polimerase II (2) requer um iniciador e um molde 
(c) DNA polimerase III (3) envolvida no reparo de DNA 
(4) sintetiza a maior parte do DNA durante a replicação 
(5) remove o iniciador e preenche as lacunas durante a replicação 
2. O fragmento de DNA no esquema abaixo é de fita dupla em ambas as 
extremidades porém de fita simples no meio. A polaridade da fita superior está 
indicada. 
5'__________________________3' 
__________P HO_________ 
a. O fosfato (P) indicado na fita inferior está na extremidade 5' ou 3' do 
fragmento ao qual ele pertence ? (Indique no esquema). 
b. Como você esperaria que a lacuna fosse preenchida pelos processos de 
reparo do DNA "in vivo" ? 
c. Quantos fragmentos você esperaria encontrar na fita inferior se o 
experimento fosse realizado "in vitro", na presença de todos os 
desoxirribonucleotídeos-trifosfato e DNA polimerase? 
3. Qual a atividade da DNA polimerase III que é responsável pela editoração 
durante a replicação ? 
4. Que propriedades do DNA e da DNA polimerase sugerem que a duas fitas 
não podem ser replicadas pelo crescimento no mesmo sentido (como mostra a 
figura abaixo)? Como a célula supera o problema? Esquematize a formação da 
ligação fosfodiester durante a replicação a partir do nucleotídeo trifosfato livre 
mostrando o grupo fosfato que é incorporado. 
 
5. Descreva brevemente as 3 etapas de reparo por excisão do DNA lesado por 
luz UV e as enzimas nelas envolvidas. 
6. Como a maquinaria de reparo de E. coli identifica a fita de DNA que tem um 
nucleotídeo não complementar incorporado durante a replicação? 
7. Visto que U pareia com A tão bem quanto T pareia com A, por que somente 
T é encontrado no DNA? Esquematize o sistema que repara a substituição C 
por U. 
Transcrição e Processamento de RNA 
 
1. Dê a composição de subunidades da holoenzima e do cerne da RNA 
polimerase de E. coli, atribuindo funções às subunidades. 
2. As DNA polimerases necessitam de um iniciador, ao qual se liga um novo 
nucleotídeo para o crescimento da cadeia polinucleotídica. É necessário um 
iniciador para a ação da RNA polimerase? 
3. Que subunidades da RNA polimerase bacteriana são necessárias para a 
iniciação da transcrição a partir de um promotor? E para a terminação da 
transcrição? Explique como uma mutação poderia dar origem a uma E. coli 
resistente ao antibiótico rifamicina. 
4. Uma pequena cadeia de RNA sintetizado in vitro tem a seguinte seqüência: 
5'- AUGUACCGAAGUGGUUU - 3' 
a. Coloque os grupos fosfato e um asterisco naqueles que serão radiativos 
quando a transcrição for feita na presença de [g 32P]-ATP 
b. Faça o mesmo para [a 32P]-UTP 
5. Defina "promotor", enumere as suas propriedades e diga como podem ser 
localizados através da técnica de "footprinting". 
6. A sequência de um segmento de uma molécula. de DNA duplex é: 
(a) 5'-ATCGCTTGTACGGA-3' 
(b) 3'-TAGCGAACATGCCT-5' 
Quando este segmento serve de molde para a RNA polimerase de E. coli ele 
dá origem a um segmento de RNA com a seguinte sequência: 
(c) 5'-UCCGUACAAGCGAU-3'. 
Indique: 
a. a fita codificadora; 
b. a fita senso; 
c. a fita molde; 
7. Quais as principais características das sequências de promotores de genes 
eucarióticos transcritos em mRNAs? Qual a função dos fatores de transcrição e 
"enhancers"? 
8. Em que consiste o terminal 5' cap do mRNA e qual o seu papel ? Qual a 
característica do terminal 3' encontrado na maioria dos mRNAs de eucariotos e 
como eles são formados ? 
9. Genes de eucariotos são geralmente constituídos de introns e exons. Estas 
seqüências são tanto transcritas como traduzidas? A remoção dos íntrons 
(splicing) tem que ser um processo extremamente preciso. Por que? Dê um 
exemplo de "splicing" aberranteque leva a um tipo de talassemia em humanos. 
10. Suponha que o DNA humano é clivado em fragmentos do tamanho 
aproximado de um mRNA humano maduro e que então são preparados 
híbridos RNA-DNA. O mesmo procedimento é repetido com E. coli. Quando os 
híbridos RNA-DNA de cada espécie são examinados ao microscópio eletrônico, 
qual deles mostra o maior grau de hibridização? Explique e faça um esquema. 
11. O mRNA monocistrônico de eucariotos geralmente representa o transcrito 
primário? E o mRNA dos procariotos? Explique. Faça uma comparação, 
indicando as principais diferenças encontradas em eucariotos entre um gene, 
seu transcrito primário e o mRNA maduro que deixa o núcleo para a tradução 
no citoplasma. 
Síntese de Proteínas 
 
1. Escreva os produtos finais das seguintes reações: 
a. valina + ATP + tRNAVal + valil-tRNA sintetase . 
b. valina + ATP + tRNAIle + isoleucil-tRNA sintetase . 
2. Em um experimento verificou-se que Cys-tRNACys pode ser convertido a 
Ala-tRNACys e usado num sistema in vitro de síntese de proteínas. 
a. Se o Ala-tRNACys for marcado com 14C no aminoácido, a alanina marcada 
seria incorporada na proteína sintetizada no lugar de outros resíduos Ala ? 
Explique. 
b. O que o experimento indica sobre a importância da precisão da reação da 
aminoacil-tRNA sintetase em relação ao processo global da síntese protéica ? 
3. De acordo com o princípio de oscilação no pareamento de bases ("wobble"), 
qual o número mínimo de tRNAs necessário para decodificar os seis códons de 
leucina - UUA, UUG, CUU, CUC, CUA e CUG ? Explique. 
4. Em procariotos, a maioria da cadeias polipeptídicas são iniciadas com o 
aminoácido ______, cujo códon é ______. 
5. Num sistema de síntese de proteínas in vitro, que permita o início e término 
da síntese em qualquer sequência de RNA, que peptídeo seria produzido pelo 
poli-ribonucleotídeo 
5'-UUUGUUUUUGUU-3' ? Indique qual o aminoácido N-terminal e o C-terminal 
do polipeptídeo obtido. 
6. O códon AUG funciona tanto para iniciar uma cadeia polipeptídica quanto 
para dirigir a incorporação de uma metionina em posições internas de uma 
proteína. Quais os mecanismos de seleção do códon AUG para a iniciação da 
tradução em procariotos ? 
7. Para cada uma das etapas da tradução, descritas abaixo, dê o nucleotídeo 
trifosfato envolvido como cofator e o número de ligações fosfato de alta energia 
consumidas. 
a. Ativação do aminoácido 
b. Formação do complexo de iniciação 70S (procariotos) ou 80S (eucariotos) 
c. Entrada do aminoacil-tRNA no ribossomo 
d. Formação da ligação peptídica 
e.Translocação 
8. Os três códons de terminação são ______, _______ e ______. 
9. Considere a seguinte sequência de um fragmento de DNA isolado de 
bactéria: 
5' 
CTGATAAGGGATTTAAATTATGTGTCAATCACGAATGCTAATCGCTTAACAC
TTC 3' 
Assumindo que esta sequência corresponde a sequência da fita codificadora, 
qual seria a sequência de aminoácidos do polipeptídeo produzido quando um 
mRNA transcrito deste gene for traduzido? Que características na sequência 
do mRNA determinam qual é o códon iniciador? Considere a primeira base 
como o início da transcrição.

Materiais relacionados

Perguntas relacionadas

Materiais recentes

Perguntas Recentes