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Organização Gênica de Procariotos UNIVERSIDADE FEDERAL DE PELOTAS CENTRO DE BIOTECNOLOGIA DISCIPLINA DE BIOLOGIA MOLECULAR Karine Begnini PROCARIOTO Organismos unicelulares que têm como característica principal a ausência de núcleo individualizado Witaker, 1969 5 reinos Morfologia e Fisiologia Woese, 1977 RNA ribossomal RNA transportador Constituição da membrana lipídica Sensibilidade a antibióticos ARCHAEA x BACTERIA X Bactérias ‘verdadeiras’, com parede celular ARCHAEA x BACTERIA ARCHAEA x BACTERIA Mais primitivas – 4 bilhões anos Habitam ambientes hostis Halófitas Acidúricas Metanogênicas Extremófilas Termophylus aquaticus – Taq DNA Polimerase Pyrococcus furiosus – Pfu DNA Polimerase O Gene Procariótico Sequência nucleotídica necessária e suficiente para a síntese de um polipeptídio ou de uma molécula de RNA estável. Gene DNA DNA RNA Proteína Replicação Transcrição Tradução Trasncrição Reversa Gene Promotor: sítio de ligação da RNA Polimerase. Terminador: sequência nucleotídica que determina o desligamento da RNA Polimerase da fita molde e o término da transcrição RBS: sítio de ligação do ribossomo UTR: regiões 5’ e 3’ não traduzidas (untranslated region) Promotor TerminadorRegião Codificadora 5’ 3’ 5’ Fita Molde Fita Codificadora 3’ RNA transcrito: Complementar a fita molde igual a fita codificadora Características do Gene Procarioto Equivalência exata entre a sequência nucleotídica do gene (DNA) e a sequência de AAs da proteína Promotor Regiões Codificadoras Terminador Unidades funcionais do genoma procarioto, nas quais dois ou mais genes que codificam proteínas com funções relacionadas ocupam posições adjacentes e estão sob controle de uma única região reguladora cístron cístroncístron Operador RNA Policistrônico Otimização da maquinaria reguladora da célula expressão coordenada e economia de espaço no genoma 30% de identidade ao longo de 60% de sua seqüência Quanto maior o nº de genes ortólogos presentes em genomas de espécies diferentes, maior o grau de parentesco entre elas na escala evolutiva Genomas Procarióticos GENOMAS PROCARIÓTICOS Genoma: conjunto de genes de um organismo toda informação genética armazenada no DNA de uma célula Cromossomo único DNA fita dupla fechada Replicon – autoduplicação! Haplóides – mutações! Coorientação da Transcrição e Tradução Co-orientação da Transcrição e Tradução Rapidez e eficiência Evita colisões entre aparatos! GenBank – www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes The Institute for Genomic Research – www.tigr.org Características do Genoma Procariótico Estrutura compacta e quase exclusivamente dedicada à codificação de proteínas – praticamente todo DNA tem função codificadora/reguladora Conteúdo gênico mínimo: número de genes mínimo, necessário e suficiente, para sustentar a existência de uma célula (256 genes) Uma cópia de cada gene! Redundância ausente Sobreposição de genes Sobreposição de genes Tipo de organização gênica que permite que a mesma sequência codifique duas proteínas diferentes, não necessariamente homólogas entre si. Genomas Virais! Sobreposição Bactérias: sobreposição de poucos pares de bases de genes adjacentes e presente no mesmo operon. Promotores de genes também podem se localizar na região codificadora de um gene antecedente. Características do Genoma Procariótico Tipo de organização gênica que permite que a mesma sequência codifique duas proteínas diferentes, não necessariamente homólogas entre si. São unidades genéticas acessórias e extracromossomais, que codificam para proteínas não essenciais. Bacteriófagos Plasmídeos Transposons Variabilidade e plasticidade aos genomas bacterianos!! ... - 1940 O GENOMA DE E.coli K-12 - Eubacteria Seqüenciado em 1997; 4.639.221 pb 4.300 genes ou ORFs, o que corresponde a 87% do genoma 11,7% do genoma corresponde a regiões intergênicas ou sequências reguladoras 10 tipos de Sequências de Inserção (IS) diferentes ao longo do genoma (2-11 cópias) Genes e operons mais ativos concentrados em regiões próximas à oriC ORF Open Reading Frame – Fase de leitura aberta (sequência nucleotídica que potencialmente pode ser traduzida para uma proteína – série de códons codificadores para Aas não interrompidos por códons de terminação) O GENOMA DE Metanococcus jannaschii- Archeae Isolada de solo da base de vulcão (temperatura de 48 a 94°C) Primeira arqueobactéria a ser sequenciada – em 1996; Genoma constituído de 3 elementos 1.738 ORFs, sendo 1.682 no cromossomo Características semelhantes às de eucariotos: presença de íntros e de genes que codificam HISTONAS. 1.664.976 pb 58.407 pb 16.550 pb 56% do genoma não tem homologia com eucariotos e nem bactérias! Elementos Genéticos Móveis Tamanho: 1 a 1000 kb Auto-replicativos - replicons Sem forma extracelular PLASMÍDEOS CLASSIFICAÇÃO Número de cópias Multicópia Até centenas de cópias por célula bacteriana Cópia Única Apenas uma cópia por célula (menos de 10 cópias) Número médio de moléculas de um plasmídeo/célula determinado pela sua região ori Segregação Plasmidial Sistema de Partição: sistema de regulação da segregação dos plasmídeos durante a divisão celular Sítios par R E P L IC A T IV O IN T E G R A T IV O Epissomos CLASSIFICAÇÃO Repertório de Hospedeiros Transmissíveis Se mantém em um determinado grupo taxonômico de bactérias, mas são capazes de se auto-duplicar em outras Hospedeiro restrito Capazes de se replicar apenas em poucas espécies bacterianas relacionadas entre si. Hospedeiros amplos Podem ser encontrados em uma variedade grande de bactérias não relacionadas CLASSIFICAÇÃO Fenótipo conferido pelo plasmídeo Genes de virulência – toxinas e adesinas Bacteriocinas – proteínas que inibem ou matam bactérias de espécies relacionadas ou outras linhagens da mesma espécie Resistência a antibióticos – codificam proteínas que degradam ou inativam classes de atbs; ou que alteram a permeabilidade da célula ao composto Transferência – capacidade de dirigir sua transferência de uma célula para outra (plasmídeos CONJUGATIVOS) Conjugação entre cepas Hfr e F- PLASMÍDEOS CONJUGATIVOS Plasmídeo F Conjugação entre cepas F+ e F- Hfr = High Frequency of Recombination (plasmídeo conjugativo inserido no cromossomo) Conjugação entre cepas F+ e F- BACTERIÓFAGOS Vírus que infectam bactérias; RNA, DNA simples circular ou DNA duplo linear; Utilizados como vetor para clonar fragmentos de 9kb a 25 kb 2 tipos: • Virulentos (ciclo lítico): infecção, replicação e liberação das partículas virais após lise celular •Temperados (ciclo lisogênico): integração do fago ao cromossomo da célula hospedeira (pró-fago) Transdução TRANSPOSONS São segmentos lineares de DNA capazes de mudar de posição dentro do genoma. Possuem seqüências similares em ambas extremidades (repetições terminais, geralmente invertidas) Carregam genes que codificam enzimas capazes de transportá-lo Geram duplicação do sítio de inserção no DNA alvo TIPOS DE TRANSPOSONS Seqüência de Insersão (IS) – Transposon simples que codifica apenas para a transposase Transposon complexo – Contém outros genes além dos genes responsáveis pela trasposição OBRIGADA! karibegnini@gmail.com
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