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UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ CENTRO DE CIÊNCIAS DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR DISCIPLINA: BIOQUÍMICA GERAL Estudo dirigido - Estrutura tridimensional de proteínas 1. Nomeie quatro fatores (ligações e forças) que contribuem para estabilizar a estrutura nativa de uma proteína, e descreva uma condição ou reagente que interfere com cada um desses tipos de estabilização. 2. Como pode mudanças no pH alterar a conformação de uma proteína? 3. Quando um polipeptídio está em sua forma nativa existem interações fracas entre os seus grupos R. Contudo, quando ele é desnaturado há interações similares entre os grupos proteicos e a água. O que contribui para a grande estabilidade da conformação nativa das proteínas? 4. Pauling e Corey mostraram em pequenos peptídeos, com seis átomos associados com ligações peptídicas estão todos em um mesmo plano. Desenhe uma dipeptídeo com dois aminoácidos (cadeias laterais podem ser demonstradas como –R), e indique como seis átomos fazem parte de uma estrutura planar em uma ligação peptídica. 5. Desenhe duas ligações de hidrogênio tipicamente encontradas entre dois resíduos de aminoácidos em uma hélice alfa 6. Descreva três características importantes da hélice alfa de um polipeptídio descrito por Pauling e Corey. Escreva uma ou duas frases para cada característica. 7. Descreva três importantes características da folha beta de um polipeptídio. Escreva uma ou duas frases para cada característica. 8. O que é tipicamente encontrado no interior de uma proteína globular solúvel na água? 9. Explique o que significa o motivo de uma estrutura proteica. 10. Cada um dos seguintes reagentes ou condições irão desnaturar uma proteína. Para cada uma descreva em duas frases ou menos o que o reagente/condição faz para destruir a estrutura da proteína. (a) Ureia (b) Alta temperatura (c) Detergente como o SDS (d) Baixo pH 11. Uma dada proteína é caracterizada por uma sequência de aminoácidos (estrutura primária) e uma estrutura tridimensional (estrutura terciária). Como essas estruturas são relacionadas?
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