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SDE0010 – GENÉTICA Aula 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Conteúdo desta aula DESCOBERTA DO CÓDIGO GENÉTICO 1 CONTROLE DA EXPRESSÃO GÊNICA 3 PRÓXIMOS PASSOS O CÓDIGO GENÉTICO E TRADUÇÃO 2 MUTAÇÃO 4 MECANISMOS DE REPARO 5 Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Descoberta do código genético O código genético foi desvendado por Marshall Nirenberg e Heinrich Matthaei, no início da década de 1960, por meio de experimentos com uso de células bacterianas que eram rompidas (lisadas), mas que mantinham capacidade de produzir proteínas quando adicionava-se RNA. Com este modelo, foi possível estudar tanto a transcrição como a síntese proteica. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Descoberta do código genético Assim, cientistas identificaram que a combinação de três nucleotídeos, denominada códon, determinava a incorporação de cada aminoácido na síntese proteica, portanto, a unidade do código genético passou a conter três nucleotídeos. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação O código genético e tradução O código genético é expresso como códons no DNA ou no RNA. Códons no RNA estão presentes no RNAm e vão levar à incorporação de aminoácidos de forma específica na síntese de proteínas (tradução). Como o RNAm adquire sua sequência de nucleotídeos por transcrição do gene (no DNA), há correspondência entre o gene e a sequência de aminoácidos na proteína. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação O código genético e tradução É possível relacionar cada códon no DNA (dentro de um gene) ou cada códon do RNA, com o aminoácido que constituirá uma determinada proteína. Na tabela, a coluna da esquerda corresponde ao primeiro nucleotídeo do códon, as colunas do meio correspondem ao segundo nucleotídeo, e a última coluna contém o terceiro nucleotídeo. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação O código genético e tradução O dogma central da genética é o modo unilateral que a informação contida no DNA é transcrita em um RNA para depois ser traduzida em proteína (DNA → RNA→ Proteína). A tradução, portanto, é o processo no qual a informação contida no RNAm é traduzida em uma sequência de aminoácidos. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação O código genético e tradução Os ribossomos têm duas subunidades: uma menor que faz ligação com o RNAm, na extremidade 5’ onde há uma sequencia “cap” e, outra subunidade maior, com sítios que podem ligar aos RNAt. Cada RNAt transporta um aminoácido e possui, em sua estrutura, uma trinca de nucleotídeos utilizada para o pareamento com o códon no RNAm. Esta sequência é chamada de anticódon. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Genética O código genético e tradução Após ligação do ribossomo na extremidade 5’ que possui a “cap”, ocorre leitura de toda a sequência da região não traduzida (UTR) até atingir o códon de iniciação AUG. A partir daí ocorre tradução de toda região central do RNAm através de uma enzima presente na subunidade maior e que realiza a ligação peptídica entre os aminoácidos. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação O código genético e tradução O RNAt que traz o aminoácido, após liberá-lo, volta ao citoplasma para se unir a outro aminoácido. O ribossomo vai percorrendo o RNAm provocando a ligação entre os aminoácidos até atingir um códon de finalização. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação O código genético e tradução Para genes nucleares, há três sequências de finalização: UAA (chamada de ocre), UAG (âmbar) e UGA (opala). Quando o ribossomo atinge o códon de finalização, um fator de liberação faz o polipeptídio desligar do ribossomo. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação O código genético e tradução Após a síntese, o polipeptídio será processado, incluindo clivagem e modificações em cada extremidade da molécula. Ao final, o polipeptídio portará um grupo aminoácido livre em uma extremidade (N-terminal) e um grupo carboxila na outra extremidade (C-terminal). Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Controle da expressão gênica As células estão frequentemente respondendo a mudanças no ambiente e aos sinais de outras células, alterando as taxas de sínteses de determinados tipos de proteínas. A regulação destas respostas geralmente é controlada no nível transcricional. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Controle da expressão gênica Em eucariotos multicelulares, o controle da atividade gênica comumente envolve um balanço entre ativadores e repressores. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Controle da expressão gênica Hormônios podem tanto ativar como inibir determinados genes, como os hormônios esteroides, que penetram nas células e ligam-se a receptores específicos, inibindo a transcrição de genes. Há múltiplas proteínas que se ligam a sequências específicas do DNA, conhecidas como regiões de controle da transcrição, próximas, ou não, da região promotora. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Controle da expressão gênica Entre os ativadores, temos ainda as sequências chamadas de amplificadoras, que ativam a transcrição, e quanto às sequências repressoras, há as silenciadoras, que desativam a expressão. Além do TATA box como promotor, há determinadas sequências que funcionam como um promotor alternativo, chamado iniciador. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mutação Mutações gênicas são mudanças repentinas que podem ocorrer nos genes durante a duplicação do DNA ou na transcrição. Há mutações que acontecem em sequências fora das regiões codificantes, como as regiões promotoras e sítios de poliadenilação. Assim, elementos reguladores, ao sofrerem mutações, afetarão a expressão do gene. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mutação Mutações acontecem por adição ou subtração de bases, causando mudança nos códons. Também ocorre por substituição de bases que, dentro da região codificante no gene, leva à troca de aminoácido codificado, ou ainda, pode criar um códon de parada. A substituição fora das regiões codificantes levar a redução da taxa de síntese da proteína. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mutação Há agentes mutagênicos de natureza física, como temperatura e radiações (raios X, alfa, beta e gama), e também os de natureza química como o Ácido Nitroso e a Hidroxilamina. As mutações podem ser revertidas, mas as taxas de mutações espontâneas são cerca de 10 vezes maior que as de retromutação (revertidas). Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mutação Como as mutações são recorrentes ou se repetem tanto no tempo como no espaço, podemos associá-las a determinadas taxas de forma generalizada. A mutação pode ser hereditária quando atinge uma estrutura gamética ou qualquer órgão que venha contribuir para a formação da geração descendente.Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mecanismos de reparo Mismatch repair: Repara maus pareamentos de bases do DNA gerados por erros de replicação. Este reparo é direcionado por metilação de sequências GATC na fita sintetizada. Se apenas uma das fitas não é metilada, uma endonuclease cliva essa fita na porção 5' do G no GATC. Após clivagem, a fita é degradada do sítio de clivagem até a região mal pareada, para que haja nova replicação. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mecanismos de reparo Reparo por excisão de bases: Esse processo é conduzido pelas enzimas DNA glicosilases que reconhecem os produtos de citosina e adenina desaminadas (um tipo de lesão frequente). As bases lesadas são removidas da cadeia do DNA pela quebra da ligação N-glicosil, a qual mantém a base nitrogenada associada com o esqueleto de açúcar-fosfato. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mecanismos de reparo Reparo por excisão de nucleotídeos: As enzimas-chave desse mecanismo formam um complexo chamado endonuclease de excisão ABC. Após ligação no local da lesão causada por agente mutagênico, o complexo ABC cliva a fita antes e depois da lesão. Por fim, o segmento é reparado pela ação de uma polimerase (DNA polimerase I). Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mecanismos de reparo Reparo direto: As lesões mais comuns induzidas pela radiação UV são o ciclobutano pirimidina e o fotoproduto (6-4)-pirimidina-pirimidona. Estas lesões podem ser reparadas com a enzima DNA fotoliase, que usa a energia derivada da luz visível (320-500 nm) para remover estas lesões diretamente, sem que haja excisão. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mecanismos de reparo Reparo por recombinação: Se, durante a replicação cromossômica, surge lesão na forquilha de replicação antes da ação do reparo por excisão ou da ação do sistema de fotoliase (ou depois que tudo foi tentado e a lesão permaneceu), a DNA polimerase para a replicação e retomar o processo vários pares de base adiante. A lesão então é reparada por recombinação. Genética AULA 6: EXPRESSÃO GÊNICA E MUTAÇÃO Expressão Gênica e Mutação Mecanismos de reparo Há diversas doenças humanas relacionadas com deficiências no reparo do DNA, podemos citar a síndrome de Cockayne, a tricotiodistrofia e o Xeroderma pigmentoso (Xeroderma igmentosum). Nos três casos, o paciente apresenta alguma deficiência no reparo por excisão de nucleotídeos e transcrição do DNA. Assuntos da próxima aula: 1. Técnica de eletroforese em gel de agarose e southern blotting; 2. Northern blotting, western Blotting e transformação de E. coli; 3. Reação em cadeia da polimerase (PCR) e transcrição reversa; 4. Clonagem, bibliotecas de DNA e sequenciamento.
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