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Giovanna de Freitas Ferreira – Medicina T5 UFMT REPLICAÇÃO Cada fita é ligada por pontes de hidrogênio As duas podem servir de molde Origem da replicação Se inicia numa sequencia especifica de nucleotídeos que estão no local de abertura inicial do DNA Sua sequencia de DNA atrai ptn iniciadoras Contém muitos A=T por serem mais fáceis de quebrar Forquilha de replicação Cada máquina de replicação (fork + ptn) desliza sobre o DNA abrindo-o Duas forquilhas são formadas no local de iniciação da replicação e vão se separando a fita à medida que vão se deslocando É BIDIRECIONAL, pois a forquilha vai em 2 direções A DNA POLIMERASE sintetiza a nova fita - Ela catalisa a adição de nucleotídeos à extremidade 3’ pela formação de uma ligação fosfodiéster entre a extremidade 3’ e o grupo fosfato 5’ do nucleotídeo a ser incorporado - Ela se desloca sobre a fita e se matem fixa a ela - Só add na extremidade 3’ - Corrige erros no pareamento - Cada fita só é sintetizada na direção 5’3’ A DNA pol lê 3’5’ e adiciona 5’3’ na fita líder Nucleotídeo = base nitrog. + pentose + grupo fosfato O nucleotídeo vem em forma de trifosfato de nucleosídeo, o qual sofre hidrólise, liberando energia para ocorrer a reação de polimerização (liga o monômero do nucleotídeo a cadeira) e libera pirofosfato (o qual sofre hidrólise formando fosfato inorgânico, tornando a reação de polimerização irreversível) A fita que começa com 5’ a dna pol sintetiza o novo dna em pequenos fragmentos (OKAZAKI) e no sentido contrário ao deslocamento da forquilha de replicação Essa fita sintetizada descontinuamente é chamada de FITA RETARDADA e a outra chama FITA LÍDER PRIMER A dna pol não consegue começar uma fita nova do nada, ela precisa ter uma extremidade já pareada para poder começar a andar e adicionar novos nucleotídeos O primer é um RNA de apx 10 nucleotídeos que se pareia com a fita molde e fornece a extremidade 3’livre para a polimerase É sintetizado pela enzima primase (é um RNA POL, ou seja, sintetiza rna usando dna como molde) Ele existe em ambas as fitas É considerado um iniciador para a síntese Fita líder: apenas um primer é necessário, pois a síntese é contínua Fita retardada: 1 primer a cada fragmento A produção descontínua necessita de 3 enzimas: - Elas removem o primer, o substituem por dna e une os fragmentos sintetizados - Nuclease: degrada o primer - Dna pol (polimerase de reparo) subst. RNA por DNA (usando as extremidades dos fragmentos como iniciadores) e verifica/corrige erros - Dna ligase: une (liga 5’ fosfato ao 3’OH do próximo) Helicase: separa dupla hélice usando energia do ATP Ptn ligadora de fita simples: se liga a uma fita para evitar o repareamento Grampo deslizante: mantém a Dna pol ligada à fita molde Montador do grampo: usa ATP para prender o grampo ao redor da hélice - Fita líder: montado uma vez - Fita retardada: o grampo é removido e recolocado a cada frag. *DNA ANTIPARALELO: é dizer que uma fita é 3’5’ e outra é 5’3’ ** DNA COM POLARIDADE INVERTIDA: é dizer que uma fita começa com 3’ e a outra com 5’ TRANSCRIÇÃO O processo é muito semelhante ao de replicação Uma fita apenas é usada como molde, ocorre no núcleo O RNA POLIMERASE catalisa a adição de ribonucleotídeos (e não de desoxirribonucleotídeos, como o dna pol) - Ela não precisa de um primer para iniciar a adição de nucleotídeos Tipos de rna RNAm Codificam proteínas RNAr Formam a região central dos ribossomso e catalisam síntese RNAmi Regulam a expressão de genes RNAt Elo de ligação entre o a.a. (rnam) e o local da sintese Outros Splicingn manutenção de telômeros, entre outros iniciação O Rna pol se prende a uma porção do dna e desliza ate encontrar uma região promotora (sequência de nucl. indicando iniciação) Quando encontra, abre a hélice e começa a transcrever uma fita A transcrição para quando a Rna pol encontra o sítio de parada/terminador e em seguida libera o rna-molde Porções nucl. do promotor/terminador se associam a sequencias específicas de bases expostas na superfície externa da ptn pol EUCARIOTOS PROCARIOTOS 3 tipos de polimerase 1 tipo de polimerase Precisa de fatores de transcrição Transcreve sozinho Genes muito dispersos Genes próximos Dna tem histonas e nucleossomos Dna apenas Rna novo passa por modificações Rna novo Ribossom POLIMERASES GENES RNA-Pol I RNAr (maior parte) RNA-Pol II RNA codificantes, RNAmi, Rna codificante do spliciossomo, outros RNA-Pol III RNAt, RNAr, outros estruturais e catalíticos FATORES GERAIS DE TRANSCRIÇÃO São ptns acessórias que se ligam ao promotor TFIID composto por Timinas e Adeninas chama-se TATA box distorce o Dna (marca o início da montagem de fatores sobre o promotor) esta a ~25 nucl antes do promotor se liga a região TATA por meio da subunidade TBP Rna pol II + Fatores= Complexo de Iniciação de Transcrição Os fatores servem para prender o rna pol II na fita de DNA Depois dele preso, os fatores começam a se desprender por meio de diversas reações TFIIH Contém uma de suas subunidades com ação ptn-cinase, ou seja, faz fosforilação ao adicionar grupos fosfato a ‘’cauda’’ do RNAp2 Isso ajuda a dissociar a polimerase do grupo de fatores Os fatores liberados do dna podem ser reciclados e usados para iniciar outro ciclo de transcrição PROCESSAMENTO DO RNA Capeamento Só ocorre em RNAm Adição de um nucl. atípico (G + grupo metila) na extremidade 5’ do RNAm Ocorre após ~25 nucl sintetizados, antes de completar a transcrição Poliadenilação Só ocorre em RNAm Adição de várias Adeninas a extremidade 3’ (fim) cauda poli-A A extr. 3’ é sempre clivada por uma enzima que corta o rna em segmentos específicos e depois disso, somente, é adicionado a cauda poliA SPLICING Íntrons são removidos e Éxons são ligados entre sim Ocorre após o capeamento e antes da poliadenilação (no caso de RNAm) Pode ocorrer poliadenilação antes ou depois também, depende do tipo do Rna transcrito Os íntrons contem segmentos de bases que o identificam São removidos em forma de ‘’laço’’ pela maquinaria de splicing Spliceossomo: é snRNPs arranjo de rna + ptn que faz o splicing pequenos RNAs nucleares (snRNAs) + proteínas = pequenas partículas ribonucleoproteicas nucleares (snRNPs) Splicing Alternativo: permite que muitas ptn sejam formadas a partir de um mesmo RNAm recém transcrito Seletividade dos RNAs Os RNAs maduros se ligam a um complexo proteico, o qual sinaliza que ele foi corretamente processado. Após isso, ele pode passar seletivamente pelo poro nuclear Os rna lixo são degradados por RNases e suas subunidades são reutilizadas TRADUÇÃO AntiCódon: pareia com RNAm RnaT: uma extremidade se liga ao RNAm e a outra no a.a. Um RNAt pode se ligar a um ou vários a.a., assim como um a.a. pode ter um ou vários RNAt 1 códon = 3 nucl. Código genético: sequência de nucl. que determina um a.a. Há 64 combinações para 20 a.a. Sintetases: ligam o a.a. ao RNAt / existe uma sintetase p cada a.a. Ribossomo = compl. ptn ribossomais + RNAr - a subunidade pequena pareia os RNAt aos códons do RNAm - a subunidade grande catalisa a formação de ligações peptídicas que unem os a.a. uns aos outros - as duas subunid. se associam sob uma molécula de RNAm - contém 1 sítio p/ RNAm e 3 para o RNAt - o RNAt se liga no A, coloca o a.a. no P e vai pro E para ser liberado-O ribossomo é uma ribozima - ribozima: molécula de rna com atividade catalítica Início da tradução O códon do RNAm AUG (MET) determina o início da tradução RNAt iniciador carrega a metionina de modo que todas as ptn sintetizadas tem met no início Proteínas chamadas de fatores de iniciação da tradução se acoplam no RNAt iniciador, por isso ele é distinto do RNAt que normalmente transporta met 1) RNAtinicial + fatores se liga a subunidade pequena no sítio P 2) a subunid peq se liga (na extremidade 5’) no RNAm e anda até achar AUG 3)fatores se dissociam e a subunidade grande se associa 4) met é adicionada 5) a partir dai o ribossomo vai andando, recebendo RNAt e adicionando a.a. até a ptn estar completa
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