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REGULAÇÃO GÊNICA Como uma única célula pode dar origem a tipos celulares tão distintos? • Hipótese 1: durante a diferenciação, apenas os genes que codificam as proteínas que serão expressos naquele tipo celular são mantidos. • Hipótese 2: todos os genes são mantidos, mas somente as proteínas específicas ao tipo celular são expressas. Em 1965, George Morel estava tentando obter orquídeas livres de vírus, e descobriu que pedaços de apenas 1 mm do caule poderiam produzir plantas inteiras. Totipotência Celular Em animais, a maioria das células adultas (diferenciadas) perderam sua capacidade totipotente, entretanto restaram algumas células indiferenciadas, que ainda mantêm essa característica de “pluripotência”, as células-tronco. No embrião, todas as células são indiferenciadas e pluripotentes. O que essas observações sugerem em relação às duas hipóteses que nós levantamos inicialmente? Ø Todas as células de um organismo contêm o mesmo conteúdo genético. O que muda entre células distintas, ou entre condições fisiológicas distintas, são os genes que são expressos. Ø As células são especializadas em tarefas específicas. As proteínas produzidas em uma célula neural são diferentes das produzidas pelo linfócito. Ainda que as células neurais e linfócitos sejam diferentes na forma e função, carregam os mesmos genes. Ø A especialização celular ocorre através da regulação gênica Mecanismos para a criação de células especializadas As diferenças que existem entre os diferentes tipos celulares são produzidas por diferenças na expressão gênica. Genes A Especialização Celular Regulação Gênica Genes B Genes C Proteína C Proteína BProteína A A expressão de genes/proteínas é controlada em 2 níveis: Ø Temporal - quando um determinado gene/proteína só é expresso em um “tempo” determinado. Ex: proteínas que só são expressas no embrião, ou durante uma determinada fase do ciclo celular. Ø Espacial - quando a expressão de determinado gene/proteína é diferente dependendo do tipo celular. Ex: proteínas que só são expressas em células nervosas (ex: mielina) ou no tecido muscular (ex: myosina) Existem genes que são expressos: Duas famílias distintas de genes Constitutivos Regulados Todas as células de um organismo contêm o mesmo conteúdo genético. Genes constitutivos Genes que são constantemente expressos Genes regulados Genes cuja expressão varia de acordo com as condições da célula Genes Constitutivos: Em todas as células do organismo: proteínas essenciais para a manutenção da vida, normalmente envolvida em processos básicos como replicação e manutenção do material genético. Genes constitutivos são expressos em vários tecidos para assegurar as funções celulares (ALBERTS et al., 2002; LEWIN, 2004). Genes Regulados ou Induzíveis: -Genes expressos em alguns tecidos, cuja função esta diretamente relacionada à função. - Genes expressos em somente um tecido, de função altamente especializada. Ex: C-globina é expressa somente em eritrócitos. - Genes expressos em somente uma célula, e todas as células clonais descendentes dessa progenitora Regulação da expressão gênica em bactérias e em organismos multicelulares q Nas bactérias o controle da expressão gênica serve principalmente para permitir que as células se ajustem às mudanças nutricionais no ambiente, de forma que o seu crescimento e divisão sejam otimizados. q Em organismos multicelulares a expressão gênica controlada regula um programa genético fundamental para o desenvolvimento embrionário e a diferenciação. Como uma célula pode controlar as proteínas que ela faz? q Controlando quando e como um determinado gene é transcrito; q Controlando como um transcrito primário de RNA sofre o “splicing” ou é processado; q Selecionando quais mRNAs são traduzidos; q Ativando ou inativando seletivamente as proteínas depois da sua síntese. q Gene: toda a sequência de ácido nucléico que é necessária para a síntese de um polipeptídeo funcional ou molécula de RNA. q Promotor: a sequência mínima necessária para que a transcrição se inicie corretamente. q Elementos Regulatórios em Cis: elementos que regulam a iniciação da transcrição. Definições: Pontos de controle da expressão gênica em eucariotos Estudo da expressão gênica q Para ajudar a entender os mecanismos que tornam uma célula diferente da outra, seja em organismos diferentes, tecidos diferentes ou situações diferentes. q O fato de que as células possuem diversos níveis de regulação da expressão gênica indica sua importância para definir os processos e funções de cada tipo celular ou a resposta de cada célula a uma determinada situação. Estudo da expressão gênica q A tecnologia de microarranjos é um processo baseado em hibridização que possibilita observar a concentração de mRNA de uma amostra de células analisando a luminosidade de sinais fluorescentes. Estudos globais da expressão gênica: Sequências pequenas de cada gene, que o identificam Microarrays SAGE Bibliotecas de ESTs: dados mais detalhados Sequências grandes de DNA complentar, gerado a partir do RNA das células Somente as sequências transcritas – EXPRESSED SEQUENCE TAGS O maior número possível de sequências é gerado e sequenciado – BIBLIOTECA Com objetivo de acumular toda a informação possível do TRANSCRIPTOMA das células, ou seja, tornar conhecidas todas as sequências de DNA que são transcritas em RNAm naquela célula 1.0 20.0 40.0 0h 6h 12 h 18 h 24 h 1.0 2.0 4.0 1.0 2.0 3.0 1.0 3.0 6.0 Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare OsFRDL1– (parte aérea) OsFRDL1– (raiz) OsNRAMP1– (raiz) OsNRAMP2– (parte aérea) 1.0 20.0 40.0 0h 6h 12 h 18 h 24 h 1.0 2.0 4.0 1.0 2.0 3.0 1.0 3.0 6.0 Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare 1.0 20.0 40.01.0 20.0 40.0 0h 6h 12 h 18 h 24 h 0h 6h 12 h 18 h 24 h 0h 6h 12 h 18 h 24 h 1.0 2.0 4.01.0 2.0 4.0 1.0 2.0 3.01.0 2.0 3.0 1.0 3.0 6.01.0 3.0 6.0 Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare Epagri108 BR-IRGA 410 Nipponbare OsFRDL1– (parte aérea) OsFRDL1– (raiz) OsNRAMP1– (raiz) OsNRAMP2– (parte aérea) Figura 1. Perfil de expressão dos genes OsFRDL1, OsNRAMP1 e OsNRAMP2, analisado através da técnica de qRT-PCR, utilizando o Mult Experiment Viewer (TIGR MeV) (SAEED et al., 2003). A regulação da expressão gênica nos separa ... Genomas 98,5% idênticos
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