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Ana Beatriz Coelho Regulação Gênica Modulação de uma ou mais etapas de expressão gênica Nem todos os genes são expressos em todas as células nem durante todo o tempo Etapas nas quais a expressão gênica pode ser regulada Genes construtivos: continuamente expressos na maioria das células, responsáveis pela manutenção das funções essenciais de qualquer célula Genes regulados: expressos por um período de tempo. Têm sua expressão passível de indução pelo ambiente. Ana Beatriz Coelho Regulação transcricional Para a célula, regular a expressão gênica através do controle da transcrição é mais econômico. Nela, proteínas reguladoras interagem especificamente com o DNA, sem precisar abrir a dupla fita (ver fatores da transcrição) Regulação da Transcrição por proteínas reguladoras RNApol II (e fatores de transcrição não conseguem reconhecer e se acoplar a um promotor de um gene sem a ajuda de elementos reguladores. Enhancer: é uma sequência especifica de nucleotídeos DNA ao qual se podem ligar proteínas que aumentam os níveis de transcrição. Quando os enhancers são reconhecidos na fita de DNA, formam-se dobras na fita para que genes de regiões até então distantes fiquem mais próximos da região basal de transcrição, viabilizando a associação entre proteínas que se ligam a sítios separados Silencer é uma sequência de DNA onde os repressores se ligam. Muitas proteínas reguladoras ativam o processo de transcrição pois facilitam o acesso do complexo da transcrição ao promotor (proteínas ativadoras da transcrição) Outras proteínas atuam prejudicando a transcrição do gene, atenuando ou inviabilizando o acesso do complexo da RNA pol. (proteínas repressoras da transcrição) As proteínas ativadoras da transcrição possuem dois domínios funcionais distintos (de ligação específica com o DNA- “domínio de ligação com o DNA” e uma interação proteína-complexo da transcrição- “domínio de ativação”) A afinidade do promotor com o DNA aumenta a taxa de transcrição, o contrário também pode ser dito. Ana Beatriz Coelho Alguns repressores atuam de maneira ativa para reprimir a transcrição. A proteína interage com os fatores do complexo da transcrição para realizar a repressão transcricional. Em outros casos, a repressão da transcrição pode ser realizada de forma passiva, quando a ligação do repressor ao seu sítio no DNA prejudica, ou bloqueia, o acesso de proteínas ativadoras. An insulator bloqueia a interação entre enhancers e promotores Os elementos reguladores Promotor da RNApol, Enhancers, Silencers, Insulators, Fatores de transcrição, Histonas modificadas Ana Beatriz Coelho Controle da transcrição por remodelamento da cromatina As histonas dos nucleossomos, juntamente com proteínas cromossomais não histonas, são capazes de realizar interações que resultam em níveis mais intensos de empacotamento. Regiões compactadas do genoma são, normalmente, transcricionalmente inativas A presença ou ausência de radicais na estrutura do DNA ou das histonas controla os níveis de compactação da cromatina. Permite que regiões genômicas idênticas apresentem diferentes estados de atividade, em função dos tecidos ou fase de desenvolvimento em que a célula se encontre. Metilação do DNA Adição de radicais metil a determinadas citosinas. A regulação dos níveis de metilação do DNA é controlada pela ação coordenada de metilases (responsáveis pela adição de radicais metil) O processo de metilação ocorre imediatamente após a síntese do DNA e atinge considerável parcela das citosinas do genoma. Metilação, acetilação e fosforilação das histonas Modificações epigenéticas As histonas possuem longas caudas amino-terminais que se estendem para fora da estrutura. Elas são o principal alvo para a metilação, aceltilação e fosforilação, que resultam na alteração da s cadeias laterais de aminoácidos específicos, afetando o acesso de proteínas reguladoras e complexos proteicos à cromatina. Quanto mais intensa a interação entre nucleossomos adjacentes, maior a tendência à compactação da cromatina. A neutralização da carga básica da cauda das histonas, promovida pela acetilação resulta em três alterações funcionais: Redução da afinidade da histona pelo DNA Alteração nas interações entre histonas de nucleossomos adjacentes Alteração nas interações entre as histonas e proteínas reguladoras. A célula utiliza as histonas para comprimir DNA em uma estrutura compacta denominada cromatina, cuja a função é organizar e empacotar o genoma dentro do núcleo celular Metila: compacto Acetila: descompacto Ana Beatriz Coelho A fosforilação de aminoácidos promove o incremento da atividade de acetilação subsequentes. A presença ou ausência das modificações das histonas e DNA pode afetar a expressão de um dado gene por duas maneiras distintas: Alteram a compactação do DNA e sua disponibilidade para transcrição Alteram os níveis de interação entre a região do genoma e proteínas reguladoras específicas. Ana Beatriz Coelho Regulação Pós transcricional Processamento do mRNA Splicing alternativo Eliminação das sequências correspondentes aos íntrons do transcrito primário e a emenda dos exons (feita pelos spliceossomos) Mesmo gene pode dar origem a várias proteínas Estabilidade do mRNA mRNA possuem vida útil, após certo tempo, tais moléculas precisam ser eliminada por enzimas mRNAs estáveis têm um período de duração no citoplasma muito maior que os demais. Os transcritos produzidos por um mesmo gene podem apresentar diferentes estabilidades, em função do tecido onde são produzidos. A cap 5´e a cauda poli a estão envolvidas na estabilidade do mRNA mRNA +estáveis maior acúmulo no citoplasma maior produção da proteína codificada Ana Beatriz Coelho Proteínas capazes de se associar a cap 5´ e a cauda poli A, inibindo ou promovendo a ação de enzimas de degradação Poliadelinação alternativa Regulação traducional Moléculas de mRNA podem ser traduzidas somente em determinadas circunstâncias. A regulação pela presença de regiões codificadoras adicionais tem sido bem caracterizada. Ana Beatriz Coelho O processo de tradução de um polipeptídeo, a partir de um mRNA, tem início no “códon de iniciação da transcrição” (localizado perto a extremidade 5´). Certas classes de mRNA contêm regiões codificadoras de pequenos peptídeos, antes da região que codifica o peptídeo principal. Essas regiões prejudicam a tradução do peptídeo principal. Regulação traducional global: afeta todos os mRNA mudança na Elf2 Regulação traducional específica: afeta um único mRNA Ana Beatriz Coelho Regulação pós traducional Consiste em alterações promovidas nas propriedades da proteína, através da clivagem proteolítica ou da adição de grupos modificadores. A presença ou a ausência de tais modificações pode definir o estado de atividade da proteína, sua localização celular, taxa de degradação e a interação com outras proteínas, ou seja, pode modular sua atividade. A indução ou a repressão do processo de degradação dos polipeptídeos codificados por um dado gene representam uma forma de controle da expressão gênica, afetando a estabilidade de tais moléculas. Muitas proteínas precisam ser corretamente endereçadas para o compartimento celular onde desempenharão seu papel biológico. miRNAs + complexo proteico reconhece mRNAalvo e degradação
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