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Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 1 2 - Genética de Populações É à parte da genética que estuda a transmissão das características nas populações. A Genética de Populações fornece subsídios para a compreensão de como se processa o Melhoramento Genético fornecendo também as bases necessárias para o entendimento da evolução das características na natureza. Sob o ponto de vista genético, uma população é um grupo de indivíduos da mesma espécie, que mantêm uma continuidade no tempo e no espaço e que são capazes de se acasalar. As características genéticas de uma população são determinadas pelas freqüências genotípicas, pelas freqüências gênicas e pela ocorrência de fenômenos genéticos tais como a seleção, a mutação gênica, a migração, a oscilação ou deriva genética e os sistemas de acasalamentos. 2.1 - Freqüências Genotípicas Corresponde ao número de indivíduos de um determinado genótipo em relação ao número total de indivíduos da população. Para exemplificarmos utilizaremos uma população de bovinos da raça Shorthorn constituída de 4.760 indivíduos de pelagem vermelha (V1V1), 4.380 indivíduos de pelagem rosilha ou ruão (V1V2) e 860 indivíduos de pelagem branca (V2V2), perfazendo um total de 10.000 animais. Nesta população as freqüências genotípicas serão as seguintes: f (V1V1) = d = 4.760 / 10.000 = 0,476 f (V1V2) = h = 4.380 / 10.000 = 0,438 f (V2V2) = r = 860 / 10.000 = 0,086 Como podemos ver, a soma das freqüências de todos os genótipos é igual a 1, ou seja, a f (V1V1) + f (V1V2) + f (V2V2) = d + h + r = 1. 2.2 - Freqüências Gênicas ou Freqüências Alélicas São as proporções dos diferentes alelos de um determinado locus em uma população. Considerando a mesma população acima, teremos: f (V1) = p = d + ½ h = 0,476 + ½ x 0,438 = 0,695 f (V2) = q = r + ½ h = 0,086 + ½ x 0,438 = 0,305 Da mesma forma, a soma das freqüências dos alelos de um determinado locus, também será igual a 1, ou seja, f (V1) + f (V2) = p + q = 1. 2.3 - Teorema de Hardy - Weinberg Em uma população suficientemente grande para que não ocorra oscilação genética, onde os acasalamentos ocorram ao acaso (Panmixia), sendo todos os indivíduos igualmente férteis e viáveis e onde não ocorra seleção, não ocorra mutação gênica e não ocorra migração, as Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 2 freqüências genotípicas e gênicas permanecerão constantes ao longo das gerações. Neste caso considera-se que a população está em equilíbrio. Considerando uma população qualquer (geração 0), o que deve acontecer com as freqüências gênicas e genotípicas nas próximas gerações se ela for mantida sob as condições do Teorema de Hardy-Weinberg? Sabendo-se que f (V1V1) = d; f (V1V2) = h; f (V2V2) = r; f (V1) = p; f (V2) = q, teremos, através das combinações dos gametas, o seguinte quadro: Freqüência dos gametas masculinos Freqüência dos gametas femininos V1 = p V2 = q V1 = p p2 pq V2 = q pq q2 Como visto acima, espera-se que na próxima geração, as freqüências genotípicas passem de d, h e r para p2, 2pq e q2, respectivamente, sendo p2 + 2pq + q2 também igual a 1. Se, ao invés das combinações dos gametas, considerarmos todos os acasalamentos possíveis, teremos: Freqüências dos genótipos dos machos Freqüências dos genótipos das fêmeas V1V1 = d V1V2 = h V2V2 = r V1V1 = d d2 dh dr V1V2 = h dh h2 hr V2V2 = r dr Hr r2 Acasalamentos Freqüências dos acasalamentos Genótipos das progênies e suas freqüências V1V1 V1V2 V2V2 V1V1 x V1V1 d2 d2 -- -- V1V1 x V1V2 2dh dh dh -- V1V1 x V2V2 2dr -- 2dr -- V1V2 x V1V2 h2 1/4 h2 1/2 h2 1/4 h2 V1V2 x V2V2 2hr -- hr hr V2V2 x V2V2 r2 -- -- r2 Da mesma forma, podemos ver que as freqüências genotípicas na geração 1, passam a ser f (V1V1) = d2 + dh + 1/4 h2 = (d + 1/2 h)2 = p2, f (V1V2) = dh + 2dr + 1/2 h2 + hr = 2 (d + 1/2 h) (r + 1/2 h) = 2pq e f (V2V2) = 1/4 h2 + hr + r2 = (r + 1/2 h)2 = q2 e que as freqüências gênicas não se alteram, ou seja, f (V1) = (d + 1/2 h)2 = p2 + ½ 2pq = p(p + q) = p e f (V2) = (r + 1/2 h)2 = q2 + ½ 2pq = q(p + q) = q Se, com os indivíduos da geração 1 continuarmos a praticar o acasalamento ao acaso, veremos que as freqüências genotípicas e gênicas se manterão constantes ao longo das gerações, como mostrado abaixo. Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 3 Freqüências dos genótipos dos machos Freqüências dos genótipos das fêmeas V1V1 = p2 V1V2 = 2pq V2V2 = q2 V1V1 = p2 p4 2p3q p2q2 V1V2 = 2pq 2p3q 4p2q2 2pq3 V2V2 = q2 p2q2 2pq3 q4 Acasalamentos Freqüências dos acasalamentos Genótipos das progênies e suas freqüências V1V1 V1V2 V2V2 V1V1 x V1V1 p 4 p 4 -- -- V1V1 x V1V2 4p 3 q 2p 3 q 2p 3 q -- V1V1 x V2V2 2p 2 q 2 -- 2p 2 q 2 -- V1V2 x V1V2 4p 2 q 2 p 2 q 2 2p 2 q 2 p 2 q 2 V1V2 x V2V2 4pq 3 -- 2pq 3 2pq 3 V2V2 x V2V2 q 4 -- -- q 4 f (V1V1) = p4 + 2p 3 q + p 2 q 2 = p2 (p2 + 2pq + q2) = p2 f (V1V2) = 2p 3 q + 2p2q2 + 2p2q2 + 2pq 3 = 2pq (p2 + pq + pq + q2) = 2pq f (V2V2) = p 2 q2 + 2pq3 + q4 = q2 (p2 + 2pq + q2) = q2 Portanto, conforme demonstrado, as freqüências genotípicas que eram d, h e r em uma população fora do equilíbrio, passam a ser f (AA) ou (V1V1) = p2, f (Aa) ou (V1V2) = 2pq e f (aa) ou (V2V2) = q2, quando esta entra em equilíbrio. 2.3.1 - Teorema de Hardy-Weinberg e Mais de um Loco Se há dois ou mais locos envolvidos o equilíbrio é atingido da mesma forma; porém, o número de gerações necessárias não é de apenas uma, como ocorre com um loco. Neste caso são necessárias várias gerações, sendo que o número de gerações é tanto maior quanto maior for o número de locos envolvidos e quanto mais próximos estiverem os locos caso ocupem o mesmo cromossomo. Maiores detalhes podem ser obtidos em FALCONER (1987). 2.3.2 - Teorema de Hardy-Weinberg no caso de dominância completa: Sob a lei de Hardy-Weinberg o comportamento das freqüências alélicas e genotípicas das populações independe do tipo de interação alélica. Porém quando a dominância é completa, no caso com dois alelos, não há como identificar os três genótipos pelos fenótipos, pois neste caso ocorrem apenas dois fenótipos. Mas se a população estiver em equilíbrio, as freqüências alélicas poderão ser determinadas a partir da freqüência do fenótipo recessivo (q2), pois a freqüência do alelo recessivo (q) deverá ser igual a raiz quadrada da freqüência do genótipo homozigoto recessivo (q2). Portanto neste caso para o cálculo das freqüências alélicas emprega- Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 4 se a Lei de Hardy-Weinberg (equação), logo para se estimar as freqüências genotípicas as condições da lei têm que ser atendidas e a proporção de indivíduos homozigotos recessivos tem que ser perfeitamente conhecida (q2). Sendo assim: q2 =q e p=1-q p² + 2pq + q² Exemplos de dominância: a) Mocho (M_) e chifrudo (mm) em bovinos (M_>mm) b) pelo curto (C_) e comprido (cc) em coelhos (C_>cc) c) Lã branca (B_) e preta (bb) em ovinos (B_>bb) d) malhas pretas (P_) e vermelhas (pp) em bovinos holandês e) pelagem preta (P_) e vermelha (pp) em bovinos da raça Aberdeen-Angus. Exemplo de cálculo: MM + Mm = M_ = 91 e mm=9. q² = 0,09 q= 0 09, = 0,3 p=0,7 (0,7)²MM+2(0,7*0,3)Mm+(0,3)²mm 0,49MM+0,42Mm+0,09mm (*100) 49MM + 42Mm + 9mm estas são as freqüências esperadas na população em equilíbrio. 2.4 - Fatores que afetam o equilíbrio nas populações 2.4.1 - Seleção Pode ser definida como sendo um processo de reprodução diferencial entre os indivíduos da população. Quando o homem controla a reprodução diferencial, a seleção é dita artificial, quando a natureza é a controladora a seleção é dita natural. Nos animais, populações fenotipicamente heterogêneas serão também genotipicamente heterogêneas. A Seleção Artificial é o mecanismo mais eficiente para alterarmos as freqüências alélicas de maneira planejada, sendo um dos recursos mais importantes para aumentar a produtividade dos animais, do ponto de vista genético, e em longo prazo. A Seleção é medida pelo coeficiente de seleção “s” que varia de 0 a 1 ou de 0 a 100%. Quando s = 0 não há seleção, ou seja, significa que nenhum indivíduo de um determinado genótipo é eliminado da reprodução. Quando s = 1 significa que todos os indivíduos, de um determinado genótipo, são eliminados da reprodução. Quando 1 s 0, por exemplo, s = 0,30, significa que 30 % dos indivíduos de um determinado genótipo são eliminados da reprodução. Para chegarmos a fórmula geral que servirá para o cálculo das freqüências gênicas considerando seleção contra os indivíduos de genótipo aa na geração 0, teremos: Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 5 Freqüência Genotípica Geração 0 Seleção Freqüência após a seleção f (AA) 2 0p permanecem os 100% 2 0p f (Aa) 002 qp permanecem os 100% 002 qp f (aa) 2 0q 100% - s )1(20 sq Total 1 sq201 f (AA) = 2 0p permanecem os 100% 2 0p f (Aa) = 002 qp permanecem os 100% 002 qp f (aa) = 2 0q 100% - s )1(20 sq --------------------------------------------------------------- Total = 2 0p + 002 qp + )1(20 sq = sq201 Após a seleção passaremos a ter na geração 1: f (AA) = 2 0p / sq201 = d f (Aa) = 002 qp / sq201 = h f (aa) = )1(20 sq / sq201 = r sq qp sq sq hrqaf 2 0 00 2 0 2 0 1 1 2 21 1 )1( 2 1)( sq qpsq qaf 2 0 00 2 0 1 1 )1( )( sq qqsq qaf 2 0 00 2 0 1 1 )1()1( )( sq qqsqq qaf 2 0 2 00 2 0 2 0 1 1 )( sq qsq qaf 2 0 0 2 0 1 1 )( sq sqq qaf 2 0 00 1 1 )1( )( Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 6 A fórmula acima nos permite calcular a freqüência do gene recessivo após a ocorrência de seleção. A freqüência do alelo dominante será dada pela fórmula f (A) = p1 = 1 - q1. Admitindo-se agora a ocorrência de 100% de seleção contra os indivíduos homozigotos aa em todas as gerações, ou seja s = 1, teremos, na primeira geração: 0 0 00 00 2 0 00 1 1)1)(1( )1( 1 )1( )( q q qq qq q qq qaf Na segunda geração, teremos: 1 1 2 1 )( q q qaf 0 0 0 00 0 0 0 0 0 0 2 21 1 1 1 1 1 1 )( q q q qq q q q q q q qaf Em t gerações, teremos: 0 0 1 )( tq q qaf t A fórmula acima nos permite calcular a freqüência do gene a, quando s = 1 contra os indivíduos de genótipo aa em todas as gerações. Para calcularmos o número de gerações (t), podemos utilizar a fórmula acima ou 0 11 qq t t que é derivada da mesma. 2.4.2 - Mutação Gênica Resulta de alterações ocorridas no número e/ou na seqüência de bases nitrogenadas do DNA. Podem ser espontâneas ou induzidas, somáticas ou gaméticas. A taxa de mutação corresponde a medida da ocorrência de mutação. Como exemplo vamos considerar A como sendo o alelo selvagem e a o alelo mutante. Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 7 Neste caso teremos aA u , onde u corresponde a taxa de mutação por geração de A para a; Aa v , onde v corresponde a taxa de mutação por geração de a para A; f (A) = po e f (a) = qo que correspondem as freqüências gênicas na geração zero. Para calcularmos as freqüências gênicas após mutação utilizaremos as fórmulas 0001)( vqupppAf e 0001)( upvqqqaf . Quando 0up for maior que 0vp , a freqüência de A diminui; quando 0up for menor que 0vp , a freqüência de A aumenta; quando 0up for igual a 0vp , a população está em equilíbrio. Neste último caso teremos que up = vq ou up = v(1-p) ou up = v-vp ou up + vp = v ou p(u + v) = v e finalmente vu vpAf )( . Esta fórmula nos dá a freqüência do alelo A no equilíbrio. A fórmula para o cálculo da freqüência do alelo a também no equilíbrio será vu uqaf )( . Como as mutações são eventos raros, as freqüências dos genes mutantes nas populações são extremamente baixas sendo necessárias, portanto, muitas gerações para que seus efeitos sejam observados. As mutações em geral são indesejáveis, e quando recessivas se mantêm nas populações ocultas nos heterozigotos. A seleção atua no sentido de favorecer os alelos mutantes de maior valor adaptativo. A importância da mutação para o melhoramento reside no fato desta ser a fonte primária de variabilidade genética. 2.4.3 - Migração Genética ou Fluxo Gênico É a entrada ou saída de indivíduos férteis em uma população. Para que a migração genética ocorra não poderá haver barreiras reprodutivas. Para calcularmos as freqüências gênicas após mutação utilizaremos as fórmulas )()( 001 ppimppAf e )()( 001 qqimqqaf , onde m corresponde a taxa ou percentual de imigrantes que é dada pela razão entre o número de indivíduos imigrantes e o número total de indivíduos da população após imigração, p0 e q0 são as freqüências dos alelos A e a, respectivamente, antes da imigração e pi e qi são as freqüências dos alelos A e a, respectivamente, no grupo de imigrantes. Potencialmente a migração pode modificar as características genéticas de uma população de uma forma rápida se os imigrantes são muitos e se provierem de outras populações geneticamente muito diferentes. Em geral, o efeito da migração é muito discreto, e Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 8 para que se tenha algum efeito é necessária a utilização intensa de reprodutoresimigrantes, através de biotécnicas de reprodução, como a inseminação artificial. Deve ser ainda considerado, que em geral, os imigrantes de alto mérito genético possuem problemas de adaptabilidade, havendo às vezes a necessidade de mudanças ambientais para eles superem esse problema. Após ter sido cessada a migração a população nativa pode alcançar um ponto de equilíbrio com a nova constituição genética. Existem muitos exemplos de imigrações na criação animal. Um primeiro exemplo poder ser o processo de absorção de uma raça por outra, através do uso contínuo de reprodutores de uma raça melhorada sobre a nativa. No Brasil temos como exemplo a entrada dos zebuínos. Outro exemplo prático é a migração permanente de genes dos rebanhos melhoradores até os rebanhos comerciais, pela venda de animais ou de sêmen. Um terceiro exemplo seria as importações de reprodutores de outros países, seja na forma de animais, de sêmen ou embriões. O impacto desta estratégia de melhoramento pode ser grande, se os animais importados são usados intensivamente, e, de efeitos positivos e negativos dependendo da diversidade genética e da superioridade genética relativa dos imigrantes. 2.4.4 - Deriva ou Oscilação Genética Uma população pode ter suas freqüências gênicas alteradas por obra do acaso, ou seja, não existindo nenhum fator evolutivo envolvido, não se relacionando, portanto, com a adaptação dos indivíduos ao meio. Isto acontece em populações de tamanho reduzido. 2.4.5 - Sistemas de Acasalamentos 2.4.5.1 - Acasalamento ao Acaso também conhecido como "Panmixia", é uma condição necessária para que uma população se mantenha em equilíbrio. 2.4.5.2 - A Endogamia também conhecida como Consangüinidade é o acasalamento entre indivíduos parentes. Uma população é dita endógama quando a freqüência dos acasalamentos entre indivíduos aparentados é maior do que se os acasalamentos ocorressem ao acaso. Como conseqüência temos um aumento da homozigose nessa população. 2.4.5.3 - A Exogamia ocorre, quando na população, a freqüência dos acasalamentos entre indivíduos não aparentados é maior do que se os acasalamentos fossem ao acaso. Como conseqüência temos um aumento da heterozigose na população. 2.4.5.4 - Acasalamentos Preferenciais são acasalamentos direcionados, como por exemplo, o acasalamento entre indivíduos de mesmo fenótipo. Como exemplo podemos citar os Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 9 acasalamentos entre indivíduos de mesmo fenótipo considerando a cor da pelagem em um rebanho bovino da raça Shorthorn, onde, V1V1 é vermelho, V1V2 é rosilho ou ruão e V2V2 é branco. Acasalando a geração inicial: Tipos de Acasalamentos Freqüências dos Acasalamentos Genótipos das progênies e suas freqüências V1V1 V1V2 V2V2 V1V1 x V1V1 p 2 x 1 = p 2 p 2 -- -- V1V2 x V1V2 2 pq x 1 = 2 pq (½) pq pq (½) pq V2V2 x V2V2 q 2 x 1 = q 2 -- -- q 2 Freqüências Genotípicas (geração 01) p 2 + (½) pq pq q 2 + (½) pq Freqüências na Geração 1: d = p 2 + (½) pq; h = pq; r = q 2 + (½) pq p1 = p 2 + (½) pq + (½) pq = p (p + q) = p q1 = q 2 + (½) pq + (½) pq = q (p + q) = q No exemplo acima podemos observar a ocorrência de alterações nas freqüências genotípicas, porém, as freqüências gênicas mantêm-se constantes. Exercícios: 1 - Calcular as freqüências genotípicas e gênicas em uma população constituída por 5.000 indivíduos AA, 3.000 indivíduos Aa e 2.000 indivíduos aa. 2 - Em uma população constituída por 7.000 indivíduos AA, 2.000 indivíduos Aa e 1.000 indivíduos aa, calcular as freqüências genotípicas, gênicas e verificar se ela está em equilíbrio. 3 - Em uma população constituída por 6.400 indivíduos AA, 3.200 indivíduos Aa e 400 indivíduos aa, calcular as freqüências genotípicas, gênicas e verificar se ela está em equilíbrio. 4 - Em um rebanho bovino, onde os acasalamentos ocorram ao acaso com relação ao caráter presença ou ausência de chifres, existem 8.000 animais sendo que 1.000 apresentam chifres. Sabendo-se que o gene para mocho é o dominante, determinar quantos animais heterozigotos existem provavelmente nesse rebanho. Conceitos Básicos de Genética Quantitativa e de Melhoramento Genético Animal Geisa Ribeiro Leitão & Jorge Luís Armada 10 5 - Quais os procedimentos necessários para verificarmos se uma população está ou não em equilíbrio com relação a um caráter qualitativo qualquer? 6 - Quais as freqüências absolutas dos genótipos AA, Aa e aa em uma população em perfeitas condições de equilíbrio constituída por 6.000 indivíduos onde os genes A e a têm respectivamente as freqüências 0,6 e 04? 7 - Em uma população constituída de 10.000 indivíduos onde existiam 2.000 indivíduos AA; 4.000 Aa e 4.000 aa ocorreu seleção contra 40% dos indivíduos aa. Calcular as freqüências dos alelos A e a após seleção. 8 - Em uma população, um gene a ocorre numa freqüência de 0,7. Determinar a freqüência desse gene após 6 gerações de seleção de 100%, em todas elas, contra os indivíduos de genótipo aa. 9 - Quantas gerações são necessárias para eliminarmos um gene recessivo de uma população cuja freqüência inicial seja 0,5. 10 - Em uma população constituída de 900 indivíduos onde p = 0,3, imigraram 100 indivíduos onde q = 0,9. Calcular a freqüência do alelo A após a imigração. 11 - Em uma população os genes A e a têm respectivamente as freqüências 0,7 e 03. Admitindo-se a ocorrência de mutação de A para a numa taxa de 0,06 e de a para A de 0,02, determinar as freqüências gênicas após a mutação. Determinar as freqüências gênicas no equilíbrio. 12 - Se em uma população de bovinos composta por indivíduos chifrudos, com freqüência para o gene “m” igual a 0,99 forem introduzidos touros mochos, com freqüência para “M” igual a 0,8 e se na primeira geração 40% dos acasalamentos forem realizados pelos touros imigrantes, a mudança na freqüência gênica da população residente será: 13 - Numa população de 1 milhão de indivíduos se incorporam 10 mil imigrantes. Na população original (nativos) q0 = 0,25 e nos imigrantes qm = 0,50. Calcule o incremento da freqüência alélica.
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