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Aula 2 Biologia Molecular Avançada Genes: Replicação e Expressão Genes: Replicação e Expressão Marcella Novaes Franco Nathália Soares Ferreira Vinicio Barbosa S. Santos Andrew Macrae Laboratório de Biotecnologia Sustentável e Bioinformática Microbiana Departamento de Microbiologia Geral IMPPG/UFRJ http://www.ufsm.br/blg220/geneticamolecular.htm 22/12/2005 Replicação do DNA http://www.genelex.com/paternitytesting/paternityslide1.html 22/12/2005 Características Principais da Replicação - Ocorre desenrolamento e síntese simultâneos do DNA em um local denominado forquilha de replicação. - Em E.coli a replicação começa com o desenrolamento do local oric (única origem de replicação em E.coli). - Os filamentos parentais têm sentidos opostos e a replicação do DNA é semiconservativa. - Ambos os filamentos são sintetizados no sentido 5’→3’. - Um filamento de DNA é feito de fragmentos (lagging), o outro é sintetizado de modo contínuo (leading). http://oak.cats.ohiou.edu~ballardhpbio475HeredityHeredity.htm 22/12/2005 Enzimas da Replicação Síntese da fita nova.DNA Polimerase III Retira os primers e preenche as lacunas.DNA Polimerase I Liga os fragmentos de Okasaki.DNA Ligase Se liga à fita simples de DNA, evitando que as pontes de hidrogênio se refaçam. Single Strand Binding (SSB) Sintetiza os primers de RNA.Primase Alivia a tensão torsional gerada pela abertura da dupla-fita. DNA girase Desenrola o DNA.dnaB (helicase) Reconhece a origem e abre a dupla fita em sítios específicos. dnaA DNA Polimerase I: . A DNA Polimerase I foi a primeira enzima dirigida por um molde a ser descoberta. . Tem importante papel na replicação e reparo do DNA. . Catalisa a adição passo a passo de unidades de desoxirribonucleosídeos à ponta 3’ de uma cadeia de DNA. . Para que possa iniciar a replicação é necessário um molde de cadeia (primer) com uma 3’ OH livre. . É uma exonuclease revisora 3’→5’ com função de revisão na polimerização. www.iq.usp.br/wwwdocentes/chsfarah/aula3_Replicacao.ppt 22/12/2005 DNA Polimerase I . É uma exonuclease 5’→3’ corretora de erros. . A atividade de exonuclease 5’→3’ tem papel importante na replicação pois remove o primer de RNA. . Possui baixa capacidade de polimerização 5’→ 3’ relacionada a seu papel de enzima preenchedora de espaços e de reparo. . A DNA polimerase I tem três atividades enzimáticas em uma única cadeia polipeptídica. DNA Polimerases II e III . São similares a DNA Polimerase I em vários aspectos: . Catalisam uma síntese de DNA dirigida por molde. . É necessário um primer com uma 3’OH livre. . A síntese é no sentido 5’→3’. . Elas possuem atividade de exonuclease 3’→5’. DNA Polimerase II: Participa do reparo do DNA mas não é necessária para a replicação pois possui uma capacidade de polimerização baixíssima. DNA Polimerase III: A DNA polimerase III é a principal responsável pela síntese das fitas de DNA devido à sua alta capacidade de polimerização, potência catalítica (1000 nucleotídeos adicionados por segundo, enquanto a polimerase I adiciona apenas 10 por segundo) e fidelidade. Replicação Autoria: Arsénio Fialho Disponível em http://www.e-escola.pt/site-bin/licao_frame.asp?tema_id=81&mat_id=173&dif_id=2&pag_id=678 22/12/2005 Mutações São produzidas por vários tipos de alterações nas seqüências de bases do DNA. Tipos de Mutações . Substituição de um par de bases por outro (transição ou transversão). . Deleção de um ou mais pares de bases. . Inserção de um ou mais pares de bases. http://www.virtual.epm.br/cursos/genetica/htm/mutacao.htm 22/12/2005 Vantagens e Desvantagens das Mutações Vantagens . A mutação poderá ser benéfica se a enzima alterada codificada pelo gene mutante possui uma atividade nova ou aumentada que beneficie a célula. . A mutação é responsável pela variabilidade gênica. . Ela fornece a matéria prima para o processo evolutivo e, em algumas situações é fundamental para o melhoramento, cujo sucesso depende da existência de variabilidade. Desvantagens . A alteração nas seqüências de bases de um gene algumas vezes causa uma alteração no produto codificado por aquele gene. . A alteração do genótipo pode ser desvantajosa ou mesmo letal, se a célula perde uma característica que ela necessita. Por que as Mutações Ocorrem? Vários fatores atuam influenciando modificações nas seqüências de bases do DNA. São eles: Mutágenos Químicos: Substâncias que atuam danificando ligações químicas, ou mesmo substituindo nucleotídeos normais por moléculas análogas. Mutágenos Físicos: Radiação ionizante capaz de destruir as ligações químicas entre os nucleotídeos e raios UV que formam ligações covalentes nocivas entre as bases. Mutágenos Biológicos: ação de vírus e bactérias, que injetam parte de seu DNA na célula hospedeira ocasionalmente integrando-a à cadeia de DNA do hospedeiro. Também podem haver mutações por falhas de ordem genética. Formação de Dímeros de Pirimidina http://www2.uah.es/biomolq/BM/Esquemas/imagenes/Transparencias%20Tema%204%20BM1/Diapositiva5.JPG 22/12/2005 Mecanismos de Reparo O DNA é danificado por uma variedade de agentes físicos e químicos, portanto todas as células possuem mecanismo de reparo. O reparo é possível pois a informação genética é armazenada em ambos os filamentos da dupla hélice e sendo perdida em um filamento pode ser recuperada pelo outro. Rearranjos Gênicos Troca de genes entre duas moléculas de DNA, para formar novas combinações de genes. Tipos de Rearranjos . Recombinação homóloga: A troca pode ocorrer entre qualquer par de seqüências homólogas nas moléculas de DNA parental através da quebra e união de segmentos homólogos. . Transposição: Movimento de um gene de um cromossomo para outro, ou de um local para outro no mesmo cromossomo. . Transposons: Elementos genéticos móveis que possibilitam aos genes o movimento entre locais não homólogos no DNA. www.icb.ufmg.br/~lbcd/prodabi3/grupos/grupo2/program/rearranjo10.html#2 22/12/2005 Exemplo: Plasmídios Fator R – Grupo de transposons de importância médica pois tornam as bactérias resistentes a vários antibióticos Tipos de Rearranjos Recombinação sítio-específica: Troca de duas seqüências de DNA específicas, não necessariamente homólogas. Ocorre quando o DNA circular do FAGO se insere no cromossomo bacteriano entre locais específicos em ambas as moléculas de DNA. Nesse tipo de rearranjo, não é necessário DNA unifilamentar. Exemplo: O material genético do fago lambda se integra ao DNA bacteriano através do ciclo lisogênico. Recombinação Homóloga x Recombinação Sitio-Específica . A recombinação sítio específica, ao contrário da recombinação homóloga, é orientada primariamente por proteínas que reconhecem seqüências particulares do DNA e não por homologia de seqüências. . O DNA unifilamentar é necessário para iniciar a recombinação homóloga mas a sítio específica não. Elementos Genéticos Móveis em Bactérias Plasmídios: Portam genes para inativação de antibióticos, metabolismo de produtos naturais e produção de toxinas. Os plasmídios são replicons. Contêm sua própria origem de replicação http://www.ufv.br/dbg/trab2002/TRANSG/TRG001.htm 22/12/2005 Elementos Genéticos Móveis em Bactérias Tipos de Plasmídios: . Fator F (Fertilidade): Confere “masculinidade”, transmissível por conjugação. . Fator F’: Carregam genes de E.coli além dos genes de Fator F. . Fator R: Carregam genes de resistência à drogas. Alguns carregam genes para conjugação. . Fator Colinogênico: Carregam genes paracolicina (toxina), alguns carregam genes para conjugação. Elementos Genéticos Móveis em Bactérias Fagos lisogênicos: Lambda - Poderá carregar genes de E.coli (gal ou bio) além de genes virais. Mu - Todos os mu carregam pequeno trecho do genoma de E.coli. Seqüência de inserção: São os transposons existentes mais simples, apresentando tipicamente 1kb de comprimento. Poderão se mover para qualquer local em um cromossomo. http://www.icampus.ucl.ac.be/SBIM2520/document/genemol/biomolespa/faslambda/fagos-01.jpg 22/12/2005
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