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1) O método de Sanger consiste na produção de cadeias a partir do DNA em que se deseja sequenciar, com auxílio de um primer, pela DNA polimerase. Inicialmente, o DNA é desnaturado gerando as cadeiras molde para a síntese in vitro. Para a síntese é necessário que se adicione desoxinucleotídeos trifosfatados/dNTPs (dATP, dTTP, dGTP e dCTP) à solução, porém juntamente a eles também é adicionado dideoxinucleotídeos trifosfatados/ddNTPs (ddATP, ddTTP, ddGTP e ddCTP), que diferentemente dos dNTPs, são modificados, sendo cada grupo marcado com substâncias fluorescentes e não apresentam o grupo hidroxila que é necessário para estabelecer a ligação fosfodiéster com o nucleosídeo seguinte. Dessa forma, há a formação de fragmentos de DNA uma vez que ocorre a terminação da polimerização logo que um ddNTP é incluído aleatoriamente. Portanto, a incorporação desses marcadores com diferentes cores permite a diferenciação dos fragmentos de cadeia por sua respectiva fluorescência. Assim, através de uma eletroforese é possível fazer a separação dos fragmentos pelo seu peso molecular, que também identifica a fluorescência das bandas que atravessam um trecho do gel iluminado por um feixe laser. Deste modo, é possível indicar a sequência obtida da cadeia de DNA complementar à cadeia molde. Já o método de Maxam & Gilbert (não é muito usado atualmente) utiliza a própria molécula-alvo que é clivada diretamente. Primeiramente, o DNA alvo é marcado com isótopos radioativos, como 32P ou 35S. Em seguida, desnatura-se o DNA separando-o em duas cadeiras. O DNA é colocado em 4 tubos, onde cada um terá reações químicas específicas para a degradação de um ou dois desoxinucleotídeos, quebrando as cadeias em fragmentos, e consequentemente com a marcação do radioisótopo que precede ao desoxinucleotídeo degradado. Após isso, é feito a eletroforese em gel do conteúdo de cada tubo separadamente, separando os fragmentos por tamanho e indicando assim a sequência que corresponde a cada base degradada. Logo, os dois métodos se diferenciam pelo primeiro ser através de uma síntese enzimática, cujo crescimento da fita é interrompido pela adição de dideoxinucleotídeos, e o segundo por degradação química, onde substâncias químicas cortam a molécula de DNA em nucleotídeos específicos. Parabéns. <3 2) d) O gráfico acima mostra que quanto maior o peso molecular do fragmento de DNA, menor será a distância migrada pelo mesmo, a exemplo que o fragmento de menor peso com 1000 pares de bases se distanciou mais (5,8cm) e o fragmento com 23130 pares de bases se distanciou menos (2cm). Este fato foi visto na aula prática de eletroforese, sobre a corrida de corantes em gel de agarose. 0 1 2 3 4 5 6 7 1 10 100 1000 10000 100000 D is tâ n ci a m ig ra d a (c m ) Peso molecular (bp) Distância migrada em função do peso molecular
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