T3 microbiologia, Classificação dos Micro-organismos

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07/10/2018
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Classificação dos 
Micro-organismos
Profa. Maria Gardenny Ribeiro Pimenta
Chloroflexus (bactéria fototrófica) - Estromatólitos primitivos
(3,5 bilhões de anos)
Introdução
Fonte: http://espacociencias.com.pt
Bacteria 
e
Archaea
Eukarya
2 bilhões de anos
• Aumento do O2;
• Metabolismo respiratório do Domínio Bacteria;
• Enzimas (superóxido desmutase).
Endossimbiose
FUERST, J. A.; WEBB, R. I. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, v. 88, p. 8184-8188, 1991.
• Hipótese I: Linhagem com núcleo;
• Hipótese II: Hidrogênio.
Membrana citoplasmática
Núcleo
Mitocôndria
Parede 
celular
PROCARIOTOS EUCARIOTO
MADIGAN, M. T.; MARTINKO, J. M.; DUNLAP, P. V.; CLARK, D. P. Microbiologia de Brock. 12 ed., Porto Alegre: Artmed, 2010. TORTORA, G. J.; FUNKE, B. R.; CASE, C. L. Microbiologia. 10 ed., Porto Alegre: Artemed, 2012. 934p.
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TORTORA, G. J.; FUNKE, B. R.; CASE, C. L. Microbiologia. 10 ed., Porto Alegre: Artemed, 2012. 934p.
Charles Darwin (1809-1882) 
1859 – Seleção Natural
Evolução microbiana
Aristóteles (384 a.C. - 322 a.C.) 
Carl Linnaeus (1707-1778) 
Histórico
Ernest Haeckel (1834-1919)
Robert Whittaker (1920- 1980)
Roger Stanier (1916- 1982)
Carl Woese (1928) 
• Aristóteles - Plantas e animais;
• Carl Linnaeus - Reinos: Plantae e Animmalia;
• 1857: Carl von Nägeli - Reino Plantae incluir bactérias e fungos;
• 1866: Ernest Haeckel - Reino Protista (bactérias, fungos, algas e
protozoários);
• 1937: Edward Chatton - Introduz o termo procarioto;
• 1959: Reino Fungi;
•1961: Roger Stanier - definição atual de procariotos;
• 1968: Robert Murray - Reino Prokaryote;
• 1969: Robert Whittaker - Cinco Reinos;
• 1978: Carl Woese - Domínio.
Projeto Banco de Dados Ribossomais II (RDP-II)
• Distribuídos universalmente;
• Funcionamento constante;
• Suficientemente conservados;
• Tamanho adequado.
SSU rRNA
Carl Woese
http://rdp.cme.msu.edu
Ancestral 
Filogenia microbiana
TORTORA, G. J.; FUNKE, B. R.; CASE, C. L. Microbiologia. 10 ed., Porto Alegre: Artemed, 2012. 934p.
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Taxonomia
Táxis (arranjo ) + nomia (método) 
(grego)
Estabelecer relações entre um grupo e outro de organismos e os diferenciá-los. 
Fonte: http://www.ufrgs.br/paleodigital/Taxonomia.html
Classificação dos micro-organismos
Nomenclatura científica
Nomenclatura binomial = gênero + epíteto específico (espécie)
Ex: Escherichia coli
Bacillus cereus
Hierarquia
TORTORA, G. J.; FUNKE, B. R.; CASE, C. L. Microbiologia. 10 ed., Porto Alegre: Artemed, 2012. 934p.
International Code of Zoological Nomenclature 
(protozoários e parasitas)
International Code of Botanical Nomenclature 
(fungos e algas)
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology
The Prokaryotes
Entidades científicas 
Internatinal Committee on Taxonomy of Virus
(vírus)
Procariotos
Domínios: Archae e Bacteria
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TORTORA, G. J.; FUNKE, B. R.; CASE, C. L. Microbiologia. 10 ed., Porto Alegre: Artemed, 2012. 934p.
Relações filogenéticas dos procariotos Domínio Bacteria
Incluem bactérias Gram-negativas quimio-heterotróficas
Proteobactérias
Alfa-proteobactérias
• Baixos níveis nutricionais;
• Morfologia incomum;
• Bactérias de importância na agricultura.
Pelagibacter; Rickettsia; Ehrlichia; Acetobacter; Gluconobacter; Caulobacter; 
Hyphomicrobium; Rhizobium; Agrobacterium; Brucella; Nitrobacter
Caulobacter
Hyphomicrobium
Beta-proteobactérias
• Área em decomposição.
Burkholderia; Bordetella; Neisseria; Sphaerotilus, Zoogloea; Thiobacillus
Neisseria
Sphaerotilus
Gama-proteobactérias
• Maior subgrupo;
• Formas patogênicas, ambientais e industriais. 
Francisella; Azotobacter; Pseudomonas; Beggiatoa, Moraxella; Acinetobacter; 
Legionella; Coxiella; Vibrio; Escherichia; Salmonella; Proteus; Shigella; Serratia; 
Yersinia; Enterobacter; Haemophilus
PseudomonasProteus
Delta-proteobactérias
• Bactérias “predadoras”;
• Ciclo do enxofre. 
Bdellovibrio; Desulfovibrio; Myxococcales; Myxococcus
Bdellovibrio
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Epsilon-proteobactérias
• Forma helicoidal ou curva;
• Flagelos e são microaerofílicos.
Campylobacter; Helicobacter
Helicobacter
• Cyanobacteria (cianobactérias)
• Chlorobi (bactérias sulfurosas)
• Chloroflexi (bactérias verdes não sulfurosas)
Bactérias gram-negativas não proteobactérias
Incluem bactérias gram-negativas fotossintéticas.
Cianobactérias
• Firmicutes (baixos índices de G + C)
• Actinobacteria (altos índices de G + C)
Bactérias gram-positivas
Incluem dois grupos de bactérias Gram-positivas: 1) alto índice de G + C; 2) baixo
índice de G + C.
Mycobacterium; Gardnerella; Streptomyces; Corynebacterium; Propionibacterium 
Bacillus; Clostridium; Streptococcus; Staphylococcus
Domínio Archae
Pyrodictium abyssi
Crenarchaeota
Euryarchaeota
• Hipertermófilos
• Metano
• Halófilos extremos Thermoplasma
• Acidófilos
• Termofílicos
• Não tem parede celular