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25/11/2010 1 Microbiologia do Solo: Formação do Solo, Microrganismos, Funções CCB / MIP Disciplina: Microbiologia Agrícola Szabolcs (1994) 1.Introdução 25/11/2010 2 Formação do Solo - Solo = f (material de origem, clima, organismos, relevo e tempo) Material de origem (rochas) PROCESSOS TEMPO (controlado pelo relevo) CLIMA E ORGANISMOS Definição: Em agricultura e geologia, solo é a camada que recobre as rochas, sendo constituído de proporções e tipos variáveis de minerais de húmus 25/11/2010 3 Parte sólidaPoros 25% 25% 45% 5% Composição de um Solo Hipotético • Minerais: – Sílica (SiO2), Fe, Al, Ca,Mg, K – P, S, Mn, Na... • Matéria orgânica: origem vegetal, animal e microbiana – insolúvel (húmus): melhora a estrutura, libera nutrientes • efeito tampão, retenção de água – solúvel: produtos da degradação de polímeros complexos: • Açúcares, fenóis, aminoácidos Constituintes do Solo 25/11/2010 4 • Água – livre: poros do solo – adsorvida: ligada aos colóides (argilas) • Gases: CO2, O2, N2 ... – composição variável em função dos processos biológicos Constituintes do Solo 25/11/2010 5 • Sistemas biológicos: – plantas – animais – Microrganismos: grande diversidade e abundância Constituintes do Solo O Ambiente Solo (Fonte: Microbiologia de Brock, Madigan et al.) 25/11/2010 6 O Solo como Habitat Moreira & Siqueira, 2006 MACROFAUNA 25/11/2010 7 BACTÉRIAS FUNGOS 25/11/2010 8 NODULAÇÃO MICORRIZAS 25/11/2010 9 Interações tróficas no solo Raízes Restos Exsudatos Plantas Nematóides Fungos Bactérias Nematóides Colêmbolas Ácaros Protozoários Oligoquetas Colêmbolas predadoras Nematóides predadores Insetos predadores Ácaros predadores Mamíferos e pássaros Siqueira & Moreira (2002) Trannin & Siqueira (2003) A BIOTA DO SOLOA BIOTA DO SOLO PARTÍCULAS SOZINHAS NÃO FAZEM UM BOM SOLO... Em cada kg de solo fértil tem-se em torno de: • 500 bilhões de bactérias • 10 bilhões de actinobacterias • 1 bilhão de fungos • 0,5 bilhão de invertebrados microrcópicos • 1000 km de hifas e vários de raízes • Numerosos vertebrados macroscópicos • Não são estáticos e sim muito dinâmicos • São bons aliados e uma grande riqueza natural • São ignorados devido ao caráter microscópico • São mais conhecidos pelos efeitos deletérios Os microrganismos garantem a qualidade do solo 25/11/2010 10 Organismos/g de solo x103 Profundidade (cm) Bactérias aeróbicas Bactérias anaeróbicas Actinomicetos Fungos Algas* 3 - 8 7800 1950 2080 119 25 20 - 25 1800 379 245 50 5 35 - 45 472 98 49 14 0,5 65 - 75 10 01 05 06 0,1 135 - 145 01 0,4 - 03 - *Inclui cianobactérias Distribuição de microrganismos em vários horizontes do perfil (Starc, 1942 apud Alexander, 1977) Classificação Ecológica dos Microrganismos do Solo - Autóctones (indígenas) = população de microrganismos pouco afetada pela adição de nutrientes ao solo, vivendo às custas dos resíduos em estágios avançados de decomposição - Zimógenes (fermentativos) = população de microrganismos estimulada pela adição de resíduos ao solo, principalmente os resíduos facilmente decomponíveis 25/11/2010 11 • Bactérias: – grupo mais numeroso e mais diversificado 3 x 106 a 5 x 108 por g de solo seco • limitações impostas pelas discrepâncias entre técnicas • heterotróficos são mais facilmente detectados Gêneros mais freqüentes: • Bacillus, Clostridium, Arthrobacter, Pseudomonas, Nocardia, Streptomyces, Micromonospora, Rizóbios • Cianobactérias: pioneiras, fixação de N2 A microbiota do solo Streptomyces “Mais de 4 000 espécies bacterianas diferentes em 100 g de solo” Torsvik et al. 1994 (Técnicas de reassociação de DNA extraído do solo). Menos de 1% das espécies microbianas conhecidas (não cultiváveis –não crescem em meio de cultura, e.g. fungos micorrízicos arbusculares) Solo Heterogêneo, dinâmico e complexo - Grande parte dos recursos genéticos desconhecida Função destes microorganismos??? 25/11/2010 12 • Fungos: – 5 x 103 - 9 x 105 por g de solo seco – limitados à superfície do solo – favorecidos em solos ácidos – ativos decompositores de tecidos vegetais – melhoram a estrutura física do solo Gêneros mais freqüentes: • Penicillium, Mucor, Rhizopus, Fusarium, Aspergillus, Trichoderma A microbiota do solo • Algas – 103 - 5 x 105 por g de solo seco – abundantes na superfície – acumulação de matéria orgânica: solos nus, erodidos • Protozoários e vírus - equilíbrio das populações - predadores de bactérias - parasitas de bactérias, fungos, plantas, ... A microbiota do solo 25/11/2010 13 Processos Biológicos do Solo: Suas Inter‐relações e Funções no Ecossistema Siqueira & Trannin, 2003 -(Constanza et al. Nature,1997:Valor dos serviços dos ecossistemas terrestres e capital natural: U$34 trilhões, Ciclagem de nutrientes global anual U$17 trilhões (Inclui a FBN) - Decomposição da matéria orgânica e produção de húmus - Controle biológico de patógenos - Alteração das características físicas do solo (e.g. agregação) - Produção de metabólitos diversos: antibióticos, ácidos orgânicos, hormônios, alelopáticos - Decomposição de xenobióticos - Nutrição vegetal. Fixação biológica de N2 Soja no Brasil: Economia de US$ 3.0 bilhões anual Funções dos Microrganismos 25/11/2010 14 REDUNDÂNCIA FUNCIONAL: Várias espécies de microrganismos realizam o mesmo processo, i.e., têm a mesma função. – Garante RESILIÊNCIA (recuperação) dos processos no solo- Cada espécie microbiana realiza várias funções. E. g. Azospirillum brasilense , Bradyrhizobium japonicum – fixadores de N2 e desnitrificadores. Outros fixadores de N2 participam dos Ciclos do C, P, S, etc. Visão Esquemática do Solo como uma Máquina Decompositora Disponibilização de Nutrientes - Mineralização - Imobilização - Oxi-redução S0 + H2O + 1,5O2→ H2SO4→ 2H+ + SO42- MnO2 + 4H+ → Mn2+ + 2H2O - Solubilização Ca5OH(PO4)3 + H+ → 5Ca2+ + H2O + 3PO43‐ AlPO4 + 2H+ → Al3+ + H2PO4‐ FePO4 + 2H+ → Fe2+ + H2PO4‐ - Fixação Biológica de Nitrogênio - Micorrizas 25/11/2010 15 Contribuição dos Microrganismos para a Formação ou Estabilização de Agregados do Solo Modificado de Rillig & Mummey (2006) Miller & Jastrow (1992) Microrganismos e Agregação do solo. Fungos filamentosos Polissacarídeos e hifas de fungos como agentes agregantes de partículas do solo (Robert & Chenu, 1992) 25/11/2010 16 1 2 Derxia gumosa – isolada de raízes de Oryza perenne em solo de várzea da região Amazônica. 1- Células em microscópio com contraste de fase, notar goma em volta das células. 2 – Aspecto da colônia em placas. Cortesia F.M.S. Moreira Fatores Ambientais (Físico-químicos) que Afetam os Microrganismos do Solo - Substratos e Fontes de Energia Moreira & Siqueira, 2006 25/11/2010 17 Fatores Ambientais (Físico-químicos) que Afetam os Microrganismos do Solo - Nutrientes Minerais Moreira & Siqueira, 2006 • Crescimento microbiano • Constituição de monômeros e macromoléculas • Síntese de enzimas e outros biopolímeros • Estabilização da parede celular • Estrutura terciária do DNA e do RNA • Divisão celular • Interações simbióticas, etc. Fatores Ambientais (Físico-químicos) que Afetam os Microrganismos do Solo - Fatores de Crescimento Moreira & Siqueira, 2006 25/11/2010 18 Fatores Ambientais (Físico-químicos) que Afetam os Microrganismos do Solo - pH Moreira & Siqueira, 2006 Predomínio de Bactérias Predomínio de Fungos Moreira & Siqueira, 2006 Influência do pH na Incidência da Sarna da Batata (Streptomyces scabies)25/11/2010 19 Fatores Ambientais (Físico-químicos) que Afetam os Microrganismos do Solo - Umidade do Solo Fatores Ambientais (Físico-químicos) que Afetam os Microrganismos do Solo - Temperatura e Radiação Solar A tiv id ad e da P op ul aç ão M ic ro bi an a, % Estações do Ano 25 - 100 - 50 - 25 - Inverno Primavera OutonoVerão 25/11/2010 20 Fatores Ambientais (Físico-químicos) que Afetam os Microrganismos do Solo - Efeitos Antropogênicos Interações entre Organismos que Influenciam a Atividade, Ecologia e Dinâmica dos Microrganismos do Solo Moreira & Siqueira, 2006 25/11/2010 21 RIZOSFERA Hiltner (1904) – zona de influência das raízes- 0,01 a 3 mm da superfície Rizosfera: O Paraíso dos Microrganismos do Solo (Antagonistas e Patógenos) Rizosfera A Grande Maioria é Benéfica O Efeito Rizosférico 25/11/2010 22 Compostos Excretados pelas Plantas na Rizosfera (Rizodeposição) Modificado de Alexander, 1977; Curl & Truelove, 1986 Actinobactérias Actinobactérias (R) (S) 25/11/2010 23 A Redução da Diversidade Facilita o Desequilíbrio Biológico nos Agrossistemas Microrganismos Antagonistas Fitopatógenos = Espécies fúngicas dos gêneros Penicillium, Aspergillus, Fusarium, Mucor, Rhizopus, Stachybotris, Alternaria, etc Efeito do tempo de monocultivo no favorecimento de fungos fitopatogênicos para as culturas do trigo e maçã (Vancura & Kunc, 1988, 1989) Fungos Patógenos (% total) Fungos Patógenos Actinobacterias Processos Biológicos do Solo: Suas Inter‐relações e Funções no Ecossistema Siqueira & Trannin, 2003
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