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BIOQUÍMICA LICENCIATURA 2017 Aula 1 – biomoléculas, grupos funcionais, reações e termodinâmica The decendent of man (1871) Devemos, no entanto, reconhecer, como parece-me, aquele homem c o m t o d a s a s s u a s n o b r e s qualidades ... ainda carrega em s e u q u a d r o c o r p o r a l o s e l o indelével de sua humilde origem. Charles Darwin The logic life: A history of heredity (1970) Com a célula, a biologia descobriu seu átomo… Para caracterizar a vida era essencial estudar a célula e analisar seu esforço: destacar os denominadores comuns, necessários para a vida de cada célula alternat ivamente, para identificar diferenças associadas ao desempenho de funções especiais. Francis Jacob • Quais moléculas estão presentes nos seres vivos e em quais proporções? • Quais são as estruturas destas moléculas e quais as forças que estabilizam suas estruturas? • Quais são as propriedades químicas e reatividades em isolamento? • Como elas interagem umas com as outras? • Como e onde as biomoléculas das primeiras células se originaram? Elementos essenciais à vida Macroelemento sMicroelemento s Ligações químicas dos elementos mais abundantes nos organismos Versatilidade das ligações do carbono Ligação covalente Geometria do átomo de carbono Grupos funcionais em biomoléculas Grupos funcionais determinam propriedades químicas das biomoléculas • As l igações covalentes e os grupos funcionais são de grande importância para o desempenho de suas funções; • Contudo, o arranjo tridimensional da molécula também ganha importância – é a estereoquímica; • A configuração de uma molécula é o a r ran jo espac ia l de uma mo lécu la orgânica que é conferido pela: presença de duplas l igações ou por centros quirais, ao redor dos quais os grupos substituintes estão arranjados em uma seqüência específica; Configuração da molécula Molécula da visão Moléculas quirais e aquirais Pauster e a atividade óptica Configuração R e S • Conformação molecular refere-se ao arranjo dos grupos substituintes que são livres para assumir diferentes posições no espaço, sem quebra de ligação devido a liberdade de rotação da ligação. Configuração e conformação definem estruturas das biomoléculas Cristalografia de raio X e Ressonância magnética nuclear RMNDifração de raio X Reatividade química • A forção de ligação está associada às propriedades dos átomos que dela participam. Nas células ocorrem cinco tipos gerais de transformações químicas • Reações de oxi-redução; • Reações de formação e quebra de ligações carbono carbono; • Reações que rearranjam a estrutura das ligações ao redor de um ou mais átomos de carbono; • Reações de Transferência de grupos funcionais; • Reações onde duas moléculas se condensam com a eliminação de uma molécula de água. Reações de oxidação redução Ligações carbono carbono são quebradas e formadas por Reações de substituição nucleofílica Grupos que agem como nucleófilos nas células Classes de substituição (ataque) nucleofílica: Sn1 e Sn2 Reações de rearranjo das ligações ao redor de um ou mais átomos de carbono Reações de transferências de grupos funcionais Reações de condensação e hidrólise Células são constituídas por macromoléculas Macromoléculas são formadas por monômeros Proteínas Ácidos nucleicos Lipídios Carboidrato Cada precursor gera muitos outros tipos de biomoléculas Hierarquia estrutural Quatro tipos de interações não covalentes estão presentes em moléculas no interior das células • Ligação de hidrogênio • Atrações de Van der Waals • Ligação iônica • Interação hidrofóbica Ligação de hidrogênio Ligação de Hidrogênio • Atrações de Van der Waals – a nuvem elétrons de um átomo de molécula apolar desloca-se criando um dipolo. Tais dipolos criam polaridades transitórias em átomos próximos. São interações fracas mais que apresentam resultado significativo em moléculas com muitos átomos. Interação de Van der Waals • Ligação iônica – é uma atração eletrostática entre átomos de cargas opostas; Interação iônica • Interação hidrofóbica - Esta força é causada por um empurrão de superfícies apolares fora da rede de água, onde fisicamente interferem com as interações altamente favoráveis entre moléculas de água. Interação Hidrofóbica Ligações químicas covalentes e não covalentes A produção de energia e consumo no metabolismo Ao organismos nunca estão em equilíbrio com seu ambiente A composição molecular reflete o estado estacionário dinâmico Organismos transferem energia e matéria do meio ambiente Fluxo de elétrons fornecem energia para os organismos
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