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UENF, CBB, LQFPP Prof. Gustavo Rezende LQFPP, P5, salas 222/223 Bioquímica II – Metabolismo Medicina Veterinária Horário: 4ª feira, 08 as 12Hs e-mail da disciplina: bioqui_gusrez@yahoo.com.br senha: Gibbs1401 Atenção! Para o entendimento de Bioquímica II é necessário utilizarmos conhecimentos adquiridos em Bioquímica I! Em Bioquímica II estudaremos o metabolismo O que é o Metabolismo? É o conjunto de reações enzimáticas que ocorrem dentro das células. • Obter energia química pela degradação de nutrientes ou capturando energia solar • Converter os nutrientes em pequenas moléculas (precursoras) • Organizar as pequenas moléculas em polímeros ou em moléculas complexas • Formar e degradar biomoléculas necessárias a funções celulares especializadas, como lipídios de membrana, mensageiros intracelulares e pigmentos. O que é o Metabolismo? É o conjunto de reações enzimáticas que ocorrem dentro das células. O metabolismo busca: Três conceitos importantes: 1) Via metabólica e metabólitos 2) Catabolismo 3) Anabolismo Metabolismo: Uma via metabólica simples: Uma via metabólica simples: Uma via metabólica leva a transformação de um composto em outro (no caso de A a F), através de uma série de reações enzimáticas. Cada etapa (cada reação) leva a uma pequena mudança química no composto. Uma via metabólica simples: Cada um desses compostos (A, B, C, D, E ou F) são chamados de metabólitos. Um metabólito é algum intermediário dentro do metabolismo. O metabolismo é dividido em duas partes: Catabolismo – é a fase degradativa do metabolismo, na qual moléculas de nutrientes (carboidratos, lipídios e proteínas) são convertidas em produtos menores e mais simples (ex: CO2, ácido láctico). As vias catabólicas liberam energia. Parte da energia é conservada na forma de ATP e carreadores de elétrons reduzidos (NADH, NADPH e FADH2), porém parte é dissipada na forma de calor. Catabolismo – é a fase degradativa do metabolismo, na qual moléculas de nutrientes (carboidratos, lipídios e proteínas) são convertidas em produtos menores e mais simples (ex: CO2, ácido láctico). As vias catabólicas liberam energia. Parte da energia é conservada na forma de ATP e carreadores de elétrons reduzidos (NADH, NADPH e FADH2), porém parte é dissipada na forma de calor. Anabolismo (Biossíntese) – precursores pequenos e simples são usados para a produção de moléculas maiores e mais complexas (ex: lipídios, DNA, proteínas e polissacarídeos). Tais reações requerem energia, geralmente na forma de grupamentos fosforil transferidos do ATP e de poder redutor transferido do NADH, NADPH e FADH2. O metabolismo é dividido em duas partes: Anabolismo Catabolismo O metabolismo é dividido em duas partes: Catabolismo, Anabolismo e tipos de vias metabólicas: Vias metabólicas podem ser lineares, ramificadas ou cíclicas Em geral vias catabólicas são convergentes e vias anabólicas são divergentes. Catabolismo, Anabolismo e tipos de vias metabólicas: Sobre a produção e gasto de energia: Dois conceitos importantes: Bioenergética e Termodinâmica Bioenergética: É o estudo quantitativo das transduções de energia que ocorrem nas células vivas e a natureza e função dos processos químicos envolvidos nestas transduções. A bioenergética obedece as leis da termodinâmica. Sobre a produção e gasto de energia: Dois conceitos importantes: Bioenergética e Termodinâmica Termodinâmica: é a ciência que estuda as relações entre o calor e outras formas de energia. Bioenergética: É o estudo quantitativo das transduções de energia que ocorrem nas células vivas e a natureza e função dos processos químicos envolvidos nestas transduções. A bioenergética obedece as leis da termodinâmica. Relação entre calor e vida? Sobre Termodinâmica: ?? De alguma forma os animais transformam combustíveis químicos (comida) em calor e tal processo é essencial à vida. Sobre Termodinâmica: “…No geral, respiração não é nada se não uma combustão lenta do carbono e do hidrogênio, que é completamente similar ao que ocorre em uma lâmpada acesa ou uma vela, e que, deste ponto de vista, os animais que respiram são verdadeiros corpos combustíveis que queimam e se consomem… Pode-se dizer que a tocha da vida acende a sí própria no momento em que o bebê respira pela primeira vez, e não se extingue, exceto na morte.” Sobre Termodinâmica: Hoje já sabemos mais sobre a “tocha da vida”, que são as reações bioquímicas para a transdução de energia. Tais reações obedecem às mesmas leis físicas que regem todos os outros processos físicos. É preciso entender essas leis e como se aplicam ao fluxo de energia. Sobre Termodinâmica: Existem quatro leis da termodinâmica (veremos duas): 1a Lei da Termodinâmica – Princípio da Conservação da Energia: “Para qualquer transformação/ alteração física ou química, a quantidade total de energia no universo se mantém constante; a energia pode mudar de forma ou pode ser transportada de uma região para a outra, mas não pode ser criada ou destruída.” 1a Lei da Termodinâmica – Princípio da Conservação da Energia: “Para qualquer transformação/ alteração física ou química, a quantidade total de energia no universo se mantém constante; a energia pode mudar de forma ou pode ser transportada de uma região para a outra, mas não pode ser criada ou destruída.” Nada se cria, nada se perde, tudo de transforma. 2a Lei da Termodinâmica: “Em todos os processos naturais a entropia no universo aumenta.” E o que é entropia? Tem a ver com perda de calor e probabilidade de distribuição de partículas em um sistema fechado. A entropia pode ser, de uma certa forma, entendida como o grau de desordem de um sistema. Vem do grego “transformação”. 2a Lei da Termodinâmica: “Em todos os processos naturais a entropia no universo aumenta.” E o que é entropia? Tem a ver com perda de calor e probabilidade de distribuição de partículas em um sistema fechado. A entropia pode ser, de uma certa forma, entendida como o grau de desordem de um sistema. Vem do grego “transformação”. A 2a Lei da Termodinâmica diz então: O universo sempre tende à desordem (por exemplo: moléculas complexas degradam-se em moléculas simples). 2a Lei da Termodinâmica: “Em todos os processos naturais a entropia no universo aumenta.” E o que é entropia? Tem a ver com perda de calor e probabilidade de distribuição de partículas em um sistema fechado. A entropia pode ser, de uma certa forma, entendida como o grau de desordem de um sistema. Vem do grego “transformação”. A 2a Lei da Termodinâmica diz então: O universo sempre tende à desordem (por exemplo: moléculas complexas degradam-se em moléculas simples). Alexandre Cherman: A entropia pode ser entendida como: “Você está jogando um jogo com o universo no qual você sempre perde”. 2a Lei da Termodinâmica: Seta do tempo moléculas de gás em um recipiente entropia menor entropia maior 2a Lei da Termodinâmica: Oxidação da glicose Ocorre um aumento do número de moléculas e uma substância sólida é convertida em moléculas líquidas e gasosas, que possuem maior liberdade de movimentação, maior desordem molecular. E aí a entropia aumenta. Os seres vivos são uma coleção de moléculas muito mais organizadas e complexas do que o meio que os circula. Eles mantêm e produzem ordem. Então… eles violam a 2a Lei da Termodinâmica?! Os seres vivos são uma coleção de moléculas muito mais organizadas e complexas do que o meio que os circula. Eles mantêm e produzem ordem. Então… eles violam a 2a Lei da Termodinâmica?! Não! Fonte de energia “eterna”para manutenção da vida: Os seres vivos se mantêm ordenados captando energia do ambiente ao redor. Parte dessa energia retorna ao ambiente em formas “não usáveis”, como o calor e a entropia. Sol Entropia sempre aumentando: Os seres vivos se mantêm ordenados captando energia do ambiente ao redor. Parte dessa energia retorna ao ambiente em formas “não usáveis”, como o calor e a entropia. Os seres vivos são uma coleção de moléculas muito mais organizadas e complexas do que o meio que os circula. Eles mantêm e produzem ordem. Mas ao mesmo tempo eles não violam a 2a Lei da Termodinâmica... Glicose + Pi -> Glicose-6-fosfato (diminuiu a entropia). Os seres vivos são uma coleção de moléculas muito mais organizadas e complexas do que o meio que os circula. Eles mantêm e produzem ordem. Mas ao mesmo tempo eles não violam a 2a Lei da Termodinâmica... Mas e as reações anabólicas (de biossíntese) dentro das células? Os seres vivos são uma coleção de moléculas muito mais organizadas e complexas do que o meio que os circula. Eles mantêm e produzem ordem. Mas ao mesmo tempo eles não violam a 2a Lei da Termodinâmica... As energias livres de reações acopladas são aditivas... Glicose + Pi -> Glicose-6-fosfato (diminuiu a entropia). Reações enzimáticas: ubstrato roduto Reações enzimáticas: Energia livre de Gibbs (G): energia que pode realizar trabalho durante a reação em temperatura e pressão constantes. ubstrato roduto Reações enzimáticas: Energia livre de Gibbs (G): energia que pode realizar trabalho durante a reação em temperatura e pressão constantes. ubstrato roduto Reações enzimáticas: variação na energia livre padrão bioquímica = ΔG’O Lembrando o que significa delta (Δ): Valor final – Valor inicial. ubstrato roduto variação na energia livre padrão bioquímica = ΔG’O Reações enzimáticas: O substrato (S) possui mais energia que o produto (P). ubstrato roduto Energias livres de reações acopladas: Voltaremos a essa reação daqui a pouco... Variação na energia livre: ΔG ΔG negativo: reação exergônica, espontânea, libera energia ΔG positivo: reação endergônica, não-espontânea, consome energia Variação na energia livre: ΔG ΔG negativo: reação exergônica, espontânea, libera energia ΔG positivo: reação endergônica, não-espontânea, consome energia Variação na energia livre: ΔG ∆∆∆∆G = ∆∆∆∆H- T∆∆∆∆S Entalpia (H) – É o conteúdo de calor de um sistema que está reagindo. Reflete o número e os tipos de ligações químicas nos reagentes e produtos. Entropia (S) – É a expressão quantitativa da desordem no sistema. Quando os produtos são mais desorganizados do que reagentes, diz-se que a reação procedeu com ganho de entropia. T – Temperatura absoluta em Kelvin. Variação na energia livre: ΔG ∆∆∆∆G = ∆∆∆∆H- T∆∆∆∆S Variação na energia livre: ΔG Unidades de ΔG e ΔH: Joules/mol ou Caloria/mol (significando energia ou trabalho por quantidade de moléculas). Unidades de ΔS: Joule/(mol . K) ou Caloria/ (mol . K) (significando energia ou trabalho por quantidade de moléculas vezes a temperatura). ∆∆∆∆G = ∆∆∆∆H- T∆∆∆∆S Energia livre padrão: Go Existem duas “∆Go”... Energia livre padrão: Go ∆Go = variação na energia livre em condições “padrão” (298 K, 1 atm, concentrações de solutos a 1 M) ∆G’o = variação na energia livre padrão bioquímica = ∆Go em pH 7,0 e em solução aquosa. É a variação na energia livre padrão bioquímica (∆G’o) que utilizaremos nos estudos de metabolismo. A variação na energia livre padrão (∆Go) está diretamente relacionada com a constante de equilíbrio. Reação: aA + bB cC + dD a, b, c, d são o número de moléculas de A, B, C, D. A variação na energia livre padrão (∆Go) está diretamente relacionada com a constante de equilíbrio. Reação: aA + bB cC + dD a, b, c, d são o número de moléculas de A, B, C, D. Um sistema reage até atingir o equilíbrio químico, quando a velocidade da reação para formar produtos é igual a velocidade para formar reagentes. No estado de equilíbrio as concentrações de produtos e reagentes definem a constante de equilíbrio (Keq). A variação na energia livre padrão (∆Go) está diretamente relacionada com a constante de equilíbrio. Reação: aA + bB cC + dD a, b, c, d são o número de moléculas de A, B, C, D. A constante de equilibro é dada pela equação: Keq = [C]c[D]d / [A]a[B]b [A], [B], [C], [D] é a concentração molar dos componentes da reação no ponto de equilíbrio No padrão bioquímico (pH 7,0 e solução aquosa) temos então: K’eq K’eq e ΔG’o são constantes físicas características de cada reação. Existe uma relação entre elas: No padrão bioquímico (pH 7,0 e solução aquosa) temos então: K’eq K’eq e ΔG’o são constantes físicas características de cada reação. Existe uma relação entre elas: Simplificando: Relação entre ∆G’0 e Keq’ Se: Keq’> 1 Keq’= 1 Keq’< 1 Então ∆G’o < 0 ∆G’o = 0 ∆G’o > 0 Simplificando: Forma direta: na direção da formação dos produtos. Forma inversa: na direção da formação dos reagentes (substratos). As alterações de energia livre padrão são aditivas... Acoplamento!!!!! Bom, na verdade temos três energias livres... ∆G’o = Energia livre padrão bioquímica ∆Go = Energia livre padrão ∆G = Energia livre ∆G’o = Energia livre padrão bioquímica (constante) ∆Go = Energia livre padrão (constante) ∆G = Energia livre (encontrado na vida real) Bom, na verdade temos três energias livres... ∆G’o = Energia livre padrão bioquímica (constante) O ∆G’o Só nos conta em qual direção uma reação vai quando a concentração inicial de cada composto é de 1M. ∆G = Energia livre (encontrado na vida real) A variação real de energia livre depende das concentrações dos substratos e produtos. O ∆G (na vida real) de qualquer reação procedendo espontaneamente para o equilíbrio é sempre negativo, torna-se menos negativo com o andar da reação e é zero no ponto de equilíbrio, indicando que nenhum trabalho mais pode ser realizado. Aí que entra a lei da ação das massas e a equação: Quando C e D são consumidos, a relação produtos/substratos é menor que 1,0 e o valor de ln será negativo, o que diminui o valor de ∆G. Essa lei diz quer a taxa de uma reação é proporcional ao produto das concentrações das moléculas participantes (ou seja, a concentração (massa) de substratos e produtos determina o ∆G de uma determinada reação). Sobre a lei da ação das massas. Voltando ao metabolismo: Mapa metabólico: Toda a complexidade do metabolismo é levada a cabo por um pequeno número de tipos de reações... Toda a complexidade do metabolismo é levada a cabo por um pequeno número de tipos de reações... Existem apenas 6 classes de enzimas! Classificação das Enzimas: Sobre ATP e outros compostos fosforilados: A síntese de degradação do ATP é central para o metabolismo: ATP ADP + Pi Mas... o que é o ATP? ATP: adenosina trifosfato ATP: adenosina trifosfato É um nucleosídeo de adenina mais três fosfatos. ATP ADP + Pi + ATP ADP Pi Fosfato inorgânico: O fosfato inorgânico (Pi) é um ion de fosfato livre em solução, assim chamado para diferir dos fosfato encontrados em biomoléculas (ATP, ADP, etc). Na situação fisiológica (pH 7,0) o Pi consiste de uma mixtura de íons HPO2-4 e H2PO-4. forma completamente ionizada (PO3-4) Pi: fosfato inorgânico Sobre ATP e outros compostos fosforilados: O ATP fornece energia por transferência de grupo, e não simplesmente pela hidrólise. Reação escrita em uma etapa Reação escritaem uma etapa Reação real, em duas etapas Sobre ATP e outros compostos fosforilados: Além do ATP, outros compostos fosforilados e tioésteres também possuem altas valores de energia livre de hidrólise: Fosfoenolpiruvato (PEP) 1,3 Bifosfoglicerato Acetil-CoA (Tioéster) Fosfoenolpiruvato (PEP) 1,3 Bifosfoglicerato Acetil-CoA (Tioéster) O que é um tioéster? É quando um enxofre substitui um oxigênio em uma ligação ester: ester tioéster: Acetil-CoA Sobre ATP e outros compostos fosforilados: Compostos de alta energia e compostos de baixa energia: Reações de Oxidação-Redução: Assim como a transferência de grupos fosforil é central para o metabolismo, a transferência de elétrons é igualmente importante. Reações de Oxidação-Redução: Assim como a transferência de grupos fosforil é central para o metabolismo, a transferência de elétrons é igualmente importante. Essa transferência de elétrons ocorre em reações de oxidação-redução, onde duas espécies trocam elétrons: quem perde elétron é oxidado, quem recebe elétrons é reduzido. Reações de Oxidação-Redução: Assim como a transferência de grupos fosforil é central para o metabolismo, a transferência de elétrons é igualmente importante. Essa transferência de elétrons ocorre em reações de oxidação-redução, onde duas espécies trocam elétrons: quem perde elétron é oxidado, quem recebe elétrons é reduzido. Dica: Receber Elétrons = REduzido. Reações de Oxidação-Redução: E porque um composto oxidado “perde” elétrons? Oxigênio Reações de Oxidação-Redução: E porque um composto oxidado “perde” elétrons? Aumento de eletronegatividade Oxigênio é um dos elementos mais eletronegativos Exemplo de reação de Oxidação-Redução: Exemplo de reação de Oxidação-Redução: Quais compostos são mais oxidados? Quais são os mais reduzidos? Quais compostos são mais oxidados? Quais são os mais reduzidos? Exemplo de reação de Oxidação-Redução: Definições: Oxidação significa a adição de oxigênio na molécula ou a perda de hidrogênio da molécula. Redução significa a adição de hidrogênio na molécula (Receber Elétron) ou a perda de oxigênio da molécula. Exemplo de reação de Oxidação-Redução: Quais compostos são mais oxidados? Quais são os mais reduzidos? Quais compostos são mais oxidados? Quais são os mais reduzidos? Exemplo de reação de Oxidação-Redução: Formas mais reduzidas Formas mais oxidadas O metabolismo requer transportadores de elétrons especializados: Coenzimas carreadoras de elétrons: NAD+ NADP+ FAD FMN - Nicotinamida Adenina Dinucleotídeo - Nicotinamida Adenina Dinucleotídeo Fosfato - Flavina Adenina Dinucleotídeo - Flavina Mononucleotídeo O metabolismo requer transportadores de elétrons especializados: Coenzimas carreadoras de elétrons: NAD+ NADP+ FAD FMN Essas quatros moléculas sofrem reduções e oxidações reversíveis nas reações de transferência de elétron formas oxidadas formas reduzidasNADH NADPH O metabolismo requer transportadores de elétrons especializados: Coenzimas carreadoras de elétrons: NAD+ NADP+ FAD FMN solúveis ligados em proteínas, como grupos prostéticos, forte ou covalentemente O metabolismo requer transportadores de elétrons especializados: O metabolismo requer transportadores de elétrons especializados: Nicotinamida Adenina Dinucleotídio é a co-enzima da maioria das oxidações biológicas (oxidado) No NADP+ esse grupo hidroxil é esterificado com fosfato. Adenina Nicotinamida Adenina Dinucleotídio é a co-enzima da maioria das oxidações biológicas (oxidado) No NADP+ esse grupo hidroxil é esterificado com fosfato. Adenina Nicotinamida Nicotinamida Adenina Dinucleotídio é a co-enzima da maioria das oxidações biológicas NAD+ recebe um íon hidreto e vira NADH Íon hidreto: H- (2 elétrons, 1 próton) + H+ (reduzido) (oxidado) No NADP+ esse grupo hidroxil é esterificado com fosfato. Adenina Nicotinamida Nicotinamida Adenina Dinucleotídio é a co-enzima da maioria das oxidações biológicas + H+ Implicação (quase) prática: (reduzido) (oxidado) No NADP+ esse grupo hidroxil é esterificado com fosfato. Adenina
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