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REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA EM PROCARIOTOS 1 2 Mecanismos que regulam o processo de transcrição do DNA para sintetizar RNA e a tradução desses para gerar proteínas Regulação da expressão gênica Abordagens... A estrutura gênica Controle da expressão (transcrição) Controle da Expressão (tradução) 3 Promotor Região Codificadora Terminador DNA RNA PROTEÍNA Ribossomo Estrutura de um GeneA estrutura de um gene de procarioto 4 Promotor Região Codificadora Sítio de PoliA hnRNA AAAAAAAAAA mRNA AAAAAAAAAA Intron Exon D N A R N A ESTRUTURA DE UM GENE DE EUCARIOTOA estrutura de um gene de eucarioto 5 Organização na forma de operons TerminadorPromotor/operador Regiões Codificadoras OPERON E. coli RNA MENSAGEIRO POLICISTRÔNICO 6 Porque Regular????? Qual o custo (em termos de energia e recursos) para fazer uma proteína? Para uma proteína de tamanho médio (300 aminoácidos)? - 1350 moléculas de ATP - 1650 átomos de carbono - 540 átomos de Nitrogênio E. coli tem cerca de 4000 genes que codificam aproximadamente 2000 proteínas. Imaginem o custo se todas essas proteína fossem produzidas ao mesmo tempo ! 7 Quem, Quando e Quanto: Isso é regulação Gênica A síntese de proteínas requer grandes quantidades de energia assim, os procariotos desenvolveram mecanismos elaborados para controlar a escolha de quais proteínas são feitas em diferentes momentos, sob diferentes condições ambientais. 8 Fatores que determinam a quantidade de cada proteína Concentração de mRNA Eficiência da tradução do mRNA Estabilidade da proteína extraída 9 Genes constitutivos Genes que são constantemente expressos Genes induzíveis Genes cuja expressão varia de acordo com as condições da célula 10 11 Regulação primária: RNA Polimerase Genes constitutivos: interação promotor/RNA polimerase Genes induzíveis: proteínas reguladoras afetam a transcrição pela RNA polimerase O CONTROLE TRANSCRICIONAL EXERCIDO POR CASCATA DE FATORES SIGMA 12 RNA Polimerase Fator (sigma) Core Holoenzima ’ 13 Especificidade de ligação da RNA polimerase nos diferentes promotores é dada pela interação com diferentes espécies de fatores sigma BACTERIÓFAGO SPO1 se multiplica em Bacillus subtilis TRANSCRIÇÃO DOS GENES DE EXPRESSÃO TARDIA 28 33 34 Genes de expressão imediata Genes de expressão intermediária Genes de expressão tardia RNA pol Fator a gp28 gp33/34 14 Bacillus subtilis ESPORULAÇÃO Seqüência de genes é expressa com a finalidade de formar o esporo 15 OS MECANISMOS DE CONTROLE TRANSCRICIONAL 16 Controle por ativadores e repressores •Indução •Repressão CONTROLE POSITIVO Ativador ligado facilita a transcrição •Indução •Repressão CONTROLE NEGATIVO Repressor ligado inibe a transcrição 17 Indução REGULAÇÃO NEGATIVA Repressor ligado inibe a transcrição REPRESSOR INATIVO indutor 18 Repressão REGULAÇÃO NEGATIVA Repressor ligado inibe a transcrição REPRESSOR INATIVO Co-repressor 19 20 REGULAÇÃO NEGATIVA: a transcrição pode ser favorecida ou bloqueada, dependendo da ação da molécula sinal sobre a proteína repressora 21 REGULAÇÃO POSITIVA: a expressão está na dependência da presença das proteínas reguladoras ativadoras. Os ativadores unem-se a sítios adjacentes ao promotor, aumentando a afinidade da RNA Polimerase por ele e favorecendo a transcrição Indução REGULAÇÃO POSITIVA Ativador ligado facilita a transcrição ATIVADOR INATIVADO INDUTOR 22 Repressão REGULAÇÃO POSITIVA Ativador ligado facilita a transcrição ATIVADOR INATIVADO Co-repressor 23 24 SISTEMAS INDUZÍVEIS: expressão dos genes somente ocorre quando da presença de um indutor SISTEMAS REPRIMÍVEIS: a expressão somente ocorre na ausência do co-repressor. Operon lac 25 Regulação do operon lac CONTROLE NEGATIVO REPRESSOR CONTROLE POSITIVO COMPLEXO CAP:cAMP 26 Estrutura do Operon lac Operon Lac: ~6000 bp 27 Metabolismo da lactose PERMEASE TRANSACETILASE -GALACTOSIDADE Operon lac - Enzimas 28A lactose induz a síntese de enzimas envolvidas no seu próprio metabolismo PERMEASE CITOPLASMA PERIPLASMA 29 Transporta lactose -Galactosidase 30 Clivagem da lactose Ausência de lactose Presença de lactose C o n tr o le n e g a ti v o d o O p e ro n la c 31 Controle positivo do operon lac Glicose AMPc CAP Proteína ativadora de catabólito 32 33 Operon lac PRESENÇA DE LACTOSE: inativar o repressor AUSÊNCIA DE GLICOSE: aumentar a concentração de cAMP, permitir a ligação a CAP e assim, ao DNA Operon trip Regulação Gênica em E.coli Operon Trip 34 trpR P\O trpE trpD trpC trpB trpA ter Repressor Triptofano+ Regulação do Operon trp 35 Regulação por repressão Regulação por atenuação Regulação do Operon trp 36 Regulação do operon do Triptofano 37 ATENUADOR: Controla a capacidade da RNA Polimerase em continuar o alongamento da transcrição além de determinados sítios OPERON TRIPTOFANO SEM CO-REPRESSOR RNA polimerase DNA mRNA Tradução Transcrição Proteína Repressora inativa Repressor inativo Transcrição TraduçãomRNA 38 Regulação por atenuação 39 SITIOS DE CONTROLE GENES ESTRUTURAIS GENE REGULADOR O CONTROLE DO OPERON DA ARABINOSE ENZIMAS ENVOLVIDAS NO METABOLISMO DA ARABINOSE RIBULOSE - QUINASE ARABINOSE – ISOMERASE RIBULOSE – 5 – FOSFATO - ISOMERASE 40 Na presença de arabinose, a proteína AraC se liga a região araI; a proteína CAP, ligada a cAMP, se liga a um sítio adjacente à região araI; TRANSCRIÇÃO DE araB, araA e araD O CONTROLE DO OPERON DA ARABINOSE 41 AraC Operador Ligação de AraC O CONTROLE DO OPERON DA ARABINOSE Na ausência de arabinose, a proteína AraC se liga a ambas as regiões de araI e araO formando uma alça no DNA. IMPEDE A TRANSCRIÇÃO DO OPERON 42 RNA anti-senso (RNAs reguladores) Eficiência de ligação do ribossomo Os mecanismos de controle pós- transcricional 43 RBS RBS RBS NEGATIVO POSITIVO RNA DsrA HNS (proteina reguladora de transcrição) RpoS (fator sigma) Atuando em reguladores transcricionais C o n tr o le p o r R N A s re gu la d o re s 44 Controle da tradução de operons de proteínas ribossômicas 45 Regulação da Expressão Gênica Procariotos: Resposta direta a variações nas condições nutricionais (genes ativados e reprimidos) Transcrição pode ser acoplada com a tradução (simultânea) Eucariotos multicelulares: Limitação na resposta direta às variações nas condições nutricionais (células estão organizadas em tecidos e orgãos – meios uniformes) Transcrição ocorre em compartimento distinto da tradução eliminando a possibilidade de acoplamento 46 REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA EM EUCARIOTOS 47 48 Tipos de Sinais no Controle da Expressão HORMÔNIOS ESTERÓIDES: Complexo receptor-hormônio reconhece sequências específicas no núcleo das células. PEPTÍDICOS: se liga a receptores de superfície da célula desencadeando uma cascata de sinalização MUDANÇAS NUTRICIONAIS E AMBIENTAIS: Limitada 49 Níveis do Controle da Expressão 1 Transcrição 2 Processamento 3 Estabilidade do mRNA 4 Tradução domRNA 50 Regulação da Transcrição Regulador TATA box Iniciador +1 Promotores Proximais Reforçadores (enhancers) Fatores de transcrição: gerais e específicos Ativadores (ligação DNA e ativação da transcrição) e Repressores 51 52 Holoenzima da RNA Polimerase II RNA Polimerase II Fatores Gerais de Transcrição SRB mediador (co-ativador) 53 Motivos presentes em proteínas que se ligam ao DNA Homeodomínio Dedo de Zinco Zíper de Leucina Hélice-alça-hélice Domínios de ativação Ligação com o DNA Ativa a transcrição 54 Complexos com múltiplos componentes Reforçadores + Fatores de Transcrição 55 Regulação Pós-Transcricional Splicing Alternativo Diferenciação de neurônios Apoptose Mudanças nos padrões de splicing alternativo 56 Regulação em nível de Tradução mRNAs que codificam ferritina e do mRNA do receptor de transferritina Transporte, uso e armazenamento do ferro Embriogênese Reativação de mRNAs dormetes no oócito 57
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