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Grupo VIII - Estrutura e Função dos Ácidos Nucleicos, Código Genético e estrutura gênica Arthur Sant’Anna Costa - 11226249 Camila Honório - 11372080 Danyelle Csiszar Ginalles - 9461085 Guilherme Silva Branco - 11226187 João Rabay - 9331681 João Vítor de Lima Moreira - 10308291 1. Quais as diferenças de composição e estrutura entre RNA e DNA. Como se distingue entre a uracila e a timina, e entre a ribose e a desoxirribose. Danyelle DNA e RNA são ácidos nucléicos formados por nucleotídeos – pentose + P + 1 base nitrogenada DNA, ou ácido desoxirribonucleico, é uma molécula linear não ramificada de dupla hélice, cuja pentose é a desoxirribose. Suas bases nitrogenadas se dividem em púricas: adenina e guanina e pirimidínicas: timina e citosina. RNA, ou ácido ribonucleico, é uma molécula linear não ramificada que não forma dupla hélice. Sua pentose é a ribose. Suas bases nitrogenadas se dividem em púricas: adenina e guanina e pirimidínicas: uracila (no lugar da timina) e citosina. Ribose DNA RNA ácido desoxirribonucleico ácido ribonucleico dupla hélice não forma dupla hélice desoxirribose ribose A, T, G, C A, U, G, C Bases Nitrogenadas Resumo Danyelle 2. Escreva a estrutura da 5' - desoxiadenosina trifosfato (dATP). Danyelle ATP = adenosina 5’ – trifosfato (nucleotídeo). A adenosina é o nucleosídeo pertencente ao RNA Desoxiadenosina 5´- trifosfato (nucleotídeo), chamado também de desoxiadenilato. A desoxiadenosina é o nucleosídeo pertencente ao DNA, ou o 5´-dATP Estrutura do ATP (b) o açúcar e o fosfato É a ligação éster, a pentose se liga ao fosfato, que fica para fora da hélice, a base nitrogenada fica acima da pentose e do lado interno da hélice Especifique o tipo de ligação entre: (a) a base nitrogenada e o açúcar É a chamada ligação beta-glicosídica, covalente, formando um nucleosídeo (base nitrogenada + pentose) Danyelle (c) entre as bases nitrogenadas Pontes de H, mantendo a estabilidade da dupla hélice: Guanina com citosina, com três pontes de H Adenina com a timina/uracila (RNA), com duas pontes de H Danyelle 3. Escreva a sequência de bases da fita complementar do DNA dupla fita que apresenta uma fita com a sequência: (5') ATGCCGTATGCATTGCATTC (3’) Exprima, em porcentagem, a composição de bases do DNA de fita dupla. João Vítor (5') ATG CCG TAT GCA TTG CAT TC (3’) – fita 1 (3’) TAC GGC ATA CGT AAC GTA AG (5’) – fita 2, complementar Porcentagem das bases nitrogenadas do DNA: 100% - 40 bases 100% - 40 bases A/T - 11 bases G/C - 9 bases A T G C 11 11 9 9 27,5% 27,5% 22,5% 22,5% Danyelle Como são dois O2 ligados ao P, chama-se ligações fosfodiéster, o arcabouço do ácido nucléico. A hidroxila 5´ (OH 5´) da fração pentose de um nucleotídeo é esterificada a um P, ligado à hidroxila 3´da pentose adjacente. As pentoses nos ácidos nucléicos estão ligadas umas às outras por pontes fosfodiéster ( onde estaria o OH). Ligações sentido 5´- 3´: carga negativa do grupo fosfato, faz com que seja menos suscetível ao ataque hidrolítico. No DNA, a ausência de hidroxila 2´ aumenta mais sua resistência à hidrólise. 4. Como são chamadas as ligações covalentes que unem dois nucleotídeos consecutivos nas moléculas de ácidos nucléicos? Esquematize estas ligações. 5. RNA é facilmente hidrolizado por álcali, enquanto DNA não é. Por que? O grupamento 2’hidroxila do açúcar (ribose) do RNA está diretamente envolvido neste processo, pois os grupamentos hidroxilas são os primeiros a serem hidrolizados pela ação de um álcali, produzindo uma mistura de nucleosídeos 2’ e 3’ monofosfatos. Como o DNA não possui um grupamento 2’hidroxila (desoxirribose), não é facilmente hidrolizado em condições alcalinas, o que torna o esqueleto do DNA mais estável se comparado ao RNA. Guilherme 6. Explique por que os ácidos nucleicos são desnaturado quando submetidos a altas temperaturas ou pH extremos. Como estás moléculas podem ser renaturadas? Os ácidos nucleicos acabam por se desnaturarem por conta da ruptura das pontes de hidrogênio que as mantém unidas e das interações hidrofóbicas que auxiliam em sua estrutura. Assim, as dupla-hélices se separam e a estrutura se desfaz. O processo inverso ocorre quando as condições biológicas se estabilizam, fazendo com que sua conformação natura seja retomada. As interações se retomam e fazem com que as fitas sofram um processo de anelação. Guilherme 7. Defina Temperatura de fusão (Tm) e efeito hipercrômico. - Quando a molécula de DNA atinge uma certa temperatura, a cadeia dupla se desenrola, separando-se em duas cadeias simples, pois as pontes de hidrogênio que ligam as bases hidrogenadas se rompem. - Conceitualmente, Temperatura de Fusão se refere à temperatura em que metade das cadeias de DNA de uma célula estão conservadas, no formato de dupla hélice, enquanto outra metade já se desnaturou. - É interessante frisar que a Temperatura de Fusão varia de acordo com o conjunto de bases nitrogenadas de cada molécula. A adenina e a timina formam duas pontes de hidrogênio, enquanto a guanina e a citosina formam três. Assim, ligações GC são mais estáveis que as AT, e só se dissociam a temperaturas maiores. João João O efeito hipercrômico é um fenômeno observado ao iluminar o DNA e o DNA desnaturado com raios ultravioleta. O DNA desnaturado, com forte presença de fitas simples, absorve mais UV que o DNA de fita dupla. A diferença entre a taxa de absorvência das fitas duplas e das fitas simples é denominada Efeito Hipercrômico. Isso acontece porque as bases nitrogenadas sem ligação por pontes de hidrogênio têm mais capacidade de absorver luz. Estima-se que as fitas simples são capazes de absorver 37% mais luz UV do que as fitas duplas. João 8. Quais as principais características da dupla-hélice de DNA de acordo com o modelo proposto por Watson e Crick? A dupla hélice é caracterizada pela presença de duas longas cadeias paralelas, formadas por nucleotídeos sequenciados, e que são torcidas em formato helicoidal, girando em torno de um eixo imaginário. Cada nucleotídeo é composto por pentose (açúcar composto de 5 átomos de carbono, no caso a desoxirribose), fosfato e uma base nitrogenada, que pode ser Adenina (A), Timina (T), Citosina (C) ou Guanina (G). As bases de cada cadeia se ligam através de pontes de hidrogênio, sendo que as ligações sempre se dão entre Adenina e Timina ou Citosina e Guanina. João 9. Descreva os principais experimentos que indicaram que o DNA é o material genético. • Frederick Griffith, em 1928, estava em busca de uma vacina contra a pneumonia. Cepa R: não causam doenças Cepa S: atinge o sistema imune e fazendo o animal contrair a doença e falecer. Griffith concluiu que as bactérias R teriam adquirido o que ele chamou de "PRINCÍPIO TRANSFORMANTE" da bactéria S morta por calor, permitindo que elas se "transformassem" em bactérias S, tornando-se capazes de causar doenças e até a morte. Camila Camila 9. Descreva os principais experimentos que indicaram que o DNA é o material genético. • Em 1944, três cientistas, Oswald Avery, Maclyn McCarty, e Colin MacLeod decidiram pesquisar o “princípio transformante”. Fizeram uma serie de experimentos para poder purificar o principio transformante, através de lavagens, separação, ou destruição enzimática dos outros componentes celulares. 1º evidencia: testes que davam negativo para a presença de proteínas e testes que mostravam alta presença de DNA na substancia. 2º evidencia: apresentavam grande quantidade de nitrogênio e fosforo. 3º evidencia: quando adicionavam enzimas degradantes de DNA, não ocorria mais atividade do principio transformante. Camila 9. Descreva os principais experimentos que indicaram que o DNA é omaterial genético. • 1952, com os cientistas Alfred Hershey e Martha Chase Usaram em seus experimentos vírus que atacam bactérias. Esses vírus são compostos por proteínas, que compõem a estrutura externa e o DNA, que compõe o núcleo interno. Essa substancia (DNA ou Proteína) dava informações para a bactéria começar a produzir o vírus. Essa substancia era o material genético do vírus. Camila 9. Descreva os principais experimentos que indicaram que o DNA é o material genético. • 1º Lote • 35S, que é um isótopo radioativo do enxofre, que é encontrado em proteínas. • Sendo assim, somente as proteínas dos vírus seriam radioativamente marcadas. • 2º Lote • 32P, que é um isótopo radioativo de fósforo, e este só é encontrando no DNA. • Então só o DNA seria marcado radioativamente. Camila Essa centrifugação fez com que as bactérias ficassem no fundo do tubo e que os vírus ficassem na superfície do mesmo. Camila 10. O núcleo de uma célula humana tem 6ºm de diâmetro e a extensão total do DNA dos seus 46 cromossomos soma 1,8m. Como é resolvida a discrepância entre estas duas grandezas? • O DNA é uma fita muito fina, então ela é fácil de ser enrolada e para facilitar o enrolamento, o DNA se liga a histonas, ficando altamente compactando para se manter no núcleo celular, sendo assim, resolvida a discrepância entre estas duas grandezas. • As histonas são as principais proteínas que compõem o nucleossomo. Têm um papel importante na regulação dos genes. São encontradas no núcleo das células eucarióticas Camila Questão 11: Esquematize a estrutura do nucleossomo. Qual a característica bioquímica principal das histonas e qual seu papel na organização da cromatina? A principal característica bioquímica das histonas é a sua grande afinidade com o DNA, neutralizando sua carga negativa proveniente dos fosfatos e elas apresentam o papel de organizar e empacotar o DNA. Artur Artur Questão 12 . Baseando-se na lista de códons e amino ácidos abaixo, quais das seguintes afirmações são corretas? AGU = serina AGC = serina AAU = asparagina AAC = asparagina AUG = metionina AUA = isoleucina a. o código genético é degenerado b. a alteração de um único nucleotídeo no DNA que dirige a síntese destes códons poderia levar à substituição de uma serina por uma asparagina no polipeptídeo. c. a alteração de um único nucleotídeo no DNA que dirige a síntese destes códons necessariamente levaria à substituição de um aminoácido no polipeptídeo codificado. As afirmações a e b estão corretas. João Vítor 13. Uma globina de 146 aminoácidos sofreu uma mutação no códon correspondente ao sexto aminoácido da cadeia. A análise do DNA indicou uma mudança de (5')TTC(3') para (5')TAC(3') na fita molde. Pergunta-se: a. A mutação provocou a troca de um aminoácido por outro? Em caso afirmativo, qual é este aminoácido? Sim!!! João Vítor João Vítor b. Quais as implicações para a estrutura da proteína? • A molécula de proteína apresenta dobramentos e enrolamentos que se determinam pelas atrações químicas dos aminoácidos, fazendo com que apresentem formas tridimensionais que corresponderão às estruturas secundárias e terciárias. Desta forma, a estrutura da proteína depende da sua sequência de aminoácidos, que é determinada geneticamente. Assim, mutações como esta promovem a substituição de um aminoácido por outro, neste caso acido glutâmico por valina. João Vítor c. Qual seria o resultado se a mesma troca ocorresse na base do lado (5') do DNA? • Se a mutação ocorresse na base do lado (5’) do DNA a mutação no códon da fita molde seria para (5’)ATC(3’) João Vítor
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