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Aminoácidos e Aminoácido É a unidade monomérica que forma as proteínas. Todos os 20 tipos de aminoácidos possuem uma estrutura em comum, um grupo carboxila e um grupo amino ligados ao mesmo átomo de carbono (carbono α). Eles se diferenciam uns dos outros em suas cadeias laterais ou grupos R, que variam de estrutura, tamanho e carga elétrica. 2 novos aminoácidos foram descritos nas últimas décadas, totalizando 22. O grupo amino tem caráter básico (receptor de H+) e o grupo carboxila tem caráter ácido (doador de H+). O aminoácido mais simples é a glicina. Para todos os aminoácidos comuns o carbono α está ligado a quatro grupos diferentes, sendo, portanto, um centro quiral. A glicina é o único aminoácido aquiral por ter um átomo de hidrogênio como cadeia lateral. Os aminoácidos quirais têm dois estereoisômeros (estrutura espacial) possíveis. Uma vez que elas são imagens especulares não sobreponíveis uma da outra. Levógiro (L) e Dextrógiro (D) são classificações de aminoácidos de acordo com a posição do grupo amina. Os aminoácidos D são encontrados na natureza (paredes bacterianas e antibióticos) porém não são encontrados nas proteínas, apenas os L. Classificação Apolares: Os grupos R são apolares e hidrofóbicos. As cadeias laterais de alanina, valina, leucina e isoleucina tendem a se agrupar no interior de proteínas, estabilizando a estrutura proteica por meio de interações hidrofóbicas. A glicina tem a estrutura mais simples, sua cadeia lateral não contribui realmente para interações hidrofóbicas. A metionina é um dos aminoácidos que contém enxofre. A prolina tem uma cadeia lateral alifática com estrutura cíclica e seu grupo amino reduz a flexibilidade estrutural de regiões polipeptídicas contendo prolina. Polares e sem carga: Os grupos R desses aminoácidos são mais solúveis em água por conterem grupos funcionais que formam ligações de hidrogênio com a água. Serina, treonina e tirosina têm o grupo hidroxila como contribuinte para suas polaridades. Asparagina e glutamina têm o grupo amida como contribuinte para suas polaridades. A cisteína é um dos aminoácidos que contém enxofre. A cisteína é um ácido fraco e pode fazer fracas ligações de hidrogênio com o oxigênio ou nitrogênio. Bioquímica Júlia Morais de Moura – 143 (2019.2) 23/08/19 Prof. Pablo Trindade Proteínas Júlia Morais marca 2 Ácidos/Carregados negativamente: Possuem um segundo grupo carboxila. Possuem carga final negativa em pH 7. Ácido Aspártico e Ácido Glutâmico. Básicos/Carregados positivamente: Grupos R mais hidrofílicos. Possuem carga final positiva em pH 7. A lisina apresenta um grupo amina. A arginina apresenta um grupo guanidina básica. A histidina apresenta um grupo imidazol aromático. Pode ser carregada ou não em pH 7 . Seus resíduos facilitam muitas reações catalisadas por enzimas, funcionando como doadores ou aceptores de prótons. Aromáticos: Relativamente apolares (hidrofóbicos). O grupo hidroxila da tirosina pode formar ligações de hidrogênio e é um importante grupo funcional em algumas enzimas. A tirosina e o triptofano são mais polares do que a fenilalanina, devido aos grupo hidroxila e o nitrogênio, respectivamente. O triptofano, a tirosina e a fenilalanina, absorvem a luz ultravioleta. Aminoácidos Incomuns: Produzido através de modificações pós-tradução. A fosforilação também faz isso, no entanto, é temporária. Hidroxiprolina e hidroxilisina são formadas a partir da adição de uma hidroxila, na prolina e na lisina, respectivamente. São mais frequentes em proteínas do tecido conjuntivo como o colágeno. Tiroxina apresenta um grupo aromático extra que contém iodo. É produzido a partir de tirosina e unicamente na glândula tireoide. Também conhecido como hormônio T4. Outros aminoácidos: Descobertos recentemente. Selenocisteína (Sec) possui um átomo de selênio no lugar do átomo de enxofre presente na cisteína. Parece ser importante em funções anti-oxidantes. Pirrolisina (Pyl) possui um anel pirrol (C4H5N). Descoberto originalmente em microorganismos, parece ter presença em diversos reinos. Propriedades Ácido-Bases Zwitteríon (anfóteros, podem agir tanto como ácido quanto como base) são aminoácidos sem grupos carregados em suas cadeias laterais. Contudo, ele terá cargas positivas e negativas iguais devido as propriedades dos grupos estruturais carboxila (negativo) e o grupo amina (positivo). Quando são íons dipolares, podem agir tanto como ácido quanto como base dependendo do pH. Júlia Morais marca 2 Histidina Glutamato Glicina kkkmm Alanina Júlia Morais marca 2 Ligações Peptídicas Os aminoácidos se unem uns aos outros através de ligações covalentes entre o grupo carboxila de um aminoácido e um grupo amino do aminoácido seguinte. É uma reação de condensação por desidratação, liberando no final uma molécula de água e um peptídeo com uma porção amino terminal (+) e uma outra carboxi terminal (-). Ressonância híbrida: Uma ligação simples do carbono com o nitrogênio pode se tornar uma ligação dupla. Essa característica estrutural impacta diretamente na estrutura das proteínas, visto que há rotação livre entre as ligações do carbono alfa de um aminoácido e o nitrogênio do outro resíduo. A sequência de aminoácidos de uma proteína determina suas propriedades bioquímicas e impacta em sua atividade biológica. Para uma cadeia contendo 20 aminoácidos ligados entre si, existem mais de 1 bilhão de sequências possíveis. Oligopeptídeos: São formados por 2-10 aminoácidos. Polipeptídeos: São formados por mais de 10 aminoácidos. Peptídeos: Moléculas com menos de 50 aminoácidos. Proteínas: Moléculas com mais de 50 aminoácidos. Aplicabilidade Clínicas Formação dos neurotransmissores. Carnosina (C9H14N4O3): Dipeptídeo encontrado no tecido musculas formado pela ligação de uma beta- alanina com uma histidina. O aumento de sua concentração está associado a melhora no desempenho de práticas esportivas. Glutationa (C10H17N3O6S): É um tripeptídeo capturador de agentes oxidativos, presente na mitocôndria e no núcleo na maioria das células. Formado pela ligação do ácido glutâmico, cisteína e lisina. A forma oxidada da glutationa é gerada a partir de duas moléculas do peptídeo reduzido e através de uma ligação dissulfídrica. Oxitocina e Vasopressina: São dois hormônios distintos e que só diferem entre si nos resíduos 3 e 8 de suas respectivas sequências de aminoácidos. Proteínas Alimentares: Organismos como E. coli sintetizam todos os aminoácidos que eles precisam, no entanto, nós humanos precisamos obter algumas aminoácidos exclusivamente a partir da dieta, eles são chamados de aminoácidos essenciais. A capacidade de síntese de alguns aminoácidos eventualmente é insuficiente, o que os torna condicionalmente essenciais. Aminoácidos essenciais: Histamina, leucina, isoleucina, lisina, metionina, fenilalanina, tirosina, valina, triptófano. Destinos dos Esqueletos Carbonados dos Aminoácidos Os aminoácidos que são degradados a acetil-CoA ou acetoacetil-CoA são chamados de cetogênicos. Eles podem gerarcorpos cetônicos ou ácidos graxos. De todos os aminoácidos, apenas leucina e isoleucina são puramente cetogênicos. Aminoácidos que são degradados a piruvato, α- cetoglutarato, succinil-CoA, fumarato ou oxalacetato são denominados glicogênicos. É possível sintetizar glicose a partir deles. Júlia Morais marca 2
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