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Replicação do DNA Prof. Msc. Tiago Vidigal Replicação do DNA O que é replicação do DNA? Em quais momentos o DNA deve ser duplicado? Qual a importância de conhecer este processo para a ciência? Duplicação da molécula de DNA garante manutenção da informação genética Fita molde l k l k ll ll l k o o o o o o o o o o o Modelos de replicação do DNA • Modelo conservativo: A cada rodada adicional de replicação, a proporção de molécula com o novo DNA aumentaria; • Modelo dispersivo:sempre produziria moléculas híbridas, contendo algum DNA novo e algum original, mas a proporção de DNA novo dentro das moléculas aumentaria a cada evento de replicação; • Modelo semiconservativo:uma rodada de replicação produziria duas moléculas hídridas, cada uma consistindo em DNA metade original e metade de DNA novo; EXPERIMENTO DE MESELSON E STAHL Isótopos de nitrogênio Culturas de E. coli Centrifugação com gradiente de densidade de equilíbrio observaram a diferença de densidade das moléculas. Bactérias do meio com N15 foram transferidas para meio com N14 e submetidas à centrifugação Posição intermediáia Tanto em eucariotos quanto em procariotos a replicação é semiconservativa REQUISITOS DA REPLICAÇÃO Três grupos principais: TRIFOSFATOS DE DESOXIRRIBONUCLEOSÍDEOS ( DNTP) SENTIDO DA REPLICAÇÃO As DNA polimerases, enzimas que sintetizam o DNA, podem adicionar nucleotídeos apenas à ponta 3´do filamento crescente (não à ponta 5´) A replicação do DNA inicia em seqüências específicas (ricas em AT) chamadas de origens de replicação. A Origem de replicação em E. coli (OriC)é uma seqüência de 256 pb que contém quatro locais de ligação a proteína DNA A, que inicia a replicação ao fazer que um curto trecho de DNA se desenrole, permitindo que helicase e outras enzimas se liguem ao filamento do polinucleotídeo. Replicação do DNA bacteriano- Iniciação Replicon Replicon Replicon Replicon Várias origens de replicação em D. melanogaster Replicação do DNA eucarioto A partir da origem a replicação prossegue ao longo da fita de DNA, em uma ou ambas as direções,formando uma bolha de replicação. MECANISMOS DE REPLICAÇÃO A bolha de replicação origina, em cada extremidade uma estrutura em forma de Y denominada forquilha de replicação. Replicação unidirecional, uma forquilha de replicação parte da origem e segue replicando o DNA em uma só direção. Replicação bidirecional, duas forquilhas de replicação deixam a origem em direção oposta. MECANISMOS DE REPLICAÇÃO Replicação do DNA -Deselicoidização A síntese de DNA requer um molde unifilamentar Uma DNA helicase quebra as pontes de hidrogênio que existem entre as bases dos dois filamentos de nucleotídeos O fator de iniciação primeiro separa os filamentos de DNA na origem, fornecendo um curto trecho de DNA unifilamentar ao qual se liga a helicase. Ponto de crescimento Ponto de crescimento Autoradiografia da replicação de E. coli SSBP Topoisomerase – DNA girasse: reduz a torção (reduzindo a superhelicoidização) Helicase Replicação do DNA Deselicoidização DNA POLIMERASE DNA polimerase é a enzima que faz a síntese de uma nova fita de DNA. A síntese de uma nova fia de DNA ocorre na direção 5’ – 3’, seguindo as regras de pareamento de bases A/T e C/G. Todas as DNA polimerase requerem um molde e um iniciador. DNA polimerase não é capaz de iniciar uma síntese; ela apenas adiciona nucleotídeos em fita preexistentes na extremidade 3’ OH. RNA POLIMERASE OU PRIMASE Replicação do DNA : Primers DNA POLIMERASE DNA POLIMERASE PRIMASE PRIMASE Direção da síntese 5’ – 3’ e é semidescontinua Fita contínua ou líder é aquela onde a síntese prossegue na direção 5’ – 3’, na mesma direção do movimento da forquilha de replicação. Fita descontínua ou atrasada é aquela onde a síntese 5’ –3’ prossegue na direção oposta à direção do movimento da forquilha. A síntese ocorre em pedaços que variam de tamanho dependendo do tipo celular (procariotos varia de 1000 a 2000 nucleotídeos e em eucariotos de 100 a 200 nucleotídeos). Esses pedaços de DNA recém-sintetizados, são denominados fragmentos de Okazaki. Os fragmentos de Okazaki são sintetizados pela DNA polimerase, a partir de uma primer. Para formar uma fita contínua a partir de uma fita descontínua, os primers são removidos dos fragmentos de Okazaki e substituídos por DNA. A ligação dos fragmentos de Okazaki é realizada pela ação da DNA ligase, formando uma nova fita. DNA POLIMERASE As DNA polimerase são muito precisas, possuem um mecanismo que funciona como ‘auto correção’ que remove seus próprios erros de polimerização enquanto desliza ao longo da molécula. Também, possuem atividade de exonuclease 3’ – 5’, que funciona como dupla verificação depois que cada nucleotídeo é adicionado. A função essencial da atividade de exonuclease 3’ – 5’ é reconhecer e clivar um pareamento errado na extremidade 3’ OH da fita nova. Essa atividade é de correção de erro, elimina somente o último nucleotídeo recém-adicionado. T T T Em procariotos E. coli possui três DNA polimerases DNA polimerase I – Possui atividade exonucleásica 5’ – 3’ – usando está atividade, a DNA polimerase I pode degradar ou deslocar um segmento de DNA (ou RNA) pareado ao molde e substituí-lo com DNA recém-sintetizado. DNA polimerase II – Possui função de reparo do DNA. DNA polimerase III– Responsável pela replicação do DNA, ela adiciona os desoxirribonucleotídeos nas extremidades OH 3’. A despeito de suas diferenças, todas as DNA polimerases de E. coli: 1. Sintetizam qualquer sequência especificada pelo filamento molde; 2. Sintetizam no sentido 5´para 3´, adicionando nucleotídeos a um grupo 3´-oh; 3. 3. Usam dntp para sintetizar novo DNA; 4. Necessitam de um primer para iniciar a síntese; 5. Catalisam a formação de uma ligação fosfodiéster unindo o grupo 5´- fosfato do nucleotídeo que chega ao grupo 3´-oh do nucleotídeo anterior no filamento crescente, cortando dois fosfatos no processo; 6. Produzem novos filamentos sintetizados, que são complementares e têm polaridade inversa aos filamentos novos; e 7. Estão associadas a várias outras proteínas. Em eucariotos As células contêm cinco DNA polimerases: α, β, γ, δ e ε. DNA polimerase δ é responsável pela replicação do DNA nuclear. Polimerases α está envolvida na síntese do primer, para o início da replicação e na formação dos fragmentos de Okazaki. As polimerases β e ε participam dos mecanismos de reparo do DNA. Polimerases β é responsável por preenche as lacunas entre os fragmentos de Okazaki após a remoção dos primers. A polimerase γ esta localizada na mitocôndria e é responsável pela replicação do DNA mitocondrial. A REPLICAÇÃO DO DNA REQUER MUITAS ENZIMAS E FATORES PROTÉICOS. PRTEÍNAS DE LIGAÇÃO A FITA SIMPLES Superenrolamento da dupla hélice de DNA circular REPLICAÇÃO DO DNA CIRCULAR Na replicação do cromossomo circular de E. coli e outras bactérias, a replicação é chamada de Teta, pois gera um estrutura que se assemelha à letra grega teta (θ). A região terminal é oposta a origem de replicação. REPLICAÇÃO DO DNA LINEAR
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