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Professores: Whasley Ferreira Duarte– Coordenador Email: whasleyduarte@ufla.br Cristina Ferreira Silva e Batista Eustáquio Souza Dias Patrícia Gomes Cardoso Rosane Freitas Schwan Whasley Ferreira Duarte Victor Pylro Pós-Doutorandos Docentes voluntários Microbiologia Avenida Norte (paralela à rodovia para Ijaci) MICROBIOLOGIA – DBI/UFLA 3 Biologia 4 AVENIDA NORTE Professores Disciplinas GBI 111 e 132 Eustáquio Souza Dias: esdias@ufla.br Cristina Ferreira Batista: cristinafsb@ufla.br Patrícia Gomes Cardoso: patricia@ufla.br Rosane Freitas Schwan: rschwan@ufla.br Whasley Ferreira Duarte: whasleyduarte@ufla.br - Victor Pylro- victor.pylro@ufla.br Professores voluntários Pós-Doutorandos 5 Nº Semana Datas Conteúdo Teorica Conteúdo Pratica 1 12-16 agosto Letiva sem ministração de aula – Planejamento docente - DADE Letiva sem ministração de aula – Planejamento docente - DADE 2 19-23 agosto Introdução da disciplina e Histórico da Microbiologia Introdução ao laboratório de microbiologia e observação de microrganismos no ambiente 3 26-30 agosto Sem ministração de aulas – Simpósio Microbiologia SIMA Sem ministração de aulas – Simpósio Microbiologia SIMA 4 02-06 setembro Classificação dos seres vivos Preparo e esterilização de meios de cultura 5 09-13 setembro Algas e Protozoários Preparações microscópicas a fresco Observação microscópica de protozoários e algas 6 16 -20 setembro Fungos Isolamento de fungos filamentosos 7 23-27 setembro Fungos Morfologia de Fungos Filamentosos – Esporos sexuados/ Esporos assexuados 8 30 set-04 outubro 1ª Avaliação Preparação de lâminas de leveduras Morfologia, reprodução e viabilidade celular 07-11 outubro Recesso Escolar Recesso Escolar 9 14-18 outubro Ultraestrutura de Bactérias Isolamento de Microrganismos/Diluição 10 21-25 outubro * 23 UFLA Faz extensão/sem aulas Nutrição e Crescimento Sem ministração de aulas 11 28 out-01 novembro * 28 Feriado servidor público Controle do crescimento microbiano Isolamento de Microrganismos em cultura pura/Estrias 12 04-08 novembro Metabolismo Preparações Fixadas – Coloração diferencial (Gram) 13 11-15 novembro * 15 Feriado proclamação da República Recombinação genética em Bactérias Métodos de inibição do crescimento microbiano/ Antibiograma 14 18-22 novembro Vírus Metabolismo microbiano: Fermentação alcoólica 15 25-29 novembro 2ª Avaliação Revisão 16 02-06 dezembro Avaliação 2ª Chamada Avaliação prática 17 11 dezembro Previsão para Avaliação de recuperação USO OBRIGATÓRIO DO JANELO, CALÇADO FECHADO E CALÇA. Apostila com roteiro de aula: obrigatória apostila nova completa (Xerox da UFLA) Presença e exercícios da apostila serão avaliados durante o semestre e terão até 10% extra da nota da avaliação prática. Cada estudante deverá fazer a prova no seu horário de aula, não é permitido ao estudante fazer a prova em outra turma/horário. 7 AULAS PRÁTICAS Microbiologia como ciência Estudo das células vivas (microrganismos) e seu funcionamento Diversidade e evolução dos microrganismos surgimento de diferentes tipos e as razões para isso O papel dos microrganismos no mundo sociedade humana, corpo humano, animais e plantas Maior parte do oxigênio que respiramos é resultante de atividades microbianas cianobactérias Relação com homens, outros animais e plantas degradação da matéria orgânica De uma forma ou de outra os microrganismos afetam todas as formas de vida do planeta,assim a microbiologia tem grande importancia. Micro primeiros tipos de vida, químicos da Terra. Relação com organismos superiores Benéfica X Maléfica. 8 9 IMPORTÂNCIA DOS MICRORGANISMOS Quando pesamos em microrganismo, pensamos em doenças. Microrganismos são seria ameaça ao existencia humana Doenças infecciosas: Paises ricos e pobres. Ex: subtipo C da doença --o menos estudado-- equivale à metade das infecções no mundo. Na Europa e no continente americano, que produzem cerca de 90% das pesquisas sobre a Aids, prevalece o subtipo B do vírus 9 10 IMPORTÂNCIA DOS MICRORGANISMOS Doenças de plantas e animais DTAs Grandes perdas econômicas 10 11 IMPORTÂNCIA DOS MICRORGANISMOS 11 -Sistemática microbiana -Fisiologia microbiana -Genética bacteriana -Bioquímica microbiana -Citologia BIOTECNOLOGIA SUSTENTABILIDADE $$$$$$$$$ Relação pesquisa básica e aplicada: prêmio Nobel de Química de 2009, a israelense Ada Yonath Micro aplicada lida com problemas práticos. 12 Microbiologia básica Microbiologia aplicada Medicina Agricultura Indústria Áreas de atuação Pesquisa Microbiologia – DBI/UFLA 13 Três linhas de Pesquisa 1- Ecologia, genética e fisiologia de microrganismos Estudos sobre a fisiologia e genética de microrganismos de ambientes agrícolas e naturais, caracterização e monitoramento de populações e comunidades microbianas e estudo de suas relações em diversos ambientes, como solo, água, plantas, alimentos, animais e resíduos agroindustriais, incluindo a aplicação de técnicas bioquímicas tradicionais, moleculares e de análise de ácidos nucléicos. Três linhas de Pesquisa 2- Biotecnologia de microrganismos aplicada à agropecuária e ao meio ambiente Estudo de processos e desenvolvimento de tecnologias baseadas em microrganismos para recuperação de ecossistemas, melhoria de processos biológicos naturais visando o incremento da produção animal e vegetal e consolidação da sustentabilidade do agronegócio. Estudos sobre promotores de crescimento como fungos formadores de micorriza e bactérias fixadoras de nitrogênio. Conhecimento e desenvolvimento de processos fermentativos espontâneos utilizados na elaboração de diversos alimentos e bebidas, para alimentação animal e desenvolvimento de métodos de diagnóstico e produtos para a melhoria Três linhas de Pesquisa 3- Qualidade e segurança microbiológica de alimentos Avaliação e estudo de pontos críticos de controle em todas as etapas da produção e no processamento de alimentos onde se desenvolvem microrganismos toxigênicos, patogênicos ou deterioradores dos alimentos ou de suas matérias primas. Análise da dinâmica das populações microbianas presentes em alimentos e avaliação de riscos para o meio ambiente e para a saúde humana e saúde pública. Microbiologia como carreira 18 19 AGRONOMIA Inoculantes em plantas comerciais Aumento da produtividade Controle de doenças causadas por microrganismos Produção de alimentos Manejo do solo O inoculante é um produto que contém microrganismo com ação benéfica para o desenvolvimento das plantas 19 20 Engenharia de Alimentos e Nutrição Produção de alimentos Controle sanitário de microrganismos patogênicos ou deterioradores nos alimentos Inoculantes e alimentos fermentados diferenciados Probioticos O inoculante é um produto que contém microrganismo com ação benéfica para o desenvolvimento das plantas 20 21 Biologia Estudo da diversidade dos microrganismos nos diferentes ambientes Propostas de manejo de áreas conservadas Recuperação de áreas degradadas Biologia e Genética de Microrganismos O inoculante é um produto que contém microrganismo com ação benéfica para o desenvolvimento das plantas 21 22 Engenharia Florestal Controle de doenças causadas por microrganismos Propostas de manejo de áreas conservadas Recuperação de áreas degradadas O inoculante é um produto que contém microrganismo com ação benéfica para o desenvolvimento das plantas 22 23 Engenharia Ambiental e Sanitária Biorremediação Microbiana Utilização dos microorganismos como inseticidas biológicos, não poluentes ao meio ambiente Recuperação de áreas degradadas Biorremediação - Utilização dos microorganismos como inseticidas biológicos, não poluentes ao meio ambiente 23 MICROBIOLOGIA DO RUMEN Pesquisa Melhoria da performance do animal MICROBIOLOGIA DE FORRAGENS CONSERVADAS Silagens: Bactérias do ácido lático Feno: Fungos-Micotoxinas ZOOTECNIA Pesquisa e desenvolvimento de probióticos: Bactérias e Leveduras • Ruminantes• Suinos • Aves • Equinos • Cães Aula 1 Histórico da Microbiologia 25 1857-1914 ~ 60 anos A Microbiologia, como ciência, não apresentou grande desenvolvimento até o século XIX Idade de ouro: eventos que consolidaram a microbiologia como ciência. 1900 proincipal causa de mortes, doenças infecciosas. 2000 doenças cardiacas, diabetes, cancer e outras. 26 1664 – Robert Hooke Invenção do Microscópio Descreveu estruturas de frutificação Apesar de especulações anteriores, a descoberta dos microrganismos esta associadas com a invenção do microscópio. Apesar de ter visto estruturas de frutificação, ele não observou detalhes dos micro 27 1684 - Antoni van Leeuwenhoek (holandês) Construtor amador de microscópios Primeira pessoa a observar os microrganismos em detalhes Observação de Bactérias Relato à Sociedade Real de Londres Progresso no entendimento da natureza e a importância desses minúsculos organismos ocorreu lentamente - O desenvolvimento da Micro. como ciência está ligada a 2 aspectos fundamentais: sec. XIX: 1) aperfeiçoamento da microscopia 2)técnicas laboratoriais: desenvolvimento da microbiologia hps.cam.ac.uk Pequenos animálculos Ele nomeou os micro de pequenos animáculos. 28 Século XIX – Duas questões biológicas levaram ao desenvolvimento de técnicas laboratoriais essenciais Geração Espontânea: Diversos pensadores debateram a ideia de que materiais inanimados poderiam dar origem a seres vivos. Natureza das doenças infecciosas: Os mecanismos da transmissão de um indivíduo para o outro eram desconhecidos. 30 Ferdinand Cohn (1828-1898) – “Pai da bacteriologia” Botânico interessado em microscopia Crescimento e divisão celular em células vegetais “Plantas” unicelulares (algas) e posteriormente as formas de vida fotossintetizantes (cianobactérias) Acreditava que as bactérias eram membros do reino vegetal Descobriu o gênero Bacillus (endósporos – estruturas termoresistentes) água em ebulição não era um método tão eficiente de esterilização Desenvolvimento de técnicas laboratoriais- tampões de algodão Britannica.com Polones Botanico 31 Louis Pasteur (1822-1895) Maior oponente à Teoria da Geração Espontânea Os organismos encontrados nos materiais em decomposição eram provenientes do ar Postulou que as células estariam constantemente depositadas em todos os objetos Experimento: pescoço de cisne Esterilização Frasco de Pasteur fim da Teoria da Geração espontânea Fermentação de uvas (vinho) era realizada por microrganismos – “levere” = leveduras Acumulou vários triunfos na microbiologia e na medicina Vacinas (antraz, cólera aviária e a raiva) Frances 32 34 O acaso só favorece a mente preparada. Um pouco de ciência nos afasta de Deus.Muito, nos aproxima. As futuras gerações vão rir da tolice dos filósofos materialistas modernos. Quanto mais estudo a natureza mais fico maravilhado com os feitos do Criador. Oro enquanto estou trabalhando no laboratório. 5 frases de Pasteur Quando vejo uma criança ela me inspira dois sentimentos. Ternura pelo que ela é, e respeito pelo que ela vai ser. Sejam quais forem os resultados, com êxito ou não, o importante é que no final cada pessoa possa dizer “eu fiz o que pude”. 5 frases de Pasteur Robert Koch (1843-1910) – “Teoria das doenças causadas por germes” Comprovação de que os micro. causavam doenças (contagiosas) Estudou o antraz (doença do gado que ocasionalmente acomete seres humanos – Bacillus anthracis) injetava sangue (contendo bactérias formadoras de esporos) em camundongos sadios Primeiro a usar meio solido para cultivo de bactérias (gelatina, ágar) Postulados de Koch demonstrar que organismos específicos causavam doenças específicas Desenvolvimento dos métodos básicos em microbiologia Britannica.com 37 Postulados de Koch 38 Outros nomes importantes Joseph Lister (1860)- médico Uso de fenol em feridas para controle de infecções Microbiologia médica Martinus Beijerinck - Cultura de enriquecimento- isolamentos de microrganismos de solos e água (seleção de microrganismos de uma amostra) - Doença do tabaco- não bactéria e sim vírus (filtração)- Virologia Sergei Winogradsky (1899) - Bactérias oxidantes de enxofre e nitrogênio - Metabolismo- quimiolitotrofia e autotrofia bacteriana 39 1900 Walter Reed provou que mosquitos eram transmissores da febre amarela 1908 Paul Ehrlich cura para sífilis (bacteria) Neosalvarsan – prêmio Nobel em 1908 1929 Alexander Fleming Penicilina 40 1977 Fred Sanger, Steven Niklen, Alan Coulson – método para sequenciar DNA 1977 Carl Woese – análise filogenética do rRNA 16S - Três Dominios (Archae) 41 1988 Kary Mullis – Reação de PCR Mullis e Michael Smith receberam Prêmio Nobel em 1993. 1995 Primeiro genoma sequenciado - Haemophilus influenza 42 1996 Andre Goffeau e colaboradores (96 laboratórios) Primeiro genoma de um organismo eucarioto sequenciado: Saccharomyces cerevisiae 43 Thomas Cavalier-Smith 6 reinos 1998 44 Descoberta da regulação do ciclo celular em eucariotos Estudando leveduras que se reproduzem por fissão 2001 Premio Nobel em Fisiologia ou medicina Sir Paul M Nurse Foi presidente da Royal Society, de 2010 a 2015 Leland H. Hartwell Tim Hunt Em 2001, o cientista britânico Paul Nurse ganhou um prêmio Nobel por suas pesquisas sobre o papel do DNA na divisão e na multiplicação celular. 45 Barry Marshall and J. Robin Warren Descobriu que a bactéria Helicobacler pylori causa ulcera e pode ser iniciadora de cancer no estomago Premio Nobel em 2005 Em 1984, os médicos australianos Robin Warren e Barry Marshall publicaram a versão completa do estudo no qual descreviam uma bactéria capaz de sobreviver à acidez do suco gástrico e de infectar a mucosa do estômago e causar inflamações. A Helicobacter pylori, popularmente conhecida como H. pylori, já atingia a população há milhares de anos, fato pelo qual os pesquisadores foram agraciados com o Prêmio Nobel de Medicina e Fisiologia, em 2005, por “reescreverem” a literatura científica no que diz respeito à causa de úlceras gástricas e gastrites. Trinta anos depois da descoberta tida como um marco na medicina, a bactéria transmitida por água e alimentos contaminados continua causando doenças gástricas, entre elas, o câncer de estômago. Esse tipo de câncer, associado à presença da H. pylori, é o terceiro tumor maligno mais frequente nos homens e o quinto nas mulheres. Além disso, é responsável por 700 mil mortes por ano em todo o mundo e por 20 mil novos casos por ano no Brasil, uma incidência considerada moderada. 46 Premio Nobel em Fisiologia ou medicina 2008 Harald zur Hausen Alemanha Descobriu o virus HPV (human papilloma virus) causador do cancer cervical http://www.nature.com/nature/journal/v488/n7413_supp/ WHO/ICO INFORMATION CENTRE ON HPV AND CERVICAL CANCER; DE SANJOSE, S. ET AL. LANCET INFECT. DIS. 7 453–459 (2007). Harald zur Hausen recebeu ½ do premio nobel e Françoise Barré-Sinoussi e Luc Montagnier receberam ¼ do premio – os três com vírus HPV e HIV. 47 Premio Nobel em Fisiologia ou medicina 2008 Françoise Barré-Sinoussi França Luc Montagnier França Descobriram o virus causador de imunodeficiencia HIV (human immunodeficiency virus) http://www.nobelprize.org/nobel_prizes/nobelguide_med.pdf identification of the virus associated with AIDS, occurred within just a few months amid a flurry of global research activity directed towards finding the cause of the then-new epidemic. Harald zur Hausen’s suggestion that human papilloma virus (HPV) infection might lie behind cervical cancer flew in the face of general opinion in the early 1970s, which held that another commonly present virus, herpes simplex virus, might be the cause. Realising that there were a multitude of different HPV subtypes, and hypothesising that unknown subtypes might cause the cancer, zur Hausen’s group began a painstaking search for suchnovel viruses. By the early 1980s they found novel viruses in genital warts. Their subsequent identification of two novel HPV subtypes in cervical cancers formed the essential piece of evidence linking HPV infection to the onset of the disease. 48 Referências 1 -Microbiologia: (10º edição) (Hardcover) Gerard J. Tortora, Berdell R. Funke, Christine L.Case. Editora Benjamin Cummings. (2010). ISBN-13: 978-0-321-58202-7 2-Microbiologia: An Evolving Science. Joan L. Slonczewski and John W. Foster. Editora W. W. Norton; 1st edition (Março, 2008) 3- Microbiologia de BrocK (14º edição). Michael T. Madigan, John M. Martinko, Kelly Bender, Daniel Bleckley, David Sthal. Editora Pearson Education, Inc. (2015). ISBN 978-0-321-89739-8 4- Apostila de aulas práticas – Microbiologia – DBI/ UFLA 50 Trazer na próxima aula os avanços da ciência envolvendo microrganismos a partir de 2010. 52 Como o avanço das técnicas descobertas alterou ou afetou a ciência microbiologia??
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