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Biologia Molecular Profª. Alice Ornelas Aula 5. REPLICAÇÃO DO DNA •Enzimas envolvidas • Pontos de origem de replicação • Fita contínua e descontínua (sentido 5’-3’) • Fragmentos de Okasaki Importância da Replicação Dogma Central da Biologia • A replicação é essencial para que o DNA possa armazenar e transmitir as informações que resultarão em todas as características de um organismo. Replicação Semiconservativa Cada dupla-hélice filha é composta de uma fita antiga(conservada) e uma fita nova (recém-sintetizada) ✓ A replicação produz duas moléculas completas e idênticas a partir de uma molécula de DNA original Replicon: Unidade do DNA onde está ocorrendo um evento de replicação Replicon: 1. Origem (replicação será iniciada) + Término (replicação termina). 2. Ativados apenas uma única vez em cada ciclo celular. 3. O genoma de uma célula procariótica constitui um único replicon, responsável por toda replicação do DNA cromossômico. 4. Os cromossomos dos eucariotos apresentam vários replicons, ou seja, a replicação é iniciada em diferentes regiões do DNA simultaneamente. Os replicons eucarióticos tem 40-100 kb e são iniciados em tempos diferentes. Fase S demora ~ 6hrs em uma célula somática Eucariotos – vários replicons Forquilhas de replicação • Local onde a dupla fita do DNA é separada, permitindo a replicação . • A partir de cada origem de replicação formam-se duas forquilhas que permitem a replicação bidirecional. Forquilhas de replicação Forquilhas de replicação Replicação Semi-conservativa e bidirecional Requerimentos para replicação • Nucleotídeos • Fita molde disponível (DNA) • Maquinaria de replicação (replissomo) – Diferentes enzimas, que participarão das etapas de iniciação, alongamento e terminação. Helicases • Para que a replicação ocorra, é necessário, que as duas fitas do DNA parental sejam separadas durante a síntese da fita nova complementar. • As enzimas que abrem a hélice do DNA são as helicases (roxo) Proteínas SSB • As duas fitas de DNA têm uma tendência muito grande em se associarem, tomando a configuração de dupla fita novamente. • As proteínas denominadas SSB (do inglês, Single Strand DNA- Binding - proteínas ligantes a DNA de cadeia simples) interagem com cadeias simples de DNA e as mantém separadas e sem se dobrar sobre elas mesmas. Proteínas SSB Topoisomerase II (DNA girase) • A separação das duas cadeias de uma molécula de DNA provoca um superenrolamento da hélice na região imediatamente à frente da forquilha de replicação. • A estratégia usada para evitar o superenrolamento é a introdução de cortes (nicks) em uma das cadeias do DNA, feitos pela topoisomerase II (DNA girase) Topoisomerase II (DNA girase) DNA POLIMERASE ENZIMA RESPONSÁVEL PELA SÍNTESE DE DNA • Acrescenta desoxirribonucleotídeos trifosfatados à extremidade 3’OH livre do nucleotídeo anterior. Fita molde Direção crescimento 5’ → 3’ Fita filha Fita molde Fita filha Deoxirribonucleotídeo trifosfatado Fita molde Fita filha DNA polimerase Deoxirribonucleotídeo trifosfatado Fita molde Fita filha Fita molde Fita filha Características das DNA polimerases 1. Não são capazes de iniciar síntese de novo. Precisam de 3’ OH livre fornecido pelo iniciador (primer); 2. Necessidades de íons de Mg2+ (cofator); 3. Acrescentam nucleotídeos à fita recém sintetizada obedecendo o pareamento de bases com a fita molde (Complementaridade de Bases). Características das DNA polimerases 4. Remoção de nucleotídeos: atividade polimerásica (5’→ 3’) replicação atividade exonucleolítica (3’→ 5’) revisão 5’ 3’ Enzima fiel com frequência de erro de ~ 10-5 a 10-6 Atividade revisora!!! DNA polimerase de E. coli • DNA pol I: polimerase (5’→3’), exonuclease (3’→5’) e exonuclease (5→3’). – Seu principal papel é na revisão e correção de possíveis erros; • DNA pol II: polimerase (5’→3’) e exonuclease (3’→5’). – Seu principal papel é na revisão e correção de possíveis erros; • DNA pol III: polimerase (5’→3’) e exonuclease (3’→5’). – É a responsável pela replicação dos cromossomos de E.coli. SÍNTESE DE INICIADORES Proteína envolvida Primase → sintetiza iniciador (primer de RNA) utilizando a fita molde. Primase: sintetiza primer de RNA SÍNTESE DAS NOVAS FITAS Proteína envolvida DNA polimerase III → sintetiza as novas fitas. DNA pol III: sintetiza as novas fitas Síntese da nova fita a partir do iniciador (primer) A T C G G C C A A T T G C T A G C C G G T T A A C G A T C G G C C A A T T G C T A G C C G G T T A A C G Síntese da nova fita a partir do iniciador (primer) A replicação se dá nas 2 fitas, em sentidos opostos, porém SEMPRE na direção 5’ 3’. 3’ 5’ Primer ou iniciador DNA Helicase 5’ 3’ Fita contínua (líder) Fita descontínua (tardia) 5’ 5’3’ 3’ No caso da fita descontínua, iniciadores de RNA são produzidos ao longo de todo o processo pela DNA primase. 5’ 3’3’ 5’ DNA Pol III Primase DNA Helicase Fita contínua: DNApol III tem mesmo sentido de polimerização que o sentido da forquilha 5’ 3’ Os fragmentos sintetizados na fita descontínua são chamados de Fragmentos de Okazaki. Após remoção do primer de RNA e sua substituição por DNA pela DNA Pol I (atividade exonucleotídica e polimerásica), os fragmentos são ligados pela DNA ligase 5’ 3’ DNA Helicase 5’ 3’ 5’ 3’ 5’3’ Mecanismo de ação da DNA ligase • Catalisa o fechamento covalente dos cortes no DNA inseridos pela DNA Pol I durante a remoção dos primers de RNA utilizando energia do ATP. • Ligações Fosfodiéster!!!!
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