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Biodiversidade: genética, de espécies e ecológica → se baseia na busca por polimorfismos Polimorfismo: ocorrência de duas ou mais formas diferentes dentro de uma população considerando uma determinada característica. • Aparência ou material genético • Identificado por marcadores moleculares MARCADORES MOLECULARES: • Características genéticas e moleculares que são utilizadas para descrever a biodiversidade dentro de um enfoque genético • Caracteres de herança simples que diferenciam os indivíduos Altamente polimórficos Sofrem baixa influencia ambiental Identificados por técnicas laboratoriais Como escolher o marcador? Avaliar a adequação responder à pergunta acadêmica 1. Forma de detecção 2. Taxa de mutação 3. Conteúdo de informação 4. Modo de herança 5. Conveniência técnica e financeira Quais questões eles respondem? Evolução dos organismos, identificação da classificação taxonômica, determinação da paternidade, mapeamento de epidemiologia, diagnostico de doenças genéticas, mapeamento de características e seleção, e conservação dos organismos ✓ Principais métodos: PCR, sequenciamento sanger, NGS, DNA barcoding Aplicações: DETERMINAÇÃO DE PATERNIDADE • Identificação de polimorfismos • Utilização de múltiplas Sondas que marcam minissatélites do DNA (DNA fingerprint) e sondas unilocais (SSR- microsatélites e SNPs- polimorfismo de base única) DIAGNÓSTICO DE DOENÇAS • Não existe uma padronização, existem diferentes métodos • Precisa ser considerado o tipo de herança TIPOS DE HERANÇA • Autossômica recessiva: indivíduos afetados tem duas copias de um gene autossômico mutante. Ex: fibrose cística • Autossômica Dominante: basta uma cópia do gene mutante para causar a doença. Ex: Doença de Huntington • Ligada ao X: mutações dominantes no sexo masculino. Ex: distrofia muscular de Duchenne • Multifatoriais: mutações em genes diferentes ou surgem da interação de fatores ambientais com múltiplos genes. Ex: Câncer DIAGNOSTICO MOLECULAR • Amplificação enzimática por PCR • Digestão da fita de DNA ou produto de PCR com enzimas de restrição • Separação do DNA por eletroforese • Hibridização do DNA com sondas oligonucleotídicas específicas para os alelos mutados PCR • Amplificação do gene específico. • PCR para exons específicos e RT PCR para análise de transcritos • Permite a rápida genotipagem de marcadores polimórficos • Mutações já conhecidas: deleção ou inserção de alelos que podem ser detectados por PCR ou suscetibilidade à enzima de restrição Teste de ARMS: desenho de 3 primers para reconhecer um alelo específico Primer 1: alelo mutante Primer 2: alelo selvagem 3: região conservada do exon • Rastreamento de mutações e polimorfismos IDENTIFICAÇÃO DE OGMS TESTE DE TIRAS: baseado em ensaios imunocromatográficos. • Tiras com anticorpos capazes de reconhecer as proteínas transgênicas • Complexo proteína-anticorpo-corante Vantagens: rápido, não precisa de equipamentos de laboratório ou especialização técnica Desvantagem: a variedade da concentração da proteína transgênica pode ocasionar falsos negativos, não pode ser usado para identificar modificações genéticas que não tenham a formação de novas proteínas, é preciso que aja a produção de anticorpos específicos para a proteína gerada TESTE DE ELISA Imunoensaio que quantifica a presença de proteínas especificas em misturas complexas Vantagem: rápido e barato Desvantagem: necessária a utilização de equipamentos específicos, limite de detecção de 1%, não pode ser aplicado quando não é formado novas proteínas e também necessitam de anticorpos específicos OBS: Testes baseados em proteínas não são bem aplicados em produtos altamente processados por causa da alta temperatura, exposição a agentes químicos, etc que podem danificar as proteínas desses produtos PCR • Ampliação exponencial do material inserido no organismo receptor • Maior sensibilidade e reprodutividade • Mais caro porem melhor custo benefício
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