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Nutrição, Metabolismo e Crescimento Microbiano Reações Catabólicas e Anabólicas - Reações catabólicas são reações de quebra onde moléculas complexas são quebradas em moléculas simples, como glicose, aminoácidos, o glicerol e os ácidos graxos. Isso ocorre para que essas moléculas adentrem nas reações anabólicas. - As reações anabólicas, são reações em que há a transferência de ATP para moléculas complexas e liberam calor. Essas moléculas complexas serão novamente catabolizadas, para liberar calor e gerar ATP e assim manter o ciclo metabólico de um organismo vivo. - Essas reações estão em constante balanço pra manter a homeostasia dos sistemas biológicos. Enzimas e Reações Químicas - Essas reações são reações enzimáticas nas quais acontecem reações químicas. - Toda reação química parte de reagentes que produzem produtos. Pra que essa reação química possa acontecer é necessário uma energia de ativação. Geralmente quando a reação é enzimática, a enzima atua como catalizador reduzindo essa energia de ativação tornando o processo reacional mais fácil, essa é a função de um catalizador. Classificação das Enzimas - As enzimas são classificadas de acordo com o tipo de reação que elas fazem. ATP ADP + P Catabolismo Anatabolismo Moléculas simples Moléculas Complexas Calor liberado Calor liberado Classe Tipo de reação catalizada Oxirredutase s Transferases Hidrolasess Liasess Isomerases Ligasess Oxidação-redução Transferência de grupos funcionais Reações de Hidrólise Remoção de grupos de átomos sem hidrólise Rearranjo de átomos dentro de uma molécula União de duas moléculas usando energia Componentes das Enzimas - As enzimas elas tem uma porção protéica inativa, que chamamos de apoenzima. - Essa apoenzima se liga a um outro fragmento que é uma porção não- protéica chamada de cofator que geralmente são metais que também pode se associar as enzimas, se esse fragmento for de natureza protéica nós chamamos de coenzima. - Ao se ligar elas formam uma holoenzima que é uma enzima completa ativa. - As enzimas possuem um sitio ativo que é o local onde o substrato se liga para ativar pra que aconteça a transformação de reagentes em produtos. Fatores que influenciam a Atividade Enzimática - A partir do momento em que aumentamos a temperatura mais do que a enzima precisa, a atividade enzimática vai cair, pois esse aumento da temperatura irá desnaturar essas proteínas, isso faz com que ela perca a sua conformação ativa. - O pH do meio também influencia na atividade das enzimas, assim como a temperatura, existe um pH ótimo para as enzimas trabalharem. O aumento adicional de pH irá desnaturar as proteínas fazendo com que a atividade da enzima caia. - Como vimos antes, a enzima possui um sítio ativo que é o local de ligação do substrato e esse número de sítios ativos é limitado, então quando aumentamos a concentração do substrato, aumentamos a atividade enzimática, pois está aumentando a probabilidade do substrato se ligar com o sitio ativo, mas a concentração de enzimas no interior das bactérias é limitada, vai chegar um momento em que todos os sítios ativos das enzimas vão estar ocupados pelo substrato, quando isso acontece a atividade isomérica permanece constante. Essa reação segue o modelo chave-fechadura, para mais informações sobre ele, consultar o resumo de Bioquímica sobre Enzimas. Temperatura pH Concentração do substrato Inibidores - Outro fator que também inlfuencia é se tem a presença de inibidores enzimáticos e esses inibidores podem ser competitivos, não-competitivos e aqueles inibidores por fenômeno de retroalimentação. - O inibidor competitivo é uma substancia que tem característica que permite que ele se ligue no sitio ativo da enzima e espessa a ligação do substrato, impedindo então a reação de acontecer. - Os inibidores não-competitivos ou alostéricos, são aqueles inibidores que se ligam em um sito que não é o sitio ativo, fazendo com que a enzima mude a sua conformação do sitio ativo e impeça a ligação do substrato. - Os processos de inibição por retroalimentação é quando temos uma cascata enzimática e o produto final dessa cascata, quando os níveis estão adequados do organismo para desempenhar a sua função ela vem e inibi uma enzima que meio que bloqueia o processo até que os níveis caiam e aquele produto tenha que ser produzido novamente. Metabolismo Microbiano - Nós temos nutrientes que irão entrar na via metabólica e irão produzir subunidades estruturais e energia, essas vias metabólicas são integradas e irão favorecer o crescimento bacteriano ou permitir que algumas espécies de bactérias se locomovam ou possam produzir luminescência. Inibidor competitivo Enzima Inibidor não- competitivo Sítio aloestérico Substrato Sítio ativo Sítio Ativo alterado Esse mecanismo funciona como feedback. Para mais informações, consultar o resumo de Fisiologia sobre Homeostasia. Nutrientes Metabolismo Subunidades estruturais Crescimento bacteriano, motilidade, luminescência. Energia - Nesse processo nós temos os Elementos plásticos que são elementos fonte de: carbono, nitrogênio, fosfato, enxofre. - Temos também Elementos Traço que são os metais Ca, K, Fe, Mo, Mn, Mg, Zn, Co, que participarão como cofatores de enzimas. - Algumas espécies de microorganismos precisam de fatores de crescimento. - Todos esses elementos anteriores entrarão nas vias metabólicas que fazem uso de biossíntese e degradação de carboidratos, aminoácidos, bases nitrogenadas, ácidos graxos e que vão desempenhar as funções celulares. Exigências Nutricionais - Nesse processo podemos classificar os microorganismos não só eles, mas também os seres vivos, quanto a suas exigências nutricionais. - Existem microrganismos que são autotróficos que se desenvolvem em meios de cultivo constituídos por compostos inorgânicos simples, cuja fonte de carbono é o Co2. - Existem os heterotróficos que para se desenvolverem precisam da presença de compostos orgânicos no meio de cultivo, sua fonte de carbono são os compostos orgânicos. - Os seres auxotróficos que são mutantes, são microorganismos que sofreram um processo de modificação genética e passaram a exigir um Fator de Crescimento que não é exigido na célula parental. - Temos os Fotoautotróficos quando a fonte de energia é a luz e a fonte de carbono é o Co2. - Foto-heterotróficos quando a fonte de enrgia é a luz e a fonte de carbono, são substancias orgânicas. - Quimioautotróficos, cuja fonte de energia é a oxidação de substâncias inorgânicos e a fonte de carbono é o Co2. - Quimio-heterotróficas, quando a fonte de energia é a oxidação de substâncias orgânicas e a fonte de carbono substâncias orgânicas. - Geralmente as fontes de energia que são doadoras de elétrons são o sol em associação com pigmentos fotossintéticos e moléculas orgânicas como glicose, enxofre elementar, amônia ou gás hidrogênio que irão produzir elétrons e utilizados para a produção de ATP e esses elétrons também entram em vias transportadoras de elétrons que são o NADP+, NAD+, FAD, pra gerar mais ATP. - Teremos a participação também de moléculas aceptoras finais de elétrons que podem ser o oxigênio quando os organismos fazem respiração aeróbica, grupos nitrato, grupos sulfato quando esses organismos fazem respiração anaeróbica e compostos orgânicos quando esses organismos fazem fermentação anaeróbica. Vias metabólicas de Produção de Energia - São as vias catabólicas. Metabolização de Carboidratos: - A via metabólicapreferencial é a via da glicólise, a via de Embden- Meyerhof. Onde teremos a quebra da glicose para gerar 2 moléculas de ácido pirúvico, 2 moléculas de ATP e 2 NADH. - Ainda existem espécies de microorganismos que utilizam a via Entner-Doudoroff. Ela também produz 2 ácidos pirúvicos mas só produz 1 molécula de ATP e 2 NAH. Ela é energeticamente mais desfavorável, ela é uma via opcional. - Existem outras espécies de microorganismos que metabolizam pentoses na via da Pentose Fosfato produzindo frutose-6-fosfato e que pode adentrar na via preferencial pra produzir 2 moléculas de ácido pirúvico e 2 ATP, mas nessa via gasta-se 1 ATP, então por essa via o saldo final será, 2-1=1 ATP. Essa é uma via complementar. Diferença entre Respiração e Fermentação - Na respiração, a molécula de glicose ela vai ser convertida em ácido pirúvico, vai produzir as moléculas que irão adentrar o ciclo de Krebs que produz ATP, vai produzir também os Carboidratos Glicose “Pentoses” Via de Entner- Dodoroff Via de Embden- Meyerhof Via da Pentose fosfato Frutose-6-fosfato 2 Ác. Pirúvico 2 Ác. Pirúvico 1 ATP + 2NADH 2 ATP + 2NADH -1 ATP + 2NADH intermediários que entram na cadeia respiratória pra geração de mais ATP. - Em uma bactéria, o processo de cadeia de transporte de elétrons, não gera 34 ATP’s, mas sim 38 ATP’s. Em uma célula eucariótica ela acontece no interior da mitocôndria e os 36 ATP’s quando são produzidos no interior da mitocôndria pra eles serem utilizados pela célula como fonte energética tem que ser bombeados para fora da mitocôndria, gastando-se assim 2 ATP’s ficando 34. Em uma célula procariótica, tudo ocorre no citoplasma, não existe esse gasto então o saldo final será 38 ATP’s. - Já na fermentação, uma molécula de glicose será convertida a ácido pirúvico e esse ácido vai permitir a formação de produtos e essa fermentação pode ser, fermentação lática, alcoólica, proprionica, butírico, entre outros. Com a fermentação podemos produzir cerveja, lacticínios, vinagre, é útil na produção de vários tipos de alimentos... Metabolização dos Lipídeos - Os lipídeos irão sofrer a ação da lípase que irá degradar esse lipídeo em glicerol e ácido graxo. - Esse glicerol será convertido em diidroxiacetona fosfato, depois em gliceraldeido-3-fosfato e pode entrar na via glicolítica para a geração de ácido pirúvico que atuará no ciclo de Krebs. - Os ácidos graxos por sua vez, sofrem beta oxidação pra produzir acetil coenzima e atuar no ciclo de Krebs. Metabolização das proteínas - As proteínas são quebradas em aminoácidos, onde alguns tipos de aminoácidos poderão ser convertidos a acido pirúvico, em acetil coenzima a e alguns deles podem entrar diretamente no ciclo de Krebs. Testes Bioquímicos e Identificação Bacteriana - Existem espécies bacterianas que fazem reações de descarboxilação e fermentação. - Quando as bactérias fermentam por exemplo lactose, elas irão produzir ácido lático e Co2 isso pode ser observado pela mudança de coloração do meio e pela formação de bolhas. - As espécies de bactérias que descarboxilam, muda o pH do meio podendo ser visto pela mudança na coloração. Esse processo é utilizado na identificação de algumas bactérias do laboratório. Vias metabólicas de uso de energia Biossíntese de Polissacarídeos - Quando existe um excesso de carboidratos, uma parte do ATP utilizado, uma parte dos carboidratos que participam do metabolismo, podem ser estocados em grânulos de glicogênio, isso acontece tanto nas bactérias quanto nos animais. - Alguns desses carboidratos também podem ser utilizados na formação da parede célula das bactérias, os peptideoglicanos. Biossíntese de Lipídeos Simples - O glicerol e os ácidos graxos podem produzir gotículas de lipídeos que ficam dispersos no citoplasma pra ser utilizado posteriormente como fonte de energia para as bactérias. Biossíntese de Aminoácidos - Alguns aminoácidos irão sofrer reações de processo de transaminação para produção de algumas estruturas importantes para a defesa das bactérias e para o metabolismo bacteriano. Biossíntese de Nucleotídeos de Purina e Pirimidina - Alguns aminoácidos produzidos na via glicolítica e no ciclo do acido cítrico como glicina, glutamina, ácido aspártico, pentoses que são carboidratos, eles vão entrar na composição dos nucleotídeos puricos e pirimídicos que vão entrar na composição do DNA e do RNA da bactéria que é importante para o processo de reprodução bacteriana. Características do Crescimento Bacteriano - Uma bactéria se divide por fissão binária, ou seja, a partir de uma célula serão produzidos duas células. - O tempo de geração nas espécies bacterianas em geral é de cerca de 15 a 30 minutos, é um crescimento exponencial. - O aumento da população bacteriana ocorre em progressão geométrica e ocorre a formação de populações extremamente elevadas em curto espaço de tempo. Curva de Crescimento bacteriano - Fase lag, é a fase de adaptação das bactérias no período de incubação. - Fase log ou de crescimento exponencial é a fase em que as bactérias estão se multiplicando. - Fase estacionaria, é a fase em que as bactérias começarão a competir por nutrientes, pois a quantidade de nutrientes que tem no meio de cultura é limitado fazendo com que o numero de bactérias que nasce é o mesmo das que morrem, chegando assim a uma fase estacionária. - Chega um momento em que os nutrientes vão acabando e as bactérias vão morrendo, essa fase é chamado de fase de morte celular ou de declíneo. Fatores que Influenciam o Crescimento Microbiano - Nutrientes Essenciais do meio - Temperatura - Atmosfera, se é oxigênio ou co2 - pH - Osmolaridade, concentração de sal do meio. Classificação segundo a temperatura de crescimento - Psicrófilo: Bactérias que crescem em baixas temperaturas. - Mesófilo: Bactérias que crescem a uma temperatura intermediária. - Termófilo: Bactérias que crescem em altas temperaturas. - Hipertermófilo: Bactérias que crescem em temperaturas extremamente altas. - - Para nós que trabalhamos na área da saúde, as bactérias mesófilas são as mais importantes, pois são aquelas bactérias que crescem em uma temperatura parecida com a nossa. Podemos classificar os microorganismos segundo o tipo respiratório. Aeróbicos obrigatórios: Somente crescimento anaeróbico, necessita de oxigênio. Se cultivarmos em um tubo de ensaio, veremos que elas ficarão na superfície onde se concentra a maior parte do oxigênio. Anaeróbicos facultativos: Crescimento aeróbico e anaeróbico, aumento do crescimento na presença de oxigênio. Geralmente crescem em todo o tubo de ensaio. Anaeróbicos obrigatórios: Somente crescimento anaeróbico, não há crescimento na presença de oxigênio. Irão crescer no fundo do tubo de ensaio. Anaeróbicos aerotolerantes: Somente crescimento anaeróbico, mas continua na presença de oxigênio. Seu crescimento é bem parecido com as anaeróbicas facultativas. Microaerófilos: Somente crescimento aeróbico, necessidade de oxigênio em baixas concentrações. Se concentrarão no meio do tubo de ensaio. Cultivo de Bactérias Anaeróbicas - É necessário criar uma atmosfera anaeróbica, sem oxigênio, pra criar isso nós utilizamos recipientes onde colocamos os meios de cultura e reagentes pra produzir CO2 ou hidrogênios, geralmente é utilizado bicarbonato de sódio e borohidreto de sódio, eles têm indicadores de anaerobiose que consomem o oxigênio e produzem uma atmosfera propícia para o crescimento de anaerobicos. - Em laboratórios mais simples esse meioanaeróbico é feito a partir de um recipiente, onde dentro estarão os meios de cultura, uma vela acesa, ao fechar o recipiente a vela irá consumir todo o oxigênio quando isso acontecer, ela apaga e o ambiente assim estará todo anaeóbico. Classificação Segundo o pH Ácido Neutro Alcalino Acidófilas (1,8-5) Neutrófilas (5-9) Alcalófilas (9-11) Classificação Segundo a Osmoralidade - Não Ilalófilos: Não toleram grandes concentrações de sais. Por essa razão usamos sal para conservar a carne de alguns microorganismos. - Halófilos Moderados: Temos como exemplo organismos marinhos, eles toleram certa quantidade de sal. - Halófilos Extremos: Temos como exemplo a Halobacterium que cresce em altíssimas concentrações de sal, elas produzem pigmentos em alguns lagos. Bactérias Fermentadoras: Lácticas Acéticas Propiônicas Escherichia coli Staphylococcus aureus Clostridium botulinum Salmonella sp. Alcaligenes faecalis Vibrio cholerae Vibrio parahaemolyticus Agrobacterium Meios de Cultura Tipo Finalidade Quimicamente definido Crescimento de quimioautotróficos e autotróficos e análises microbiológicas. Complexo Crescimento da maioria dos organismos quimio- heterotróficos. Redutor Crescimento de anaeróbicos obrigatórios. Seletivo Impedir o crescimento de micorganismos não desejados, favorecer o crescimento do organismo de interesse. Diferencial Diferenciar as colônias do organismo de interesse dos outros organismos. Enriquecimento Semelhante ao seletivo, mas com a característica importante de aumenta o numero de bactéria de interesse tornando-a detectável. - Cada meio de cultura possui uma composição química pré estabelecida e favorece o crescimento de alguns tipos às vezes de bactérias. - Temos como exemplo o Agar Brolacin, esse meio de cultura tem um indicador de pH que permite ver se a bactéria fermenta a lactose ou não. Se fermentar a coloração do meio ficará azul se não fermentar, fica amarelado. - Temos ainda o Agar sangue, ele contém sangue e permite verificar se a bactéria que cresceu lá no meio de cultura produz hemólise, podemos ter hemólise beta, alfa, hemólise gama quando não acontece hemólise. Métodos para Quantificar o Crescimento Microbiano - Método das Diluições Seriadas e Contagem em Placa. - Método da Contagem em Placa. - Método de Filtração. - Método da Contagem Direta ao Microscópio. - Método da Turbidimetria (Método indireto). positiva
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