PRÁTICA 01- INTRODUÇÃO À QUÍMICA COMPUTACIONAL

Prévia do material em texto

CURSO: Bacharelado em Farmácia 
DISCIPLINA: Química Farmacêutica 
PROFESSOR: Cristiano Ribeiro Gonçalves Affonso 
 
 
PRÁTICA 01: INTRODUÇÃO À QUÍMICA COMPUTACIONAL 
ACD/ChemSketch 
INTRODUÇÃO 
 
O ChemSketch é um 
programa que atende as mais 
diversas necessidades no campo 
da química. Com ele podemos fazer 
cálculos de massa molecular, peso 
molecular, distância entre ligações 
além de tornar possível desenhar, 
visualizar em 3D e até nomear 
alguns compostos. 
A grande vantagem é a 
facilidade em desenhar estruturas e 
utilizá-la em outros programas mais 
completos. 
 
 
 
 
 
 
1 – Tabela periódica. Para adicionar elementos que não estão disponíveis na barra de elementos. 
2 – Botões de Seleção e Movimento 
2A – Selecionar/Mover: Serve para mover parte de uma estrutura (elemento ou ligação). Nos 
permite deslocar um fragmento da molécula deixando intacto todo resto. 
2B – Rotação Plano: Rotaciona a estrutura (ou parte dela) no plano da área de trabalho. 
3B – Rotacionar 3D: Rotaciona a estrutura em qualquer plano 
3 – Seleção: Permite selecionar várias estruturas da área de trabalho. 
4 – Desenho: Servem para desenhar manualmente ligações ou para transformar uma ligação 
simples em ligação dupla ou tripla. 
5 – Desenhar/Alterar formato ligação: Permite desenhar ligações especiais como ligações dentro e 
fora do plano ou ligações coordenadas. 
6 – Botões de edição: Funções básicas como apagar, recortar, colar etc. 
7 – Sinal +: Insere o sinal gráfico de soma em reações. 
8 – Seta de Reação: Insere/apaga setas dos mais diversos tipos e formatos. 
9 – Legenda Seta: Insere legenda abaixo ou acima da seta de reação. 
10 – Comandos e Cálculos de reação. 
11 – Polímero: Multiplica uma estrutura por número. 
12 – Posição: Altera a posição de uma ligação ou elemento a ser selecionado 
13 – Botões de rotação de ligação: Rotaciona uma ligação segundo o eixo selecionado. 
14 – Espelha elemento ou ligação selecionado no plano vertical ou horizontal. 
15 – Oferece uma opção de desenho automático ao se aproximar de um elemento em uma 
estrutura. 
16 – Adapta a estrutura para que seja vista no plano da área de trabalho. 
17 – Verifica se a estrutura selecionada possui forma tautomérica. 
18 – Otimização 3D: Otimiza a estrutura desenhada para a melhor forma reconhecida pelo programa 
(Ângulos e distancias de ligação). 
19 – Ajustes de Tela: Opções de zoom da página da área de trabalho. 
20 – Abrir modelos: Abre o acervo de moléculas, orbitais, etc. 
21 – Gerar Nome: Gera o nome da estrutura selecionada (restrições na versão free) 
22 – Leva a estrutura desenhada para a forma 3D. 
 
 
ROTEIRO 
 Seguir todos as etapas para as moléculas abaixo. 
 
1º Desenhar a molécula. 
2º Otimizar a estrutura: Tools à Clean Structure 
3º Calcular a fórmula molecular: Tools à Calculate à Molecular Formula 
4º Gerar nome para o composto: “Atalho 21” 
5º Calcular a lipossolubilidade: Adds On à Calculate log P 
6º Selecionar e Copiar a estrutura: Edit à Select All (ctrl+A) à Edit à Copy (ctrl+C) 
7º Colar a estrutura no MarvinSketch: Edit à Paste (ctrl+V) 
8º Gerar o nome tradicional do composto: Structure à Structure to name à Generate name à 
Tradidional Name à Ok 
 
Q – Observando os resultados de dos compostos “c”, “d”, “e” e f””: Qual foi a influência sobre a 
lipofilicidade da adição de cada substituinte? O resultado é o esperado? Explique. 
 
a) CH3 – CH2 – OH b) CH3 – CH2 – COOH c) 
d) e) 
 
 
 
 
f) g) h) 
 
 
 
 
 
 
 
i)