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REPLICAÇÃO DO DNA - crescimento/reparo tecidual - células-filhas com as mesmas características (morfológicas e funcionais) da célula-mãe - antes de cada divisão celular: fases - G1, S, G2 e M (divisão) -> fase S: replicação do DNA - a capacidade das células manterem a fidelidade da informação, depende da replicação extremamente precisa -> MAQUINARIA DE REPLICAÇÃO → elevada taxa: um dos processos mais rápidos que ocorrem na célula (aproximadamente 3 mil nucleotídeos por segundo - célula bacteriana) → falhas raras: resulta em mutações (1 a cada 109 nucleotídeos) se a base trocada for numa área de produção de proteína, por exemplo, a falha pode ser muito comprometedora CARACTERÍSTICAS GERAIS DA REPLICAÇÃO - precisão - DNA molde para formação de 2 novas fitas por meiodo pareamento das bases nitrogenadas (A/T - C/G) - abertura da fita molde -> reconhecimento de um nucleotídeo complementar livre -> polimerização catalisada por enzimas (DNA polimerase) REPLICAÇÃO SEMICONSERVATIVA (Watson e Crick) SEMICONSERVATIVA - cada uma das moléculas originadas contém uma cadeia completa da molécula original e uma cadeia nova obs. CONSERVATIVA - preserva a molécula original e gera uma molécula inteiramente nova obs. DISPERSIVA - produz duas moléculas com DNA original e novo, intercalados ao longo das cadeias REPLICAÇÃO “IN VIVO” PROCARIOTOS - DNA circular, 1 único ponto de origem - E. coli - 1 divisão a cada 40 minutos EUCARIOTOS - replicação coordenada para mais de um cromossomo ao mesmo tempo; múltiplos pontos de origem (humanos: aproximadamente 10 mil pontos de replicação) - levedura - 1 divisão a cada 120 minutos - célula vegetal - 1 divisão a cada 29 horas - célula animal - 1 divisão a cada 24h (pode durar de 100 a 200 horas em algumas células; outras células nem se dividem) MECANISMO DE REPLICAÇÃO PONTO DE INÍCIO DA REPLICAÇÃO - tem início em um sítio específico do cromossomo denominado ORIGEM DE REPLICAÇÃO (em E. coli é denominado oriC - tem 245 pares de bases - nucleotídeos - de tamanho, um conjunto de sequências quase idênticas de 13 pares de base em tandem - lado a lado - e um conjunto de sítios de ligação para uma proteína - DnaA - que promove a deselicoidização do dúplex) - bases nitrogenadas sinalizam para o maquinário de proteínas identificar a origem - forma-se a BOLHA DE REPLICAÇÃO que se expande bidirecionalmente em forma de “Y” formando GARFOS ou FORQUILHAS DE REPLICAÇÃO que se movem em ambas as direções até encontrar o ponto de término - origem de replicação: → sequências ricas em A=T → localizadas em sequências específicas do DNA, sempre no mesmo ponto do cromossomo ORIGEM DA REPLICAÇÃO - EUCARIOTOS - S-Cdk inicia a replicação do DNA e auxilia a prevenir a “rerreplicação” S-CDKS (enzima/proteína - S -> fase S; CDK -> quinase dependente de ciclina) obs. CDKs - controle dos check-points: autorizam ou não a célula para avançar no ciclo celular (passar de fase para fase), vê se a célula está apta atua em G1 para enviar a célula para fase S além da extrema precisão que deve ser o processo de replicação, é necessário que o controle do Ciclo Celular verifique: a. replicação do DNA inicia no momento correto b. apenas uma vez por ciclo Cdc6: proteínas regulatórias que promovem a ligação de proteínas adicionais para formar o complexo pré-replicativo → é uma enzima obs. complexo pré-replicativo: ORC + Cdc6 formado em G1, mas a célula ainda não está pronta pra duplicar o DNA (só acontece em S), então: S-Cdks aciona a fase S e fosforila a Cdc6 (que é degradada) para evitar outro reconhecimento de ORC (complexo de reconhecimento de origem) → quando a Cdc6 é degradada, o ORC fica ativo para a replicação poder ocorrer SÍNTESE DA NOVA FITA DE DNA - incorporação de um nucleotídeo na extremidade 3’ OH livre pela enzima DNA POLIMERASE catalisa a formação de ligações fosfodiéster (mesma cadeia) entre os nucleotídeos ligando a região 3’ OH de um com a região 5’ P do outro → SÓ SINTETIZA NO SENTIDO 5’ -> 3’ - - a síntese do DNA é semidescontínua → se a DNA polimerase só sintetiza no sentido 5’ -> 3’, devido a natureza da polaridade invertida do DNA, a síntese de uma das fitas é contínua (líder) enquanto a da outra fita é descontínua (retardada) FITA LÍDER: sintetizada continuamente no sentido 5’ -> 3’ em direção ao movimento do garfo de replicação obs. para isso, a fita molde precisa ser ter início com 3’ e fim com 5’ FITA LENTA: sintetizada no sentido 5’ -> 3’ em direção OPOSTA ao movimento do garfo de replicação obs. fita molde: 5’ -> 3’ - os pequenos fragmentos só podem ser sintetizados após movimento do garfo sobre uma extensão razoável da hélice, implicando sempre um atraso em relação à fita líder - em 1968, Reiji Okazaki explicou a incompatibilidade aparente entre a replicação simultânea das duas fitas antiparalelas e o fato da DNA polimerase só adicionar nucleotídeos no sentido 5’ -> 3’ - a existência de fragmentos descontínuos de DNA com 1000 bp a 2000 bp foram denominados FRAGMENTOS DE OKASAKI - são unidos posteriormente por uma enzima específica formando a longa cadeia do DNA RESUMO - a replicação é semiconservativa - o início da replicação ocorre no sítio de origem de replicação (não é aleatório) - quantidade de origens de replicação: procariotos (1); eucariotos (milhares) - a replicação ocorre bidirecionalmente na molécula de DNA - a replicação só ocorre no sentido 5’ -> 3’ (DNA polimerase só consegue polimerizar nesse sentido) - a replicação não ocorre da mesma forma nas duas fitas da molécula de DNA → fita líder: replicação contínua em direção ao garfo de replicação → fita lenta: replicação descontínua em direção oposta ao garfo de replicação PRINCIPAIS ENZIMAS ENVOLVIDAS NA REPLICAÇÃO DO DNA - a complexidade do processo de replicação do DNA requer inúmeras proteínas com funções específicas 1. helicases 2. proteínas SSB 3. primase 4. DNA polimerase 5. DNA ligase 6. topoisomerases 7. telomerases (em eucariotos) HELICASES - auxiliam na abertura da dupla hélice do DNA separando as fitas em até 1000 pares de nucleotídeos por segund - promovem o rompimento das pontes de hidrogênio deselicoidizando o DNA na presença de ATP (pois necessitam de energia para fazer isso) - duas enzimas podem trabalhar em conjunto: uma na fita líder, outra na fita lenta → ex. DnaB em E. coli → depende da espécie do organismo PROTEÍNA SSB (Single-Strand Binding - ligação na fita simples) - proteínas de ligação à fita simples do DNA, proteínas de ligação unifilamentar ou proteínas desestabilizadoras de hélices - ligam-se fortemente de forma cooperativa às fitas simples do DNA (sem encobrir as bases), estabilizando a conformação distorcida e prevenindo a formação do dúplex → para as bases de uma única fita não fazerem a complementariedade entre si PRIMASE - a DNA polimerase pode ampliar a cadeia mas não pode começar a cadeia - a síntese deve ser iniciada a partir de um curto oligonucleotídeo que gera um segmento dúplex - capaz de sintetizar pequenos fragmentos de RNA complementares a uma região específica do DNA → RNA iniciadores ou primers - sintetiza o primer deixando uma extremidade 3’-OH livre disponível para a DNA polimerase alongar a cadeia - conforme ocorre a formação da fita filha, esses primers vão sendo retirados (até pq eles podem conter uracila, que não faz parte do DNA) FITA LÍDER: apenas um primer é preciso no início da replicação FITA LENTA: cada vez que a DNA polimerase completa um fragmento de Okasaki um novo primer é adicionado obs. eucariotos: primers com aproximadamente 10 nt. (nucleotídeos) → na fita descontínua são produzidos em intervalos de 100 a 200 nt. obs. E. coli: primers com aproximadamente 50 a 60 nt em E. coli a primase está ligada a helicase e outras proteínasformando um complexo com o DNA molde denominado primossomo DNA POLIMERASE - descoberta em 1957 por Arthur Kornberg - principal função: polimerizar nucleotídeos - é uma enzima que catalisa a reação de replicação do DNA - sintetiza a nova cadeia na direção 5’ -> 3’ (move-se no DNA molde no sentido 3’ -> 5’) - catalisa a formação de ligações fosfodiéster entre os nucleotídeos ligando a região 3’ OH de um com a região 5’ P do outro 1. PROCARIOTOS: E. coli DNA polimerase I (três atividades) → polimerase: catalisa o crescimento da cadeia no sentido 5’ -> 3’ → exonuclease 5’ -> 3’: apara o DNA, promove a excisão dos primers e polimerização → exonuclease 3’ -> 5’: remove bases pareadas erradas DNA polimerase II (reparo do DNA) DNA polimerase III (principal enzima de polimerização → forma holoenzima (Pol I e mais 20 subunidades) DNA polimerase IV e V (descobertas recentemente - reparo do DNA) obs. alguns autores chamam o maquinário de replicação de replissomo 2. EUCARIOTOS identificadas pelo menos 15 DNA polimerases diferentes denominadas: ,,,,,,,,,,,,, e Rev1 polimerases e : funções similares a Polimerase I da E. coli polimerase : responsável pela replicação do DNA em mitocôndrias polimerases ,,,,,,,,,, e Rev1 : reparo do DNA ou têm outras funções metabólicas algumas DNA polimerases não têm a atividade de exonuclease 3’ -> 5’ obs. é possível comprar DNA polimerase de bactérias (principalmente da Thermus aquaticus) para fazer esse processo in vitro DNA LIGASE - atua unindo os fragmentos de Okasaki - liga os nucleotídeos catalisando a formação da ligação fosfodiéster entre a extremidade 5’-P de um nucleotídeo e a extremidade 3’-OH do nucleotídeo adjacente - DNA ligase sozinha não tem atividade em rupturas no DNA com perda de um ou mais nucleotídeos → as falhas só podem ser preenchidas e vedadas pela ação combinada de uma DNA polimerase e uma DNA ligase TOPOISOMERASES - a ação das helicases para abrir as forquilhas de replicação gera torções no DNA circular que precisam ser removidas para permitir que a replicação continue - topoisomerases desfazem as torções do DNA gerado pelo desenovelamento do DNA pela DnaB (helicase) - removem laçadas no DNA - dois tipos: 1. tipo I: provocam uma quebra unifilamentar no DNA ex. Topo I e Tpo III em E. coli 2. tipo II: provocam uma quebra em ambos os filamentos do DNA ex. DNA girase em E. coli obs. existem antibióticos e antifúngicos que inibem a ação das topoisomerases nas bactérias e nos fungos - o DNA se enrola e não se replica REPLICAÇÃO NAS PONTAS DOS CROMOSSOMOS FITA CONTÍNUA: replicação estende-se até as pontas dos cromossomos FITA DESCONTÍNUA: ? - no final da fita, um trecho fica sem primer - cromossomo fica encurtado? - bactérias: DNA circular (não há problema) - eucariotos? RESPOSTA: EUCARIOTOS: sequências especiais de nucleotídeos nos telômeros -> atraem telomerase (em humanos a sequência é GGGTTA - cerca de 10 mil nucleotídeos) TELOMERASE - adiciona as unidades repetidas às pontas dos cromossomos - leva uma pequena molécula de RNA que atua como um molde para a polimerização na extremidade telomérica 3’OH → não precisa de primer - é membro de uma classe de enzimas das transcriptases reversas (que sintetizam DNA a partir de RNA) obs. envelhecimento - regiões de ponta de cromossomo, mesmo que tenha um papel importante das telomerases, a cada divisão celular elas vão encurtando -> isso mostra que a célula já sofreu tanto processo de divisão que pode ser um marcador para o envelhecimento celular e a célula pode ser enviada para apoptose obs. regiões teloméricas - altas repetições de DNA
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