Questionário conceitos genes e genomas

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RECAPITULAÇÃO DE CONCEITOS DE GENES E GENOMAS
1. Conceitue e diferencie, em termos gênicos ORF e CDS.
ORF – Open Reading Frame
CDS – Coding Sequence
As ORFs e as CDS são parecidas. As ORFs são caracterizadas por toda a sequência de éxons e íntrons, começando no códon de iniciação e terminando no códon de terminação. Já as CDS englobam essas sequências de início e fim e a região dos éxons (após retirada dos íntrons).
2. Defina gene ortólogo, parálogo e xenólogo.
Genes parálogos – Genes que sofreram duplicação e se modificaram ao longo do tempo, de modo que possuem funções distintas.
Genes ortólogos – Genes que sofreram especiação e ao longo do tempo passaram a desempenhar as mesmas funções.
Genes xenólogos – Genes ortólogos que foram adquiridos por duas espécies distintas (ou mais) de maneira independente.
3. Se compararmos um determinado gene hipotético X da levedura Saccharomyces cerevisiae com o seu ortólogo de camundongo, o último apresentará um tamanho potencialmente maior. Qual a potencial razão disto?
A maior presença de íntrons no genoma do camundongo poderia explicar a maior extensão do gene.
4. Quais as possíveis combinações de códons presentes no código genético poderiam dar origem ao peptídeo hipotética cuja sequência é MCRI?
Para formação de Metionina, o único códon possível é o de iniciação – AUG
Para Cisteína, os possíveis são – UGU, UGC
Para Arginina – AGA, AGG, CGU, CGC, CGG, CGA
Para Isoleucina – AUU, AUC, AUA
Códons de terminação – AUG, UAA, UGA
As combinações possíveis são 108:
AUG UGU AGA AUU AUG
AUG UGU AGG AUU AUG
AUG UGU CGU AUU AUG
AUG UGU CGC AUU AUG
AUG UGU CGG AUU AUG
AUG UGU CGA AUU AUG
AUG UGC AGA AUA AUG
AUG UGC AGG AUA AUG
AUG UGC CGU AUA AUG
AUG UGC CGC AUA AUG
AUG UGC CGG AUA AUG
AUG UGC CGA AUA AUG
AUG UGU AGA AUA AUG
AUG UGU AGG AUA AUG
AUG UGU CGU AUA AUG
AUG UGU CGC AUA AUG
AUG UGU CGG AUA AUG
AUG UGU CGA AUA AUG
AUG UGC AGA AUU AUG
AUG UGC AGG AUU AUG
AUG UGC CGU AUU AUG
AUG UGC CGC AUU AUG
AUG UGC CGG AUU AUG
AUG UGC CGA AUU AUG
AUG UGU AGA AUC AUG
AUG UGU AGG AUC AUG
AUG UGU CGU AUC AUG
AUG UGU CGC AUC AUG
AUG UGU CGG AUC AUG
AUG UGU CGA AUC AUG
AUG UGC AGA AUC AUG
AUG UGC AGG AUC AUG
AUG UGC CGU AUC AUG
AUG UGC CGC AUC AUG
AUG UGC CGG AUC AUG
AUG UGC CGA AUC AUG
AUG UGU AGA AUU UAA
AUG UGU AGG AUU UAA
AUG UGU CGU AUU UAA
AUG UGU CGC AUU UAA
AUG UGU CGG AUU UAA
AUG UGU CGA AUU UAA
AUG UGC AGA AUA UAA
AUG UGC AGG AUA UAA
AUG UGC CGU AUA UAA
AUG UGC CGC AUA UAA
AUG UGC CGG AUA UAA
AUG UGC CGA AUA UAA
AUG UGU AGA AUA UAA
AUG UGU AGG AUA UAA
AUG UGU CGU AUA UAA
AUG UGU CGC AUA UAA
AUG UGU CGG AUA UAA
AUG UGU CGA AUA UAA
AUG UGC AGA AUU UAA
AUG UGC AGG AUU UAA
AUG UGC CGU AUU UAA
AUG UGC CGC AUU UAA
AUG UGC CGG AUU UAA
AUG UGC CGA AUU UAA
AUG UGU AGA AUC UAA
AUG UGU AGG AUC UAA
AUG UGU CGU AUC UAA
AUG UGU CGC AUC UAA
AUG UGU CGG AUC UAA
AUG UGU CGA AUC UAA
AUG UGC AGA AUC UAA
AUG UGC AGG AUC UAA
AUG UGC CGU AUC UAA
AUG UGC CGC AUC UAA
AUG UGC CGG AUC UAA
AUG UGC CGA AUC UAA
AUG UGU AGA AUU UGA
AUG UGU AGG AUU UGA
AUG UGU CGU AUU UGA
AUG UGU CGC AUU UGA
AUG UGU CGG AUU UGA
AUG UGU CGA AUU UGA
AUG UGC AGA AUA UGA
AUG UGC AGG AUA UGA
AUG UGC CGU AUA UGA
AUG UGC CGC AUA UGA
AUG UGC CGG AUA UGA
AUG UGC CGA AUA UGA
AUG UGU AGA AUA UGA
AUG UGU AGG AUA UGA
AUG UGU CGU AUA UGA
AUG UGU CGC AUA UGA
AUG UGU CGG AUA UGA
AUG UGU CGA AUA UGA
AUG UGC AGA AUU UGA
AUG UGC AGG AUU UGA
AUG UGC CGU AUU UGA
AUG UGC CGC AUU UGA
AUG UGC CGG AUU UGA
AUG UGC CGA AUU UGA
AUG UGU AGA AUC UGA
AUG UGU AGG AUC UGA
AUG UGU CGU AUC UGA
AUG UGU CGC AUC UGA
AUG UGU CGG AUC UGA
AUG UGU CGA AUC UGA
AUG UGC AGA AUC UGA
AUG UGC AGG AUC UGA
AUG UGC CGU AUC UGA
AUG UGC CGC AUC UGA
AUG UGC CGG AUC UGA
AUG UGC CGA AUC UGA
5. De acordo com quais características físico químicas podem ser classificados os 20 aminoácidos geralmente encontrados em sequências proteicas?
Eles podem ser classificados como ácidos (possuem grupos carboxilas), básicos (possuem grupos amina), polares ou apolares.