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Profa. Dra. Raquel Dantas Introdução o Variabilidade Genética: - Mecanismo pelo qual organismos evoluem ao longo do tempo - É através dela ocorre a evolução e adaptação dos organismos ao ambiente - As bactérias apresentam dois mecanismos de variabilidade genética, que ocorrem durante a transferência de material genético: A mutação e a Recombinação gênica Introdução o Como procariotos transferem genes? Mutação Recombinação Gênica Evolução: criação de novos alelos ao longo do tempo, micro-organismos mais adaptados ao ambiente TVG THG Introdução Mutação Recombinação Gênica Novas características Seleção Natural Considerada boa para o micro- organismo Não é considerada boa Adaptação ao ambiente Desaparece característica Introdução Adaptação Mutação Recombinação Gênica Novas características Seleção Natural Mutação Mutação o Alteração hereditária na sequência de bases do genoma de um organismo - É passada de célula-mãe para sua progênie - Alterações: vantajosas ou prejudiciais; maioria é neutra (sem efeitos) - Mutante: alteração na sequência nucleotídica em relação à sua linhagem parental (selvagem) Genótipo mutante => Fenótipo mutante ou não Mutação Fenótipo mutante => característica genética da mutação é expressa Mutação o As mutações podem ser espontâneas ou induzidas Espontânea • Independe de intervenção externa Induzida • Depende de uma intervenção ambiental externa • Exposição à agentes mutagênicos ou fatores que geram pressão seletiva Mutação Substituições de Pares de Bases Alterações de fase de leitura - Mutação pontual - Reversões - Inserções - Deleções Mutação 1) Substituições de Pares de Bases - Mutação pontual: em um único par de bases Mutação 1) Substituições de Pares de Bases - Mutação pontual: em um único par de bases Mutação oReversões - Mutações pontuais podem ser Reversíveis Linhagem Revertente => FENÓTIPO perdido pelo mutante é restaurado • Revertente de mesmo sítio: mutação reversa ocorre no mesmo sítio da mutação original - Restaura o gene e o fenótipo selvagem • Revertente de segundo sítio: mutação reversa em sítio diferente da mutação original, mas também restaura o fenótipo selvagem Mutação oReversões • Revertente de segundo sítio Ex.: Mutação Supressora de RNAt Mutação Original + Mutação Supressora Fenótipo Selvagem Mutação 2) Alterações de Fase de Leitura - Inserções e deleções • Uma base: alteram toda a sequência primária do polipeptídeo codificado • Três bases: adiciona ou remove códon inteiro (não altera o quadro de leitura dos demais códons) Mutação oMutagênese • Agentes mutagênicos - Químicos, físicos ou biológicos - Aumentar a frequência de mutações (induzir) Mutação Substituição de Pares de Bases Mutação Substituição de Pares de Bases Reagem com grupos amino, carboxil e hidroxil de proteínas e ácidos nucleicos, substituindo por grupos alquil Maior frequência de mutação que os análogos de bases Induzem mutação em moléculas de DNA que não se encontram em replicação Mutação Alteração da Fase de Leitura Inserem-se entre duas pares de bases => conformação anormal pode levar a inserções ou deleções em moléculas de DNA Brometo de Etídio Induzem mutação (inserções e deleções) durante a replicação do DNA Mutação 260 nm Raios UV – dímero de pirimidinas C-T Recombinação Gênica Recombinação Gênica o Micro-organismos estreitamente relacionados, mas que exibem diferentes fenótipos, possuem nítidas diferenças no genoma o Transferência Horizontal de Genes (THG), a partir de mecanismos de Recombinação Genética - Troca de elementos Genéticos Móveis - Pangenoma vrs. Genoma cerne • Genoma cerne Presente em todos • Pangenoma Presença de elementos genéticos móveis Recombinação Gênica Plasmídeos Sequências de Inserção Transposons Integrons Elementos genéticos móveis Sistema de captura de genes Ilhas cromossômicas Blocos adicionais de genes cromossomais Recombinação Gênica • DNA dupla-fita circular livre na célula • Replicação independente (própria origem de replicação, porém dependem das enzimas) Tamanho variado – 1Kb a mais de 1 Mb Em E.coli já foram isolados cerca de 300 plasmídeos diferentes Menos de 5% do tamanho do cromossomo Plasmídeos Recombinação Gênica • Genes não essenciais (vantagem adaptativa) - Diferentes plasmídeos podem estar presentes - Vários plasmídeos iguais número de cópias - Poucas cópias (1 a 3 cópias por célula) a mais de 100 cópias Plasmídeos Recombinação Gênica Contém genes necessários à conjugação Fator F F+ F- - Tipos de Plasmídeos (quanto a fertilidade) • Conjugativos (de fertilidade): Óperon tra (genes para transferência do plasmídeo, por meio da conjugação - célula F+) • Não-conjugativos: ausência de tra Plasmídeos Recombinação Gênica Contém genes necessários à conjugação Fator F - Tipos de Plasmídeos (quanto a fertilidade) • Conjugativos (de fertilidade): Óperon tra (genes para transferência do plasmídeo, por meio da conjugação - célula F+) • Não-conjugativos: ausência de tra Plasmídeos Recombinação Gênica - Tipos de Plasmídeos (quanto à função) Plasmídeos de resistência (R), genes de resistência aos antimicrobianos e outras substâncias Tc, tetraciclina; Kan, canamicina; Sm, estreptomicina; Su, sulfonamida; Amp, ampicilina; e Hg, mercúrio. Plasmídeos Recombinação Gênica Plasmídeos de virulência, bactérias patogênicas (doenças) - Tipos de Plasmídeos (quanto à função) Plasmídeos Recombinação Gênica Plasmídeos de virulência, bactérias patogênicas (doenças) - Tipos de Plasmídeos (quanto à função) Plasmídeos Tumores em plantas Agrobacterium sp. Recombinação Gênica Outros: Col-plasmídeos, genes de colicinas (bacteriocina) Plasmídeos degradativos, que permitem a digestão de substâncias pouco habituais – enzimas degradativas (ex.: toluol, ácido salicílico) - Tipos de Plasmídeos (quanto à função) Plasmídeos Recombinação Gênica o Elementos Genéticos Móveis - Elementos transponíveis • Movem-se como unidades, de um sítio a outro, no interior de outras moléculas de DNA (cromossomo ou plasmídeo) => Transposição • Não possuem origens de replicação • Encontrados em genomas dos três domínios Bactérias: Transposons e Sequências de Inserção (IS) Recombinação Gênica Transposons e Sequências de Inserção (IS) o Transposição: - Gene tnp => enzima TRANSPOSASE - Repetições terminais invertidas Recombinação Gênica Sequências de Inserção (IS) o São mais simples e menores - Cerca de 1.000 nt, com repetições invertidas de 10 a 50 pb (depende da IS) - Apenas um gene => tnp (Transposase) - Cromossomos, plasmídeos e bacteriófagos - Linhagens individuais de mesma espécie bacteriana podem variar em número e localização IS2 = 1.327 pb, com repetições invertidas = 41 pb o Elementos compostos e maiores - Apresenta genes acessórios entre IS (ex: genes de resistência aos antimicrobianos) Recombinação Gênica Transposons Tn5; 5,7 kpb, com IS50L e IS50R nas extremidades. Genes de resistência: kan: Canamicina; str: estreptomicina e bleo: bleomicina Recombinação Gênica 1. Transposase reconhece e cliva o DNA-alvo 2. Transposase liga o transposon (ou IS) no DNA 3. Ocorre a duplicação das sequencias que flanqueiam o tnp o Mecanismos de transposição Recombinação Gênica o Mecanismos de transposição 1. Transposase reconhece e cliva o DNA-alvo 2. Transposase liga o transposon (ou IS) no DNA 3. Ocorre a duplicação das sequencias que flanqueiam o tnp Recombinação Gênica o Mecanismos de transposição - Plasmídeo para cromossomo (ou vice e versa); entre plasmídeos; entre cromossomos - 2 tipos: conservativa e replicativa - Sistema de captura de cassetes gênicos - Recombinação sítio-específica - Não-móvel; cassetes gênicos são: • Elemento genético móvel - contém um gene (ex.: resistência) e um local de recombinação • Incorporados em um integron ou livremente como DNA circular • Podem se mover dentro do genomade um organismo ou ser transferidos para outro organismo no ambiente por meio de transferência horizontal de genes (recombinação) Recombinação Gênica Integrons Recombinação Gênica - 3 elementos dos integrons: - intI (integrase, inserção e excisão dos cassetes gênicos); - attI e attC (locais de recombinação do integron e do cassete gênico, respectivamente) - Promotor Pc (expressão correta dos cassetes gênicos) Integrons Integrase Recombinação Gênica - 3 elementos dos integrons: - intI (integrase, inserção e excisão dos cassetes gênicos); - attI e attC (locais de recombinação do integron e do cassete gênico, respectivamente) - Promotor Pc (expressão correta dos cassetes gênicos) Integrons Recombinação Gênica Integrons Recombinação Gênica Exemplo: Integron de classe 1 blaVIM-1 => metalo-β-lactamase => Resistência aos carbapenêmicos aadB => Resistência a gentamicina, tobramicina e canamicina dfrA1 => Resistência trimetropima orfC => Proteína de membrana qacEΔ1 e sul1 => regiões conservadas (resistência ao brometo de etídio e sulfonamidas) Integrons Recombinação Gênica o Ilhas cromossômicas - Blocos adicionais de material genético no cromossomo - Genes para funções especializadas (não de sobrevivência) - Função de Virulência Exemplo: Ilhas de patogenicidade (536) e (073) linhagens patogênicas e (K-12) linhagem selvagem Círculo externo, verde (todas linhagens); vermelho, (linhagens patogênicas); azul, (536); laranja, (073) 1. ConjugaçãoI. Transformação 1. Conjugação I. Transformação DNA livre no meio é incorporado ao genoma - Fragmentos obtidos por células receptoras Transformação natural Induzida Estado de competência capacidade de capturar e integrar o DNA exógeno ao cromossomo Acinetobacter, Bacillus, Streptococcus, Haemophilus, Neisseria e Thermus E. Coli Tratamento com íons cálcio ou eletroporação 1. Conjugação I. Transformação DNA livre no meio é incorporado ao genoma a)Ligação do DNA de dupla-fita por uma proteína de ligação ao DNA associada à membrana. (b)Passagem de uma das duas fitas para o interior da célula, enquanto a atividade de nuclease degrada a outra fita; proteínas específicas se ligam a fita simples e a protege da ação de nucleases. Transformação em bactérias Gram - positivas 1. Conjugação I. Transformação DNA livre no meio é incorporado ao genoma Transformação em bactérias Gram - positivas (c) A recombinação homóloga no cromossomo bacteriano é mediada pela proteína RecA. (d)Célula transformada (substituição do DNA entre célula receptora e doadora) . Obs: Bactérias Gram – negativas recebem DNA fita-dupla 1. ConjugaçãoII. Transdução 1. Conjugação II. Transdução Bacteriófago transfere DNA entre células - Duas formas: generalizada e especializada - Exemplos: genes de resistência a atb (Salmonella enterica sorovar typhimurium); genes para toxina Shiga (E. coli); fatores de virulência (Vibrio cholerae); genes de fotossíntese (cianobactérias) GENERALIZADA DNA de qualquer região do genoma do hospedeiro é empacotado no vírion maduro, substituindo o genoma viral ESPECIALIZADA região específica do cromossomo do hospedeiro é integrado no genoma viral – geralmente substitui alguns dos genes virais 1. Conjugação II. Transdução Ciclo Lítico - Fago infecta a bactéria, apodera-se dela para sintetizar inúmeros fagos, e então mata a célula por explosão (Lise) 1. Conjugação II. Transdução Ciclo Lisogênico - Fago infecta a bactéria e insere seu DNA no cromossomo bacteriano, permitindo que o DNA do fago seja copiado e transmitido pelo próprio DNA da célula 1. Conjugação II. Transdução Transdução generalizada - Ciclo lítico fagos líticos Incapazes de infecção viral II. Transdução Transdução especializada - Ciclo lisogênico – fagos temperados Exemplo: genes de galactose pelo fago temperado lambda, de E. coli 1. Fago lambda lisogeniza E. coli, (genoma viral integra ao DNA bacteriano em sítio específico – adjacente genes gal) 2. Indução, o DNA viral separa-se do DNA hospedeiro por um processo inverso à integração 3. Genes do Óperon galactose são excisados junto ao genoma viral III. Conjugação 1. Conjugação III. Conjugação Acasalamento: contato direto entre células - Codificado por plasmídeos conjugativos - Plasmídeo F = região tra (genes para produção do pilus sexual) - Célula doadora (F+) receptora (F-) III. Conjugação Mecanismo de conjugação Replicação do plasmídeo por círculo rolante Proteína de replicação se liga à origem e cliva uma das fitas (TraI) III. Conjugação Mecanismo de conjugação Proteína TraI III. Conjugação Mecanismo de conjugação À medida que a transferência ocorre, a síntese de DNA repõe a fita transferida na célula doadora, enquanto uma fita complementar é sintetizada na célula receptora. Ao final do processo, célula doadora e receptora terão plasmídeos completos.
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