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Questionário 2 Pergunta 1 Até a década de 70 era ainda muito difícil de estudar a molécula de DNA, sequenciá-la para analisar os genes de forma mais aprofundada. Essa questão só ficou melhor após o desenvolvimento de técnicas modernas de sequenciamento, os dois métodos que revolucionaram esse campo foram: A. A técnica de sequenciamento de DNA sofreu pouco avanço nos últimos anos, muito devido ao alto custo de sua aplicação. B. O desenvolvimento das polimerases estáveis permitiu um sequenciamento mais seguro e rápido, diferenciando-os das demais técnicas. C. As técnicas de reação em cadeia da polimerase foi a única técnica capaz de revolucionar os métodos de sequenciamento de DNA D. A metodologias de sequenciamento de Gilbert e Sanger revolucionou a forma de se fazer o sequenciamento de DNA. E. O método de DNA recombinante foi revolucionário permitindo sequenciar um genoma completo de forma rápida, eficaz e com baixo custo. Pergunta 2 O avanço das tecnologias e métodos para aprimoramento das técnicas de PCR permitiu o desenvolvimento de diversos tipos diferentes de PCR. Um dos tipos mais proeminentes e mais utilizados é a PCR em tempo real. Essa técnica se caracteriza pelo fato de: A. A qPCR recebe essa denominação, representada por essa sigla, pelo fato da polimerase nessa reação ser especializada permitindo a quantificação do fragmento de polimerase B. A tecnologia de PCR em Tempo Real (qPCR) é uma evolução do método de PCR (Polymerase Chain Reaction ou Reação em Cadeia da Polimerase). Seu princípio se baseia na duplicação de cadeias de DNA “in vitro” que pode ser repetida diversas vezes, gerando quantidade de DNA suficiente para realizar diversas análises. Com apenas um único fragmento de DNA é possível reproduzir milhões de cópias. C. Essa técnica se diferencia por não precisar de um DNA molde para amplificação, basta apenas adicionar um DNA de concentração conhecido para que ele possa ser quantificado durante a reação. D. A PCR em tempo real segue o mesmo padrão da técnica normal, possibilitando apenas à amplificação em tempo real, sem permitir a quantificação da molécula alvo. E. A técnica em tempo real é pouco viável na prática, sendo por esse motivo pouco aplicável em nenhuma área de atuação, se restringindo a pesquisa científica em institutos apenas.A reação de amplificação do DNA é acompanhada de outro fragmento de DNA com concentração conhecida, possibilitando a quantificação do alvo em tempo real, por isso a sigla qPCR. Pergunta 3 A manipulação do DNA envolve um conjunto de técnicas que estão inseridas na disciplina denominada biologia molecular, e se empenham em estudar e desenvolver formas de isolar, clonar, manipular e estudar o DNA dos organismos vivos. Em relação ao histórico desse procedimento realizado pelo homem podemos afirmar: A. Através da manipulação do DNA a ciência deu um grande salto do entendimento do código genético, contudo o custo e complexidade das técnicas fizeram com que elas não fossem levadas adiante. B. A tecnologia do DNA é a composição de técnicas que permitem o homem apenas estudar o DNA e os genes nos ambientes acadêmicos, dentro dos institutos de pesquisa. C. As técnicas de manipulação são extremamente recentes só sendo capazes de serem desenvolvidas após o conhecimento detalhado da estrutura e composição do DNA e dos genes como um todo. D. A manipulação do DNA pelo homem não é um processo recente sendo realizado há muitos séculos atrás, através de cruzamentos seletivos para obtenção de características o homem “domesticou” várias espécies. E. O homem, apesar do desenvolvimento tecnológico na área de manipulação genética, só consegue atualmente isolar um gene para estudá-lo, não tendo esse procedimento uma aplicação muito prática na sociedade. Pergunta 4 O conhecimento do código genético, caracterizado pelas sequências específicas de nucleotídeos, foi fundamental para o desenvolvimento das tecnologias do DNA. Encontrar ferramentas que fragmentassem esse DNA nessas sequências específicas para permitir a manipulação desse código foi imprescindível na época. Sobre as ferramentas que possibilitaram isso é correto: A. Um grande salto para as tecnologias do DNA foi a descoberta das enzimas bacterianas conhecidas como enzimas de restrição, porém essa técnica é pouco aplicável por cortar apenas sequências curtas. B. As enzimas de restrição se mostraram ferramentas importantíssimas para utilização como tesouras moleculares, porém sua obtenção a partir de bactérias torna essas enzimas não aplicáveis em seres humanos. C. O homem ainda busca o desenvolvimento de ferramentas que consigam clivar o DNA em regiões específicas e que não atuem de forma aleatória como a maioria das enzimas atuais. D. A descoberta de tesouras moleculares não é uma prioridade, na atualidade, para o desenvolvimento da tecnologia do DNA, visto que o grande enfoque no momento e sequenciar e conhecer os genes humanos E. A descoberta de uma classe de enzimas bacterianas denominadas enzimas de restrição, capazes de cortar o DNA em sequências altamente específicas, foi um marco no desenvolvimento das tecnologias do DNA. Pergunta 5 O método de PCR já é bem estabelecido com uma técnica de vanguarda na biologia molecular e que apresenta muitas vantagens em relação ao processo anterior de amplificação do DNA, por isso sendo aplicado em vários campos do conhecimento. Sobre o diferencial que essa técnica apresenta podemos citar: A. A PCR é capaz de replicar sequências do DNA in vitro sem a necessidade do uso de células e com grande rapidez e seletividade. B. A rapidez com que é feita a replicação do DNA através da PCR é seu grande diferencial, contudo a seletividade dessa técnica ainda é muito baixa. C. A grande diferença da técnica de PCR é que ela é capaz de replicar grandes pedaços de DNA com o auxílio de células específicas. D. O grande diferencial é apenas poder realizar a replicação in vitro, sendo um processo tão demorado e custoso como os anteriores. E. O processo para amplificar DNA com base na PCR é diferente do anterior, pois é feito uma parte in vitro e outra com a utilização de células. Pergunta 6 Os métodos automatizados aprimoraram a técnica de Sanger trazendo um desenvolvimento ainda maior dos processos de sequenciamento do DNA. Entre os fatores que tornam o método automatizado melhor do que o tradicional podemos citar: A. O sequenciamento automatizado rompeu totalmente com o método de Sanger aplicando procedimentos totalmente novos. B. O uso de marcadores fluorescentes permitiu um sequenciamento mais seguro que o radioativo e mais rápido por ser feito através de leitura automatizada. C. O uso de marcadores radioativos é característico das técnicas automatizadas, permitindo uma leitura mais eficaz. D. O alto custo da automatização é um fato que impossibilita o uso desse tipo de técnica em larga escala. E. A única característica que a diferencia do método de Sanger é a utilização de marcadores fluorescentes. Pergunta 7 A reação de cadeia da polimerase – PCR, além de tecnologias para seu funcionamento precisou do estudo e identificação de uma série de variáveis que impactam diretamente na eficácia dessa técnica. Sobre as etapas fundamentais para realização da PCR é correto afirmar: A. A PCR consiste em três etapas que são a desnaturação da proteína para abertura da fita de DNA, ligação dos iniciadores sintéticos e ampliação através de enzima Taq DNA polimerase. B. As etapas para realização da PCR não estão relacionadas com a obtenção das cópias de DNA, sendo essas dispensáveis para realização de todo o processo de amplificação. C. Para a realização da PCR não é necessário quebrar, ou seja, desnaturar a dupla fita de DNA, sendo totalmente possível amplificar os fragmentos de DNA mesmo mantendo sua estrutura de dupla hélice. D. Enzimas conhecidas como polimerases são as principais responsáveis pela amplificação do DNA por adicionarem os pares complementares,por isso são os únicos fatores indispensáveis para a PCR. E. Pelo fato de a PCR estar ainda em fase experimental ainda não há um protocolo totalmente estabelecido para realização dessa técnica, sendo possível adaptar a diversos outros protocolos Pergunta 8 A clonagem de um gene é um conjunto de técnicas que permite isolar uma sequência de DNA e simplificá-la para uma aplicação desejada. As técnicas do DNA recombinante são bastante usadas para esse fim, isso até o desenvolvimento das técnicas atuais de amplificação. Sobre as técnicas atuais para amplificar sequências de DNA, podemos afirmar: A. A técnica denominada reação em cadeia da polimerase – PCR vem substituindo os métodos de DNA recombinante por serem mais rápidos, sensíveis e baratos. B. Os processos para amplificar fragmentos de DNA ainda são pouco usados devido a sua complexidade e alto custo. C. As técnicas de DNA recombinante ainda são as mais utilizadas para amplificar fragmentos de DNA, visto que nenhuma outra técnica melhor foi desenvolvida D. A amplificação do DNA é um procedimento ainda em experimentação, por isso somente utilizado nos institutos de pesquisa científica. E. Na atualidade, a reação em cadeia da polimerase – PCR é uma alternativa ainda pouco usada para amplificar o DNA, devido a sua alta complexidade. Pergunta 9 O sequenciamento do genoma de organismos vivos dependeu de uma série de fatores que vão desde o desenvolvimento de tecnologias até a evolução do conhecimento sobre biologia molecular e das características intrínsecas da molécula de DNA. O estudo do genoma contribui: A. No diagnóstico de microrganismos patogênicos que impactam a saúde, sendo o estudo do genoma focado somente nesta área da medicina, visto seu potencial de aplicação. B. O sequenciamento de DNA genômico por completo, por ser extremamente complexo, ainda não foi totalmente possível, sendo necessário maior investimento e desenvolvimento nessa área. C. Na identificação de genes capazes de causar doenças genéticas, no entendimento dos processos evolutivos e na medicina através da prevenção, diagnóstico e formas de tratamento para diversas doenças. D. Apenas na identificação de genes mutantes capazes de causar doenças genéticas em humanos, sendo outras aplicações que não sejam essas impossíveis de serem desenvolvidas. E. A genômica é uma área da ciência focada no estudo da natureza química dos genes dos diversos organismos vivos, sem se preocupar com a ordem das sequências nas quais eles estão dispostos. Pergunta 10 A partir da virada do século novas abordagens para o sequenciamento de DNA, que romperam totalmente com os métodos de Sanger, foram desenvolvidos. Denominados de sequenciamento de nova geração eles apresentam uma superioridade sobre as técnicas anteriores, principalmente evidenciados por mudanças como: A. O que diferencia os sequenciamentos de nova geração dos anteriores é a quantidade de bases que cada um pode obter, sendo as outras características preservadas iguais às técnicas anteriores. B. As mudanças que as técnicas na nova geração apresentam é somente o baixo custo, já que o método de sequenciamento é apenas uma adaptação da metodologia de Sanger. C. As técnicas de nova geração só receberam esse nome pois utilizam sequenciamento automatizado com base em marcadores fluorescentes de baixo custo e alta especificidade. D. A velocidade e quantidade de etapas, a baixa concentração das amostras de DNA e o custo extremamente baixo são as mudanças mais significativas das tecnologias de nova geração. E. A única mudança realmente significativa das técnicas de nova geração foram as baixas concentrações nas quais as técnicas podem ser realizadas, tendo a possibilidade de usar pequenas quantidades de DNA.