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Tradução Procariotos síntese de proteínas Tudo junto e misturado Operons Sem íntrons Colinearidade quando existe uma proporção linear digamos entre o número de nucleotídeos do mRNA e o tamanho da proteína Eucariotos síntese de proteínas Tudo separado mRNA vai do núcleo para citoplasma Processamento Cap e PoliA Genes isolados Com íntrons Sem colinearidade Processamento Splicing Gene Hipótese de um gene = um polipeptídio (um gene equivale a um conjunto de aminoácidos) Hemoglobina = 2 genes = 1 produto funcional Estrutura das proteínas Carbono central ligada a um grupo carboxila e uma grupo amino e um grupo radical Grupo radical/lateral da diferença química para os aminoácidos Polipeptídio são agrupamento de aminoácidos por ligações peptídicas Estrutura 1° agrupamento de aminoácidos Estrutura 2° Interação entre aminoácidos forma hélice alfa ou forma folha Beta dobrada Estrutura 3° estrutura tridimensional de 1 polipeptídio (enovelamento das hélices e das folhas pregueadas) Estrutura 4° associação de dois ou mais polipeptídios através de ligações covalentes estrutura funcional da proteína Ex: hemogolobina = junção de 2 proteínas Tradução Necessário 1. Ribossomos 2. tRNA 3. Aminoácidos 4. Códons – dentro do RNAm, é um agrupamento de 3 bases 1 códon = 3 nucleotídeos (A, G, U, C) 3 nucleotídeos = 1 aminoácido = 64 = 20 aminoácidos! Código genético Praticamente universal códons com a mesma função em ≠ espécies Preciso mesmo códon não codifica aminoácidos diferentes AUG- sempre vai sintetizar um metionina Degenerado códons diferentes podem codificar o mesmo aa Códons de terminação indicar que a proteína terminou Os códons são escritos 5′ → 3′, como eles aparecem no mRNA Códon de iniciação AUG (metionina) Inicia leitura Não significa que todas as proteínas maduras tem a metionina, pode ser cortado essa parte através de um processamento Códon e tRNA Anticódon (região no tRNA) Complementar ao códon Antiparalela tRNA Transportar aminoácidos Pareamento oscilante Permite que o mesmo RNAt reconheça múltiplos códons para o aminoácido que carrega Pareamento mais flexível no 3° códon Serina → 6 códons & 3 tRNAs Síntese do tRNA Aminoacil-tRNA sintetase Enzimas que vão reconhecer a sequência dos transportadores com o pareamento específicos com aminoácidos Uma para cada tipo de aminoácido Enzima que liga o aminoácido apropriado ao seu tRNA correspondente Ribossomo Conjunto de rRNA + proteínas E saída Peptidil-tRNA onde fica a peptídeo crescente Aminoacil-tRNA entrada Etapas da tradução Iniciação montagem do ribossomo e adição dos primeiros aminoácidos Iniciação em procariotos 1. Associação do transportador por uma metionina formilhada (radical formil) e faz ligação o fator de iniciação 2 (IF-2) 2. Associação do rna mensageiro com a subunidade menor do ribossomo e o fator de iniciação 3 (IF-3) 3. Mrna pareia com 16s da subunidade menor do ribossomo = sequência de Shine-Dalgarno 4. Após tem o códon de início para a metionina 5. Complexo formado se liga a IF-1 e GTP para formar o complexo de iniciação 30s 6. Depois que acontece a formação da 1° metionina é ligado a subunidade maior do ribossomo 7. Ocorre a liberação de IF-3 ligação da subunidade maior 50s ao complexo de iniciação GTP é clivado e IF-1 e IF-2 são liberados Iniciação em eucariotos Metionina não é formilada + de 7 fatores de iniciação Complexo da subunidade 30s já tem o transportador carregado Liga-se na ponta do mRNA no cap 5’ ajuda do posicionamento da subunidade menor com o primeiro transportador Sem sequência de Shine-Dalgarno Anticódon do transportador inicial se move até achar o códon de iniciação (AUG) Possui sequência de Kozak aumenta eficiência da tradução Chegada da subunidade 50s ocorre após a ligação com o códon de iniciação requer gasto de +GTP Proteínas que se ligam na cauda poli A e cap ajuda a posicionar o ribossomo na ponta do RNA mensageiro = ajuda na iniciação A iniciação define a FASE DE LEITURA Como ribossomo lê a sequência Fase de leitura Alongamento 1. Chegada de RNAt carregado com aminoácido que vai interagir com o códon 2. Sítio A tem chegada de tRNA sítio P transfere a cadeia polipeptídica que possui e saí pelo sítio E através do movimento 3. Sempre pareamento do códon do mRNA com o anticódon do tRNA Em procariotos Fatores associados 1. Entrada do tRNA dentro do ribossomo precisa do fator de alongamento (EF-Tu = carrega GTP para dar energia para ligação) 2. Entrada de tRNA+EF-Tu+GTP no sítio A 3. Ligação do tRNA com aminoácido no sítio P 4. Ribossomo anda deixando o sítio A vazio 5. Ligação com tRNA e aminoácido no sítio P 6. Entra tRNA e aminoácido no sítio A e sai tRNA vazio pelo sítio E Só entra tRNA centro no ribossomo? Não, pode entrar qualquer um, mas só o que tiver o anticódon pareado com o códon que vai ocorre a síntese Terminação Códon de parada interage com fator de liberação que entra no ribossomo para interagir Complexo é desestabilizado Fator de liberação liga-se ao stop códon e hidrolisa a ligação que prende a cadeia polipeptídica ao tRNA no sítio P Em procariotos = fator RF-1 (UAA e UAG) ou RF-2 (UGA e UAA) e também tem o RF-3 e GTP para fazer a liberação de energia Em eucariotos = eRF-1 (UUA, UAG, UAA) + eRF-2 (GTP) Poliribossomos Séries de ribossomos associados ao rna mensageiro Procariotos e eucariotos Direcionamento de polipeptídios para locais específicos Mitocôndrias, aos cloroplastos, interior do núcleo Genes de RNAs não codificantes Genes que não viram proteínas ou que não são codificantes Complexo silenciador induzido pelo RNA (RISC) Genes Mitocondriais Transcrito como uma molécula de RNA contínua, que posteriormente é processada e separada entre suas unidades: genes codificadores de proteínas, RNAs ribossomais e RNAs transportadores. Pré-rna mitocondrial é processado Tem adição de cauda poli A e cap Diferenças dos códons = gera produtos diferentes do que o genoma do núcleo UGA no núcleo é de parada, na mitocôndria é seguinte na tradução
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