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22/09/2021 BCM 2 Victória Zuppo Universidade Nove de Julho REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA ✓ Espacial: diferentes tipos celulares em um mesmo organismo, determinam a forma celular. ✓ Temporal: genes diferentes expressos em tempos diferentes em resposta a sinais biológicos ou estímulos ambientais. ✓ Diferentes tipos de células num mesmo organismo diferem dramaticamente entre si. ✓ Todas as células contêm as mesmas informações depositadas no genoma. ✓ Principal ponto de controle que guia o desenvolvimento de eucariotos multicelulares. ✓ A expressão de uma proteína pode ser: o Constitutiva: Constantemente expressa o Induzida: Expressa quando necessária NÍVEIS REG. EXPRESSÃO GÊNICA ✓ Regulação Transcricional o Aspectos funcionais da cromatina o Metilação do DNA o Acetilação/Desacetilação de histonas o Proteínas regulatórias ✓ Regulação Pós-Transcricional o "Splicing" alternativo o Regulação da estabilidade do RNAm ✓ Regulação Traducional o MicroRNA o RNA de interferência ✓ Regulação Pós-Traducional o Clivagem o Modificações químicas - Fosforilação o Conformação proteica tridimensional o Controle da estabilidade da proteína REGULAÇÃO TRANSCRICIONAL ✓ Eventos antes da transcrição (ocorre no DNA) ✓ Principal nível em que a expressão dos genes pode ser regulada - mais econômico, pois, se o gene não for transcrito, nenhum dos passos posteriores ocorrerá. ✓ A regulação da transcrição pode ocorrer através de processos distintos: o Remodelamento da cromatina ▪ Acetilação e Desacetilação de Histonas ▪ Metilação do DNA o Ligação de proteínas regulatórias ✓ Cromatina: DNA + proteínas (histonas) ✓ Alterações na cromatina implicaria no grau de compactação do DNA e consequentemente definiria se uma determinada região do DNA seria expressa ou não. Controle da Expressão Gênica 22/09/2021 BCM 2 Victória Zuppo Universidade Nove de Julho ASPECTOS FUNCIONAIS CROMATINA ✓ O DNA de eucariotos está associado a proteínas chamadas histonas, formando nucleossomos. ✓ O nível de condensação das diferentes regiões dos cromossomos pode ser controlado - regiões que estarão disponíveis para a transcrição em determinado tecido ou estágio de desenvolvimento, do organismo. ✓ A célula controla a disponibilidade de tais regiões através de mecanismos de remodelamento da cromatina. REMODELAMENTO DA CROMATINA ✓ Mecanismos através dos quais a célula controla os níveis de condensação do cromossomo. ✓ Adição, ou remoção, de radicais à molécula de DNA ou às proteínas histonas a ele associadas. ✓ Dentre essas modificações, destacam-se os processos de metilação do DNA, acetilação e desacetilação das histonas. ACETILAÇÃO E DESACETILAÇÃO DE HISTONAS ✓ As proteínas histonas centrais do nucleossomo (H2A, H2B, H3 e H4) possuem longas caudas amino- terminais que se estendem para fora da estrutura; ✓ Tais caudas são o principal alvo para as modificações químicas já citadas; ✓ Essas modificações nas proteínas histonas afetam o acesso de proteínas reguladoras e complexos proteicos à cromatina e, dessa forma, influenciam a expressão gênica. ✓ A acetilação das histonas contribuem para a ativação da transcrição. ✓ Histona acetiltransferase (HAT) é a enzima capaz de adicionar grupos acetil. ✓ Histonas desacetilases (HDAC) faz remoção dos grupos acetil 1. Reduz a afinidade da Histona pelo DNA - afrouxa o nucleossomo; 2. Recrutamento de outros componentes da maquinaria de transcrição; 3. Iniciação da remodelagem da cromatina. METILAÇÃO DE DNA ✓ Metilação de DNA: Modificação química que se observa pela ligação de um grupo metil ao carbono 5 da citosina em ilhas CpGs. ✓ Ilha de CpG: região do genoma com pelo menos 200pb que contém mais de 50% de CpGs. ✓ Localizadas em promotores e ou primeiros éxons de genes ativos. ✓ Genes Ativos: DNA desmetilado, histonas acetiladas, eucromatina. ✓ Genes Inativos: DNA metilado, histonas desacetiladas, heterocromatina. PROTEÍNAS REGULATÓRIAS ✓ Transcrição: RNA polimerase II é a responsável pela produção dos RNA mensageiros e se acopla às regiões promotoras dos genes (Caixa TATA e Caixa CAAT) com o auxílio de vários fatores de transcrição. ✓ A partir de então, tem início a fase de elongação da transcrição. ✓ O complexo da RNA pol II (incluindo os fatores de transcrição) não é capaz de reconhecer e se acoplar ao promotor de um dado gene sem a ajuda das proteínas reguladoras. 22/09/2021 BCM 2 Victória Zuppo Universidade Nove de Julho ✓ Além da região promotora existem outras regiões que influenciam na regulação da expressão de cada gene. ✓ Tais regiões são denominadas “intensificadores ou Enhancer” (correspondem a sítios de ligação de proteínas regulatórias). ENHANCERS ✓ Enhancers são sequências intensificadoras nos eucariotos superiores. ✓ A localização do enhancer é a montante do gene. ✓ Quando proteínas reguladoras estão ligadas nestas sequências adicionais, aumentam a transcrição dos promotores próximos. SPLICING ALTERNATIVO ✓ A retirada de íntrons e a emenda dos éxons compõem um passo crucial do processamento do RNA em eucariotos. ✓ As células utilizam o processamento do RNA como uma importante forma de regulação da expressão gênica. ✓ "Splicing” Alternativo: União, consiste em selecionar os éxons que serão emendados e rearranjados para compor o RNAm final. ✓ Permite, que diferentes proteínas sejam produzidas a partir de um mesmo gene, elevando o potencial de codificação de seus genomas, aumento da variabilidade proteica. ESTABILIDADE DO RNAm ✓ Transcrição: Acúmulo do RNAm correspondente no citoplasma da célula, disponibilidade para a tradução. ✓ RNAms possuem “vida útil”, precisam ser degradados senão a quantidade no citoplasma seria muito alta (inviável o funcionamento celular). ✓ Controle da estabilidade do RNAm de um dado gene é um importante mecanismo de regulação de sua expressão. ✓ O principal processo de degradação do RNAm, é iniciado pela remoção da cauda poliA e é denominado desadenilação. ✓ Em seguida ao processo de desadenilação, ocorre a remoção do capacete presente na extremidade 5’ do RNAm, realizada por um conjunto de proteínas e fatores. ✓ Após a retirada das estruturas de proteção o transcrito é rapidamente degradado por enzimas denominadas exonucleases. REGULAÇÃO TRADUCIONAL ✓ RNAm no citoplasma = processo de tradução também pode ser regulado. ✓ Regulação mediada por pequenos RNAs. ✓ Pareamento de uma sequência curta de RNA com uma sequência alvo de um RNAm. ✓ Mecanismo de repressão da expressão gênica: o Inibição da tradução do RNAm o Degradação do RNAm ✓ MicroRNA: A partir do próprio genoma (endógeno) ✓ SiRNA: Originados de genomas exógenos: virais, transposons ou sintetizados em laboratórios. Complexo Transcricional 22/09/2021 BCM 2 Victória Zuppo Universidade Nove de Julho MicroRNAs ✓ Pequenos RNAs não codificantes que funcionam como reguladores traducionais da expressão gênica. ✓ 22 nucleotídeos ✓ Incapazes de codificar proteínas. ✓ Regulam a expressão de 30 até 60% dos RNAs codificantes em humanos. miRNA Associação mIR-375 Secreção de insulina mIR-14 Metabolismo de adipócitos mIR-143 Diferenciação de adipócitos mIR-15/mIR-16 Frequentemente deletados ou inibidos em leucemia linfocítica crônica e adenomas hipofisários mIR-143/mIR-145 Diminuídos em câncer colorretal e linhagem celular do câncer linfóide, mama, próstata e colo uterino Let-7 Inibição da diferenciação e proliferação celular, diminuído em câncer de pulmão. mIR-155 Aumentado em linfomas e câncer de mama. mIR-221/-222/-146 Aumentado em câncer de tireóide. mIR-21 Fator anti-apoptótico, aumentado em glioblastoma e câncer de mama. mIR-17-92 Aumentadoem linfomas e carcinoma de pulmão. REGULAÇÃO PÓS TRADUCIONAL ✓ Modificações de uma cadeia proteica depois de sua tradução. ✓ Alterações promovidas nas propriedades da proteína: o Clivagem Proteolítica: algumas proteínas devem ser clivadas proteoliticamente (cortadas) para se tornarem ativas (Insulina usada pelos diabéticos) o Modificações Químicas: Fosforilação, algumas proteínas são ativadas pela fosforilação, enquanto outras são desativadas. o Conformação proteica tridimensional. o Controle da estabilidade proteica. REGULAÇÃO DO ENDEREÇAMENTO DE PROTEIÍNAS ✓ Para obter sua forma biologicamente ativa, o polipeptídio deve se dobrar em sua conformação tridimensional própria, o que é chamado enovelamento. ✓ Processamento: Ocorre de acordo com o destino dessas proteínas (interior ou o exterior da célula) no qual elas desempenharão suas funções. CHAPERONAS ✓ É possível que uma proteína não consiga desempenhar suas funções por erro no enovelamento. ✓ Chaperonas: Complexo proteico que utiliza a energia da hidrólise de ATP para desnovelar proteínas, possibilitando novo enovelamento, dessa vez, na forma correta ou no lugar correto. ✓ Encaminham à destruição, caso não seja possível a configuração correta. CONTROLE ESTABILIDADE PROTEÍNAS ✓ O final do processo de tradução e o momento da degradação de um polipeptídio define a “longevidade” dessa molécula no citoplasma. ✓ Mecanismos regulados de degradação de proteínas: “vias de degradação ubiquitina proteassomo”. UBIQUITINAÇÃO ✓ As proteínas podem ser marcadas para degradação pela adição de um marcador químico chamado ubiquitina. ✓ Os complexos ubiquitina/proteína são submetidos à degradação pelo proteassomo 26S 22/09/2021 BCM 2 Victória Zuppo Universidade Nove de Julho DOENÇAS QUESTÕES 1. Cite um método de regulação gênica pós- transcricional em eucariotos. Splicing alternativo para formar diferentes RNAm a partir de um transcrito. 2. Qualquer atividade reguladora de genes que não envolve mudanças na sequência do DNA (código genético), tais como os processos de acetilação de histonas, metilação de DNA e inibição da traduçao por microRNAs são considerados: Epigenético 3. No processo de transcrição, os fatores de transcrição se acoplam às regiões promotoras dos genes juntamente com a RNA polimerase II. O complexo da RNA pol II (incluindo os fatores de transcrição) não é capaz de reconhecer e se acoplar ao promotor de um dado gene sem a ajuda das proteínas regulatórias. O que pode-se dizer sobre proteínas regulatórias ligadas ao enhancer? Quando proteínas regulatórias estão ligadas nas sequencias intensificadoras (Enhancer), ativam a transcrição dos promotores próximos. 4. No Câncer, um gene supressor de tumor que participa da regulação do ciclo celular, como o gene p53, pode ser INATIVADO, impossibilitando a parada do ciclo celular para possível correção do DNA ou envio da célula para a apoptose. O que pode-se dizer sobre a metilação do DNA deste gene (p53) nas neoplasias? A região promotora deste gene está metilada, expressão gênica inativada. 5. Um dos principais eventos da célula, se caracteriza pela expressão gênica, onde ocorre a síntese de proteinas, que após se tornar ativa, terá o seu papel no metabolismo celular. Qual a sequência correta dos processos relacionados com síntese proteíca? DNA (gene) - Transcrição (RNAm) e Tradução (Proteína) 6. A expressão gênica pode ser regulada em muitas das etapas. Se as diferenças entre os vários tipos celulares dependem dos genes expressos pela célula, em qual nível o controle da expressão gênica é exercido? Pelos controles: transcricional, pós- transcricional, traducional e pós-traducional. 7. Uma célula do fígado e uma célula da pele possuem o mesmo genoma, mas desempenham funções diferentes. Como isso é possível? Diferentes genes são ativados na célula do fígado e na célula da pele, apesar de apresentarem o mesmo genoma. 8. Após a tradução, muitos polipeptídios precisam passar por um processamento que lhes confira a estrutura necessária ao desempenho de sua função biológica. Esse processo é denominado Regulação Pós-Traducional. Explique o processo que ocorre após a tradução. O processo de regulação pós-traducional envolve a clivagem de regiões da proteína, o enovelamento correto e a adição de modificações químicas e estruturais. 9. Atrofia espinhal progressiva (AEP), também conhecida como amiotrofia espinhal, é uma doença neurodegenerativa de origem genética, cuja fisiopatologia subjacente é a morte de neurônios motores na medula espinhal, causando um quadro de paralisia progressiva. Sabe-se que o principal mecanismo molecular que desencadeia a morte de neurônios motores em pacientes com AEP é um defeito de Splicing alternativo no gene SMN1. Quais as principais características do Splicing alternativo? Aumento da variabilidade proteica, Processo da Regulação Pós-Transcricional, Retirada de introns e rearranjo de éxons. 10. Paciente sexo masculino, 54 anos, pardo, professor, ensino superior completo. Refere alteração na marcha há cerca de 3 anos. O quadro foi precedido de perda gradual de destreza em ambas as mãos, em função do tremor ao tentar realizar atividades manuais finas. Evoluiu com lentificação dos movimentos e dificuldade na marcha. Após avaliação neurológica, foi diagnosticado, com Doença de Parkinson. Qual nível de regulação, da expressão gênica e processos estão envolvidos na formação dos Corpúsculos de Lewy (acúmulo de agregados proteicos) responsáveis pelas alterações neurológicas na Doença de Parkinson? Regulação Pós- Traducional – Falha no processo de Ubiquitinação, devido a uma mutação do gene PRKN – Proteína Parkina. 11. O splicing consiste na retirada dos íntrons de um RNA precursor, de forma a produzir um mRNA maduro funcional. Essa excisão dos íntrons do mRNA é um evento muito importante e requer uma 22/09/2021 BCM 2 Victória Zuppo Universidade Nove de Julho extrema precisão das enzimas envolvidas no processo. Qual a característica destas enzimas? São compostas por um complexo snRNA/Proteinas 12. Após a tradução, muitos polipeptídeos precisam passar por um processamento que lhes confira a estrutura necessária ao desempenho de sua função biológica. Este nível de regulação envolve os processos de enovelamento e desnovelamento de proteínas mal dobradas, que é realizado pelas (a)_____________, e a adição de modificações químicas, como por exemplo, um grupo fosfato, que é denominada (b)_____________. a)Chaperonas b)Fosforilação 13. Qual o nível de regulação da expressão gênica está relacionado com o acúmulo de proteínas, formando os agregados tóxicos no Alzheimer? O nível de regulação da expressão gênica relacionado ao acúmulo de proteínas é pós-traducional, ocorre a clivagem da cadeia de proteínas.
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