A propriedade físico-química de uma molécula é importante na farmacocinética dos fármacos, pois afeta a absorção e distribuição no organismo. A ionização do fármaco influencia sua absorção no trato gastrointestinal, sendo que quanto menor o grau de ionização, maior a absorção. A lipofilicidade também é relevante, pois fármacos mais lipofílicos são melhor absorvidos no intestino. A fórmula do grau de ionização dos fármacos no estômago (pH = 1) é: %αa = 100 - [100 / (1 + antilog(pH - pKa))] %αb = 100 - [100 / (1 + antilog(pKa - pH))] Lembrando que o valor do grau de ionização pode variar dependendo do pKa do fármaco.
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