Explicar a metilação do DNA e seus efeitos na transcrição de genes e na estrutura da cromatina; Descrever os mecanismos de reparo do DNA, incluindo...

A metilação do DNA é um processo epigenético que envolve a adição de grupos metil ao DNA. Essa modificação química pode afetar a transcrição de genes e a estrutura da cromatina. Quando o DNA está metilado, a transcrição dos genes pode ser inibida, pois a metilação pode bloquear a ligação de fatores de transcrição às regiões promotoras dos genes. Além disso, a metilação do DNA pode alterar a estrutura da cromatina, tornando-a mais compacta e dificultando o acesso dos fatores de transcrição ao DNA. Os mecanismos de reparo do DNA são essenciais para corrigir erros e danos no material genético. Existem diferentes mecanismos de reparo, incluindo a revisão, o reparo por mau pareamento e o reparo de danos. A revisão é um mecanismo de reparo que ocorre durante a replicação do DNA, onde enzimas especializadas verificam se houve erros de pareamento entre as bases nitrogenadas e corrigem esses erros. O reparo por mau pareamento ocorre quando ocorre um erro de pareamento durante a replicação do DNA e enzimas especializadas corrigem esse erro. O reparo de danos é um mecanismo que corrige danos no DNA causados por agentes externos, como radiação ultravioleta ou produtos químicos mutagênicos. Para desenhar primers e calcular o Tm (temperatura de fusão) dos mesmos para uma reação de PCR, é necessário levar em consideração a sequência de nucleotídeos desejada e as condições de reação, como concentração de íons e pH. Existem várias fórmulas e programas de computador disponíveis para calcular o Tm dos primers. Uma sequência palindrômica é uma sequência de nucleotídeos que pode ser lida da mesma maneira nos dois sentidos. Por exemplo, a sequência "AGCT" é palindrômica, pois pode ser lida tanto da esquerda para a direita quanto da direita para a esquerda. O sequenciamento de DNA por terminação de cadeia é um método utilizado para determinar a sequência de nucleotídeos em um fragmento de DNA. Nesse método, são utilizados nucleotídeos modificados que terminam a síntese da cadeia de DNA quando incorporados. Cada nucleotídeo modificado é marcado com uma cor diferente, permitindo a identificação da base adicionada em cada etapa da síntese. Um mapa de restrição simples é uma representação gráfica da localização dos sítios de restrição em um fragmento de DNA. Os sítios de restrição são sequências específicas de nucleotídeos reconhecidas por enzimas de restrição, que cortam o DNA em locais específicos. O mapa de restrição mostra a posição desses sítios de restrição ao longo do fragmento de DNA.