Imagine a seguinte situação: você possui sequências de dois genes (A e B) das espécies Bothrops jararaca (jararaca), Chironius fuscus (cobra-cipó)...

Para comparar filogeneticamente essas espécies de serpentes, você pode seguir os seguintes passos: 1. Coletar sequências de outros genes das mesmas espécies de serpentes, além dos genes A e B mencionados. 2. Realizar o alinhamento das sequências de cada gene individualmente, utilizando um software apropriado. 3. Identificar os sítios variáveis em cada gene, como você já fez para o gene A. 4. Utilizar métodos de análise filogenética, como a construção de árvores filogenéticas, para comparar as sequências dos diferentes genes e inferir as relações evolutivas entre as espécies. 5. Avaliar a congruência dos resultados obtidos para diferentes genes, a fim de verificar se as árvores filogenéticas construídas são consistentes entre si. 6. Considerar também outras informações, como características morfológicas e geográficas das espécies, para complementar a análise filogenética. Esses são apenas alguns passos básicos que você pode seguir para comparar filogeneticamente as espécies de serpentes mencionadas. Vale ressaltar que a análise filogenética é uma área complexa e existem diferentes métodos e abordagens que podem ser utilizados, dependendo do objetivo da pesquisa.