Na técnica de FISH (hibridização in situ fluorescente), são utilizadas lâminas simples onde as células são adicionadas para marcação dos cromossomos. As células marcadas são visualizadas no microscópio e na tela do notebook. Já na técnica de CGH array (genômica comparativa de array), são utilizadas lâminas específicas que possuem um painel de genes específicos. Essas lâminas são utilizadas para identificar sequências diretamente dispostas sobre a lâmina. O material é visualizado em um scanner array, que é um equipamento específico capaz de detectar a marcação no painel de genes, e também pode ser visualizado no notebook. A principal diferença na visualização dos resultados entre as técnicas é que o FISH permite visualizar os cromossomos marcados individualmente, enquanto o CGH array permite identificar sequências específicas de genes presentes na amostra de DNA pura do paciente.
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