O melhor protocolo para investigação de suspeita do vírus da hepatite C é o seguinte: I. Realizar a pesquisa de anticorpo por ELISA e, caso o resultado seja reagente, confirmar por meio do Western blotting. II. Caso o resultado do ELISA seja não reagente, mas a suspeita persista, realizar a pesquisa de antígenos pela biologia molecular. III. Realizar a pesquisa de antígeno pela biologia molecular e, se positivo, confirmar no ELISA. Dessa forma, é possível obter uma avaliação mais precisa e confirmatória da presença do vírus da hepatite C.
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