A bioquímica pode ser aplicada nos processos de tratamento de água por meio da utilização de enzimas, como as lipases, que atuam na redução da concentração de lipídios presentes nos efluentes. Essas enzimas catalisam a hidrólise de ligações éster-carboxílicas presentes em acilgliceróis, o que ajuda a reduzir a carga orgânica presente na água. Dessa forma, a bioquímica pode ser uma ferramenta importante para o pré-tratamento de águas provenientes de indústrias agroindustriais e domésticas, contribuindo para a redução da poluição e para a preservação do meio ambiente.
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