As sinapses químicas ocorrem na fenda sináptica entre a membrana pré-sináptica do axônio de um neurônio e a membrana pós-sináptica do dendrito do outro neurônio. Os neurotransmissores são liberados das vesículas sinápticas para a fenda, e vão em direção aos receptores adequados na membrana pós-sináptica, e assim o estímulo é transmitido de neurônio a neurônio. Uma vantagem dessa sinapse é que o neurônio pode regular a quantidade de neurotransmissores que serão liberados dependendo da necessidade, sua desvantagem é que ela é unidirecional. As sinapses elétricas não precisam de fenda sináptica, pois nessa sinapse os neurônios têm conexões diretas que são as junções gap. Sua vantagem é a velocidade que é superior à sinapse química, além disso, são bidirecionais. Sua desvantagem é que ela não pode transformar um sinal excitatório de um neurônio em um sinal inibitório em outro.
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