Os resíduos de aminoácidos Arg145 e Glu270 da carboxipeptidase são responsáveis por formar ligações covalentes com os substratos das reações em que atuam. Apesar de estarem distantes um do outro na sequência peptídica, eles conseguem catalisar a reação graças à formação da estrutura tridimensional da enzima. O enovelamento da enzima e os mecanismos químicos dos aminoácidos permitem uma aproximação desses resíduos, localizados no sítio ativo das enzimas, de forma que ambos se ligam ao substrato e permitem que a reação aconteça.
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