A coleta do EPF (Exame Parasitológico de Fezes) deve ser realizada em um recipiente limpo, seco e sem líquido conservante. A amostra deve ser coletada em partes, início, meio e fim do bolo fecal. Se houver presença de pus, muco ou sangue, este pedaço da amostra deve ser colocado no frasco para análise, assim como se houver presença de parasita visivelmente, deve ser coletado, informando o profissional da presença do mesmo na hora da entrega ao laboratório. É importante identificar o frasco com o nome completo do paciente. A amostra deve ser encaminhada ao laboratório em até 2 horas após a coleta, ou pode ser armazenada na geladeira por até 12 horas.
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