Se o experimento de Rutherford fosse realizado com átomos que tivessem a estrutura proposta pelo modelo de Thomson, poderíamos afirmar que as partículas alfas positivas atravessariam a lâmina de ouro com poucos desvios. Isso ocorreria porque, segundo o modelo de Thomson, o átomo seria uma esfera maciça e uniforme, sem regiões de carga concentrada. Portanto, as partículas alfas positivas passariam diretamente pela lâmina de ouro sem sofrer desvios significativos. No entanto, como sabemos, o experimento de Rutherford mostrou que a maioria das partículas alfas positivas passavam diretamente pela lâmina de ouro, mas algumas sofriam desvios significativos, o que levou à proposta do modelo atômico atual.
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