As rotas metabólicas que ocorrem em ambiente totalmente anaeróbico são a fermentação alcoólica (rota 1) e a fermentação láctica (rota 2). Os grupos de organismos que realizam a fermentação alcoólica (rota 1) são leveduras e alguns tipos de bactérias. Já a fermentação láctica (rota 2) é realizada por bactérias lácticas. Dois produtos da indústria alimentícia fabricados a partir da fermentação alcoólica são o pão e a cerveja. Já a fermentação láctica é utilizada na produção de iogurtes e queijos.
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