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O NEMA teve como objetivo produzir informações relevantes sobre as características ecológicas da região, o que possibilitou promover medidas conservacionistas mais eficientes. Os dados obtidos pelas ações de resgate, e coleta de espécimes, assim como pelo monitoramento ambiental fomentaram toda a ciência que embasaram os projetos e as ações adotados nos programas. Como resultados das ações, foram formulados 38 programas ambientais, conforme o Ministério de Integração, como por exemplo:
A Programa de Monitoramento da Cunha Salina
B Programa Paraná Biodiversidade
C Certificação e Rotulagem Ambiental
D Programa de Corredores Verdes
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