O NEMA teve como objetivo produzir informações relevantes sobre as características ecológicas da região, o que possibilitou promover medidas conservacionistas mais eficientes. Os dados obtidos pelas ações de resgate, e coleta de espécimes, assim como pelo monitoramento ambiental fomentaram toda a ciência que embasaram os projetos e as ações adotados nos programas.  Como resultados das ações, foram formulados 38 programas ambientais, conforme o Ministério de Integração, como por exemplo:

A Programa de Monitoramento da Cunha Salina

B Programa Paraná Biodiversidade

C Certificação e Rotulagem Ambiental

D Programa de Corredores Verdes