A seleção negativa é um processo crucial na maturação dos linfócitos T no timo, onde células T imaturas (timócitos) que reconhecem fortemente antígenos próprios são eliminadas. Isso ajuda a prevenir respostas autoimunes, garantindo que os linfócitos T que saem do timo sejam tolerantes aos antígenos do próprio organismo. Durante esse processo, os timócitos interagem com células epiteliais do timo que apresentam antígenos próprios por meio de moléculas do complexo principal de histocompatibilidade (MHC). Se um timócito se liga de forma muito forte a esses antígenos, ele é induzido à apoptose, contribuindo assim para a tolerância central.