As células eucarióticas são, de fato, mais complexas que as procarióticas, pois possuem várias organelas, como o núcleo, mitocôndrias, retículo endoplasmático, complexo de Golgi e lisossomos. Na fagocitose, que é o processo de "englobar" partículas, as células eucarióticas utilizam lisossomos para digerir o material ingerido. O complexo de Golgi também desempenha um papel importante na modificação e no transporte de proteínas e lipídios, que podem ser essenciais para a resposta celular durante a fagocitose. Portanto, a presença dessas organelas permite que as células eucarióticas realizem processos mais complexos e eficientes em comparação com as procarióticas.