Vamos analisar cada uma das afirmações sobre o sistema acusatório: I. Separação de funções de acusar e julgar. Verdadeiro, essa é uma característica fundamental do sistema acusatório, onde as funções de acusação e julgamento são exercidas por órgãos distintos. II. Contraditório na atividade das partes. Verdadeiro, o sistema acusatório garante o contraditório, permitindo que as partes se manifestem e participem ativamente do processo. III. Publicidade dos atos processuais, como regra. Verdadeiro, a publicidade é uma característica do sistema acusatório, assegurando que os atos processuais sejam acessíveis ao público. IV. Poderes investigatórios iniciais do juiz. Falso, no sistema acusatório, o juiz não possui poderes investigatórios iniciais, pois a investigação é conduzida pela acusação e pela polícia, mantendo a imparcialidade do juiz. V. Liberdade probatória. Verdadeiro, o sistema acusatório permite a liberdade probatória, onde as partes podem apresentar as provas que considerarem pertinentes. Com base na análise, as afirmações corretas são I, II, III e V. Portanto, a alternativa correta é: D) I, II, III, V.