A gliconeogênese é a biossíntese da nova glicose (ou seja, não a glicose do glicogênio). Este processo é frequentemente referido como produção de glicose endógena (EGP). A produção de glicose a partir de outros esqueletos de carbono é necessária, pois os testículos, eritrócitos e medula renal utilizam exclusivamente glicose para produção de ATP. O cérebro também utiliza grandes quantidades da glicose diária consumida ou produzida através da gliconeogênese.
No entanto, além da glicose, o cérebro pode derivar energia de corpos cetônicos que são convertidos em acetil-CoA e desviados para o ciclo TCA.. Os esqueletos de carbono primários utilizados para a gliconeogênese são derivados do piruvato, lactato, glicerol e dos aminoácidos alanina e glutamina. O fígado é o principal local de gliconeogênese, no entanto, como discutido abaixo, o rim e o intestino delgado também têm papéis importantes a desempenhar nessa via.
Além disso, as enzimas glioxilato malato sintase e isocitrato liase foram encontradas em tecidos animais. Genes que codificam o gene da malato sintase foram identificados em outros [metazoários] incluindo artrópodes, equinodermos e até mesmo alguns vertebrados. Os mamíferos que possuem esses genes incluem monotremados (ornitorrincos) e marsupiais (gambás), mas não mamíferos placentários. Genes para isocitrato liase são encontrados apenas em nematóides, nos quais, é aparente, eles se originaram na transferência horizontal de genes de bactérias.
A existência de ciclos de glioxilato em humanos não foi estabelecida, e é amplamente aceito que os ácidos graxos não podem ser convertidos diretamente em glicose em seres humanos.
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