Suponha que, em uma dada proteína, uma lisina é substituída por um ácido aspártico. Essa mudança ocorre na estrutura primária ou secundária? Como

A mudança ocorre a nível primário. Toda mudança de aminoácidos acontecerá a nível primário, visto que eles formam os primeiros peptídeos e estes arranjos são pelo modo covalente. Agora, dependo da natureza do aminoácido, tendencialmente, as outras estruturas - que dependem da estrutura primária - irão também se modificar. A lisina é um aminoácido polar, extremamente hidrofílico, logo exibe características específicas. Já o Aspártico também é soluvel em água. Contudo, a uma diferença nos radicais deles dois. Se você pegar uma imagem comparativa das moléculas, verá que a lisina apresenta um grupo R com uma extremidade amina livre, já o aspártico apresenta, na extremidade do grupamento R um Ácido Carboxilíco, o que confere outras características a este aminoácidos. Além disto, as moléculas diferem em tamanho, massa molecular e pH, portanto, em condições iguais, apresentaram caracteristicas diferentes e, por consequência, a estrutura secundária também seria mudada, visto que apresentam características dispersas. Se a secundária é mudada - por exemplo, beta-conformação ou alfa-hélice - a terceária é e a quartenária pode nem vir a existir. Resumindo....

Se você trocar os aminoácidos de uma cadeia primária, tendencialmente, a cadeira secundária apresenta uma conformação dispersa da original.

Abraço!