Por que Escrevemos Com Letras Diferentes Palavras Que são Pronunciadas Com Os Mesmos sons?

Escrevemos com letras diferentes palavras que são pronunciadas com os mesmos sons porque o que determina a grafia é a origem da palavra.

Então, por exemplo, se a palavra deriva do latim e originalmente foi grafada com "s", essa letra permanece em todas as palavras derivadas.

Há também casos de palavras com sons idênticos mas que apresentam grafias deferentes para determinar o sentido da palavra. 

É caso das palavras homônimas, como "sessão", "seção" e "ceção".

Veja o significado de cada uma:

sessão = reunião; tempo de duração de um espetáculo, como teatro e cinema ("A sessão de cinema começa às 8 da noite")

seção = divisão, repartição, departamento de uma loja ("A seção de brinquedos fica no segundo andar")

ceção = nome da ação de ceder, de doar algo; doação ("O empresário fez uma cessão de cestas básicas à comunidade")

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As palavras que fazem esse tipo de pronunciamento e de escrita são identificadas como homônimas, ou seja, com a escrita de uma forma - como consequência são atribuídos significados diferentes para as palavras - ainda que a sua escrita seja de forma diferente em conjunto com a mesma pronúncia de palavras.