Como fica a classificação das baratas e cupins, já que estás pertenciam a ordens diferentes e agora ambas pertencem a ordem das blattodea?

As baratas, blattodea, continuam sua vida e classificação a nível de ordem como se nada tivesse acontecido. 

Os cupins, isoptera, que antigamente eram uma ordem separada, sofrem uma pequena alteração, sendo agora denominados como subordem. Só isso mesmo. Os cupins entraram na família das baratas, mas a única mudança é essa :)

Quando for publicar artigos, lembre-se de colocar que seu indivíduo pertence à ordem blattodea, subordem isoptera.